55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0483 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0483  hypothetical protein  100 
 
 		 259 aa  489  1e-137  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1127  hypothetical protein  51.32 
 
 		 252 aa  171  1e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0148  hypothetical protein  39.49 
 
 		 251 aa  67.4  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.692112  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4260  hypothetical protein  36.59 
 
 		 193 aa  60.5  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3520  hypothetical protein  30.87 
 
 		 263 aa  57.8  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0732  hypothetical protein  31.79 
 
 		 211 aa  57  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1343  hypothetical protein  34.21 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.747417 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12821  hypothetical protein  28.65 
 
 		 236 aa  55.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0049  protein of unknown function DUF218  31.88 
 
 		 185 aa  53.5  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.291592  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1763  hypothetical protein  40.74 
 
 		 252 aa  53.9  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.478051 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1023  hypothetical protein  32.47 
 
 		 258 aa  53.1  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.14835  normal  0.458616 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1055  hypothetical protein  31.82 
 
 		 258 aa  52.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.102955 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1104  hypothetical protein  31.82 
 
 		 258 aa  51.6  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0147337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1088  hypothetical protein  31.82 
 
 		 258 aa  51.6  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.213248  normal  0.252564 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0996  hypothetical protein  31.17 
 
 		 258 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.490044  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1020  protein of unknown function DUF218  26.88 
 
 		 242 aa  51.2  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03633  hypothetical protein  31.69 
 
 		 205 aa  50.4  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2405  hypothetical protein  30.9 
 
 		 259 aa  49.7  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000200717  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00931  hypothetical protein  29.51 
 
 		 259 aa  49.7  0.00005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0659639  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1080  hypothetical protein  29.51 
 
 		 259 aa  49.7  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00727998  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2723  protein of unknown function DUF218  29.51 
 
 		 259 aa  49.7  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00143107  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3832  protein of unknown function DUF218  32.17 
 
 		 210 aa  49.7  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2970  protein of unknown function DUF218  42.42 
 
 		 211 aa  49.7  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.606259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2201  hypothetical protein  29.51 
 
 		 259 aa  49.7  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000670511  normal  0.151519 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00924  conserved inner membrane protein  29.51 
 
 		 259 aa  49.7  0.00005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0692012  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2676  hypothetical protein  29.51 
 
 		 259 aa  49.7  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000584627  normal  0.41839 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1027  hypothetical protein  29.51 
 
 		 259 aa  49.7  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000464041  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1017  hypothetical protein  29.51 
 
 		 259 aa  49.7  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000186844  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0886  hypothetical protein  23.04 
 
 		 236 aa  48.1  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.351499  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1708  hypothetical protein  34.33 
 
 		 190 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.100199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1732  protein of unknown function DUF218  35 
 
 		 250 aa  47  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000709574  normal  0.252079 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0820  hypothetical protein  31.21 
 
 		 182 aa  47  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0924  hypothetical protein  31.21 
 
 		 182 aa  47  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2303  hypothetical protein  30.06 
 
 		 258 aa  47.4  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.682762  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1775  hypothetical protein  32.71 
 
 		 282 aa  46.6  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0452  transmembrane protein  34.67 
 
 		 251 aa  46.2  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0249922  normal  0.582839 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2313  hypothetical protein  28.38 
 
 		 251 aa  46.2  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2202  hypothetical protein  33.33 
 
 		 259 aa  46.2  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0441  protein of unknown function DUF218  28.57 
 
 		 265 aa  45.4  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0399  hypothetical protein  29.17 
 
 		 263 aa  45.4  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.30478 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2047  hypothetical protein  31.07 
 
 		 282 aa  44.7  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0454  protein of unknown function DUF218  28.57 
 
 		 265 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1277  hypothetical protein  32.02 
 
 		 245 aa  45.4  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.995866 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1673  protein of unknown function DUF218  31.43 
 
 		 209 aa  44.3  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2596  hypothetical protein  33.7 
 
 		 250 aa  44.3  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0452  protein of unknown function DUF218  27.14 
 
 		 260 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3208  protein of unknown function DUF218  28.29 
 
 		 196 aa  44.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000349402  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0692  hypothetical protein  31.79 
 
 		 229 aa  43.5  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0213382  normal  0.759811 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0556  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  31.96 
 
 		 310 aa  43.5  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1968  hypothetical protein  32.35 
 
 		 265 aa  43.1  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.308793 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0668  hypothetical protein  29.86 
 
 		 255 aa  43.1  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0491  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  30.91 
 
 		 310 aa  42.7  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1216  protein of unknown function DUF218  30.65 
 
 		 196 aa  42.7  0.006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000413314  decreased coverage  0.000114911 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1439  hypothetical protein  30.9 
 
 		 259 aa  42.4  0.007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.270449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0763  hypothetical protein  32.17 
 
 		 182 aa  42.4  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0353997 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>