26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0692 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0692  hypothetical protein  100 
 
 
229 aa  467  1.0000000000000001e-131  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0213382  normal  0.759811 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0485  hypothetical protein  32.7 
 
 
225 aa  68.6  0.00000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3653  hypothetical protein  31.87 
 
 
191 aa  65.1  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1343  hypothetical protein  31.61 
 
 
213 aa  55.5  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.747417 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0732  hypothetical protein  27.15 
 
 
211 aa  53.9  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1593  hypothetical protein  29.3 
 
 
208 aa  53.1  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.434005 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2970  protein of unknown function DUF218  28.26 
 
 
211 aa  50.4  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.606259  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0467  hypothetical protein  27.94 
 
 
264 aa  50.8  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1127  hypothetical protein  28.57 
 
 
252 aa  50.1  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0578  hypothetical protein  29.19 
 
 
241 aa  47.4  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0844  hypothetical protein  25.45 
 
 
219 aa  46.6  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.527132  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4260  hypothetical protein  29.48 
 
 
193 aa  46.6  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2322  hypothetical protein  28.05 
 
 
200 aa  45.8  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000278714  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0986  hypothetical protein  28.97 
 
 
302 aa  45.4  0.0008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2846  hypothetical protein  27.4 
 
 
280 aa  45.1  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0483  hypothetical protein  31.79 
 
 
259 aa  44.3  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2396  hypothetical protein  28.75 
 
 
198 aa  43.5  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000041288  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2745  protein of unknown function DUF218  20.77 
 
 
230 aa  43.5  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2281  protein of unknown function DUF218  29.41 
 
 
198 aa  42.4  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00040439  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3867  protein of unknown function DUF218  27.62 
 
 
238 aa  42.7  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.420451  normal  0.0728404 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1178  hypothetical protein  24.6 
 
 
221 aa  42.4  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.665154 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0669  hypothetical protein  28.92 
 
 
238 aa  42.4  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.126167  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2545  hypothetical protein  30.4 
 
 
232 aa  42  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0924  hypothetical protein  27.89 
 
 
182 aa  42  0.008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0820  hypothetical protein  27.89 
 
 
182 aa  42  0.008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5216  protein of unknown function DUF218  27 
 
 
241 aa  41.6  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.496773  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>