57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0485 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0485  hypothetical protein  100 
 
 		 225 aa  457  9.999999999999999e-129  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3653  hypothetical protein  78.42 
 
 		 191 aa  293  2e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2970  protein of unknown function DUF218  32.51 
 
 		 211 aa  70.5  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.606259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0692  hypothetical protein  32.7 
 
 		 229 aa  68.2  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0213382  normal  0.759811 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3378  hypothetical protein  32.76 
 
 		 206 aa  65.5  0.0000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.620452  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1489  hypothetical protein  27.62 
 
 		 235 aa  65.1  0.0000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000603911  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1216  protein of unknown function DUF218  28.5 
 
 		 196 aa  62.4  0.000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000413314  decreased coverage  0.000114911 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0467  hypothetical protein  28.8 
 
 		 264 aa  61.2  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4260  hypothetical protein  32.53 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03633  hypothetical protein  35.26 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2846  hypothetical protein  28.77 
 
 		 280 aa  57.4  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0148  hypothetical protein  31.97 
 
 		 251 aa  56.6  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.692112  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0844  hypothetical protein  28.41 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.527132  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1003  hypothetical protein  29.29 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.117242 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1343  hypothetical protein  32.32 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.747417 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0732  hypothetical protein  29.94 
 
 		 211 aa  54.7  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3832  protein of unknown function DUF218  33.11 
 
 		 210 aa  54.7  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0953  protein of unknown function DUF218  27.06 
 
 		 197 aa  53.5  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.954298  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0426  Bme2 protein  31.65 
 
 		 205 aa  52.8  0.000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0911545  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0369  Bme2 protein  33.07 
 
 		 205 aa  52.8  0.000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16316  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1378  protein of unknown function DUF218  29.17 
 
 		 196 aa  52.4  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.2531  hitchhiker  0.00903728 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2745  protein of unknown function DUF218  24.64 
 
 		 230 aa  52  0.000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2339  protein of unknown function DUF218  32.64 
 
 		 190 aa  49.3  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.196018 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2281  protein of unknown function DUF218  28.99 
 
 		 198 aa  48.9  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00040439  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1349  protein of unknown function DUF218  26.15 
 
 		 196 aa  47.8  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1684  protein of unknown function DUF218  25 
 
 		 195 aa  48.1  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1152  protein of unknown function DUF218  32.32 
 
 		 245 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.104953  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1256  hypothetical protein  34.9 
 
 		 195 aa  47.8  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.202454  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2193  hypothetical protein  31.21 
 
 		 245 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.123189  normal  0.691165 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3157  hypothetical protein  25.61 
 
 		 199 aa  47.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000253328  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2729  protein of unknown function DUF218  34.86 
 
 		 192 aa  46.2  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00326918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13720  hypothetical protein  38.39 
 
 		 210 aa  46.2  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.195466 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4029  hypothetical protein  27.49 
 
 		 246 aa  46.2  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0049  protein of unknown function DUF218  27.17 
 
 		 185 aa  45.4  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.291592  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2396  hypothetical protein  24.44 
 
 		 198 aa  45.4  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000041288  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3513  hypothetical protein  23.24 
 
 		 225 aa  45.1  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0820  hypothetical protein  29.85 
 
 		 182 aa  45.1  0.0009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0924  hypothetical protein  29.85 
 
 		 182 aa  45.1  0.0009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3208  protein of unknown function DUF218  26.16 
 
 		 196 aa  44.7  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000349402  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2273  protein of unknown function DUF218  26.09 
 
 		 188 aa  44.3  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0864  hypothetical protein  31.11 
 
 		 315 aa  43.5  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.898014  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3127  hypothetical protein  26.71 
 
 		 210 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.226539  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1593  hypothetical protein  28.64 
 
 		 208 aa  44.3  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.434005 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2819  hypothetical protein  29.45 
 
 		 210 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1691  hypothetical protein  31.9 
 
 		 204 aa  43.1  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0187033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3516  hypothetical protein  23.2 
 
 		 225 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3129  hypothetical protein  29.45 
 
 		 210 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00135729  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3110  hypothetical protein  26.39 
 
 		 210 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2141  hypothetical protein  27.08 
 
 		 210 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2858  hypothetical protein  26.39 
 
 		 210 aa  42.7  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00183972  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2890  hypothetical protein  26.39 
 
 		 210 aa  42.7  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00431016  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3095  hypothetical protein  26.39 
 
 		 210 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.937684  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3106  hypothetical protein  26.39 
 
 		 210 aa  42.7  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866641  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3524  hypothetical protein  21.98 
 
 		 225 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3867  protein of unknown function DUF218  25.79 
 
 		 238 aa  42  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.420451  normal  0.0728404 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0483  hypothetical protein  33.61 
 
 		 259 aa  42  0.008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1127  hypothetical protein  31.4 
 
 		 252 aa  41.6  0.01  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>