56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2193 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_2193  hypothetical protein  100 
 
 		 245 aa  490  9.999999999999999e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.123189  normal  0.691165 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1152  protein of unknown function DUF218  82.86 
 
 		 245 aa  411  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.104953  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2982  hypothetical protein  75.22 
 
 		 258 aa  337  8e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.216517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3091  protein of unknown function DUF218  65.78 
 
 		 234 aa  295  6e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.322539  normal  0.57374 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2865  hypothetical protein  65.33 
 
 		 283 aa  285  5e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2985  protein of unknown function DUF218  72.22 
 
 		 234 aa  267  1e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.208738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4865  hypothetical protein  47.06 
 
 		 240 aa  189  5e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.765936  normal  0.236297 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0578  hypothetical protein  49.74 
 
 		 241 aa  180  2e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0945  hypothetical protein  43.67 
 
 		 241 aa  179  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.238786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1178  hypothetical protein  47.64 
 
 		 221 aa  178  7e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.665154 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5216  protein of unknown function DUF218  46.67 
 
 		 241 aa  178  7e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.496773  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0669  hypothetical protein  48.62 
 
 		 238 aa  176  3e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.126167  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0020  hypothetical protein  47.52 
 
 		 300 aa  168  7e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.275341  normal  0.580582 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0836  hypothetical protein  48.54 
 
 		 240 aa  166  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.891978  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2545  hypothetical protein  45.5 
 
 		 232 aa  157  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4029  hypothetical protein  45.26 
 
 		 246 aa  153  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1593  hypothetical protein  43.59 
 
 		 208 aa  152  2.9999999999999998e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.434005 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3574  protein of unknown function DUF218  42.86 
 
 		 238 aa  148  9e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0583825 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3867  protein of unknown function DUF218  41.14 
 
 		 238 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.420451  normal  0.0728404 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3089  hypothetical protein  39.81 
 
 		 218 aa  142  6e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.99224  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3219  hypothetical protein  45.83 
 
 		 207 aa  137  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.175029  normal  0.346292 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0986  hypothetical protein  43.18 
 
 		 302 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1995  hypothetical protein  40.91 
 
 		 212 aa  133  3e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.368022  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1921  hypothetical protein  40.91 
 
 		 300 aa  133  3e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3256  hypothetical protein  39.11 
 
 		 226 aa  118  9e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.143218  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0699  hypothetical protein  37.89 
 
 		 182 aa  100  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.514208  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0098  hypothetical protein  36.31 
 
 		 202 aa  100  3e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2376  hypothetical protein  32.84 
 
 		 195 aa  95.1  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0665662 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3082  hypothetical protein  35.29 
 
 		 218 aa  89.7  4e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000038787  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3208  protein of unknown function DUF218  31.87 
 
 		 196 aa  89.7  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000349402  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1055  protein of unknown function DUF218  29.89 
 
 		 195 aa  87.8  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000273108 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2396  hypothetical protein  34.42 
 
 		 198 aa  87  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000041288  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2322  hypothetical protein  32.61 
 
 		 200 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000278714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3070  protein of unknown function DUF218  38.71 
 
 		 213 aa  83.6  0.000000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00556969  normal  0.0219592 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2281  protein of unknown function DUF218  32.43 
 
 		 198 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00040439  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3011  hypothetical protein  34.34 
 
 		 177 aa  79.7  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3157  hypothetical protein  30.77 
 
 		 199 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000253328  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2890  hypothetical protein  34.29 
 
 		 176 aa  72.8  0.000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.743347  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2233  hypothetical protein  29.78 
 
 		 199 aa  72.8  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0295734  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0467  hypothetical protein  30.85 
 
 		 264 aa  68.9  0.00000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1003  hypothetical protein  28.18 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.117242 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1020  protein of unknown function DUF218  26.88 
 
 		 242 aa  58.2  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2970  protein of unknown function DUF218  31.44 
 
 		 211 aa  52.8  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.606259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1216  protein of unknown function DUF218  30.37 
 
 		 196 aa  50.8  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000413314  decreased coverage  0.000114911 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3832  protein of unknown function DUF218  27.45 
 
 		 210 aa  50.1  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0485  hypothetical protein  31.71 
 
 		 225 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0732  hypothetical protein  27.04 
 
 		 211 aa  47.4  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1489  hypothetical protein  24.43 
 
 		 235 aa  45.4  0.0008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000603911  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1763  hypothetical protein  33.02 
 
 		 252 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.478051 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0148  hypothetical protein  28.37 
 
 		 251 aa  44.7  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.692112  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0049  protein of unknown function DUF218  28.37 
 
 		 185 aa  44.7  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.291592  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1349  protein of unknown function DUF218  23.78 
 
 		 196 aa  43.5  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1708  hypothetical protein  30.16 
 
 		 190 aa  43.1  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.100199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2597  hypothetical protein  28.24 
 
 		 207 aa  42.7  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0549  protein of unknown function DUF218  28.18 
 
 		 262 aa  42.4  0.007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3453  hypothetical protein  52.78 
 
 		 262 aa  42  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>