47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0945 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0945  hypothetical protein  100 
 
 		 241 aa  486  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.238786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5216  protein of unknown function DUF218  77.59 
 
 		 241 aa  380  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.496773  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4865  hypothetical protein  76.35 
 
 		 240 aa  374  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.765936  normal  0.236297 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0836  hypothetical protein  77.08 
 
 		 240 aa  352  2.9999999999999997e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.891978  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1178  hypothetical protein  73.64 
 
 		 221 aa  334  7.999999999999999e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.665154 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0669  hypothetical protein  79.27 
 
 		 238 aa  319  1.9999999999999998e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.126167  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0578  hypothetical protein  75.48 
 
 		 241 aa  315  4e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3091  protein of unknown function DUF218  43.91 
 
 		 234 aa  180  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.322539  normal  0.57374 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0020  hypothetical protein  46.77 
 
 		 300 aa  176  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.275341  normal  0.580582 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1152  protein of unknown function DUF218  42.11 
 
 		 245 aa  172  5e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.104953  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2865  hypothetical protein  43.48 
 
 		 283 aa  170  2e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1995  hypothetical protein  43.98 
 
 		 212 aa  163  2.0000000000000002e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.368022  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2982  hypothetical protein  40.77 
 
 		 258 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.216517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1921  hypothetical protein  42.93 
 
 		 300 aa  162  3e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2193  hypothetical protein  43 
 
 		 245 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.123189  normal  0.691165 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0986  hypothetical protein  43.09 
 
 		 302 aa  161  9e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2985  protein of unknown function DUF218  47.51 
 
 		 234 aa  160  1e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.208738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3574  protein of unknown function DUF218  45.3 
 
 		 238 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0583825 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1593  hypothetical protein  45.03 
 
 		 208 aa  154  9e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.434005 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3089  hypothetical protein  43.43 
 
 		 218 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.99224  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3867  protein of unknown function DUF218  39.15 
 
 		 238 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.420451  normal  0.0728404 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2545  hypothetical protein  43.27 
 
 		 232 aa  148  9e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4029  hypothetical protein  39.38 
 
 		 246 aa  137  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3219  hypothetical protein  39.27 
 
 		 207 aa  134  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.175029  normal  0.346292 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2376  hypothetical protein  40.11 
 
 		 195 aa  127  2.0000000000000002e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0665662 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3256  hypothetical protein  36.1 
 
 		 226 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.143218  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0098  hypothetical protein  35.57 
 
 		 202 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0699  hypothetical protein  37.14 
 
 		 182 aa  100  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.514208  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3082  hypothetical protein  37.99 
 
 		 218 aa  98.2  9e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000038787  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3070  protein of unknown function DUF218  39.88 
 
 		 213 aa  95.9  5e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00556969  normal  0.0219592 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3011  hypothetical protein  36.97 
 
 		 177 aa  89.7  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2396  hypothetical protein  37.01 
 
 		 198 aa  86.3  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000041288  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2890  hypothetical protein  36.42 
 
 		 176 aa  86.3  4e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.743347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2281  protein of unknown function DUF218  37.5 
 
 		 198 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00040439  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1055  protein of unknown function DUF218  29.61 
 
 		 195 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000273108 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3208  protein of unknown function DUF218  28.78 
 
 		 196 aa  78.6  0.00000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000349402  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2233  hypothetical protein  30.51 
 
 		 199 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0295734  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3157  hypothetical protein  30.77 
 
 		 199 aa  69.3  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000253328  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2322  hypothetical protein  31.47 
 
 		 200 aa  67  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000278714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0467  hypothetical protein  31.4 
 
 		 264 aa  61.6  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2970  protein of unknown function DUF218  30.1 
 
 		 211 aa  48.1  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.606259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1020  protein of unknown function DUF218  28.79 
 
 		 242 aa  46.6  0.0004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1489  hypothetical protein  27.93 
 
 		 235 aa  43.9  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000603911  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1684  protein of unknown function DUF218  24.2 
 
 		 195 aa  43.1  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0844  hypothetical protein  21.11 
 
 		 219 aa  42.7  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.527132  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1708  hypothetical protein  29.6 
 
 		 190 aa  42.4  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.100199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1976  protein of unknown function DUF218  26.24 
 
 		 199 aa  42  0.008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.05946  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>