47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2865 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_2865  hypothetical protein  100 
 
 
283 aa  568  1e-161  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3091  protein of unknown function DUF218  98.72 
 
 
234 aa  463  1e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.322539  normal  0.57374 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2985  protein of unknown function DUF218  88.46 
 
 
234 aa  392  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.208738  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2982  hypothetical protein  60.47 
 
 
258 aa  298  8e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.216517  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1152  protein of unknown function DUF218  66.96 
 
 
245 aa  291  8e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.104953  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2193  hypothetical protein  67.84 
 
 
245 aa  277  1e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.123189  normal  0.691165 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0945  hypothetical protein  43.48 
 
 
241 aa  178  9e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.238786  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5216  protein of unknown function DUF218  43.05 
 
 
241 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.496773  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4865  hypothetical protein  42.36 
 
 
240 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.765936  normal  0.236297 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0020  hypothetical protein  45.77 
 
 
300 aa  166  2.9999999999999998e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.275341  normal  0.580582 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0578  hypothetical protein  46.56 
 
 
241 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1178  hypothetical protein  45.03 
 
 
221 aa  160  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.665154 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0669  hypothetical protein  46.11 
 
 
238 aa  159  4e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.126167  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0836  hypothetical protein  46.73 
 
 
240 aa  159  5e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.891978  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4029  hypothetical protein  46 
 
 
246 aa  157  3e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2545  hypothetical protein  43.78 
 
 
232 aa  151  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3574  protein of unknown function DUF218  42.46 
 
 
238 aa  149  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0583825 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3867  protein of unknown function DUF218  40.29 
 
 
238 aa  149  7e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.420451  normal  0.0728404 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1593  hypothetical protein  41.67 
 
 
208 aa  146  3e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.434005 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3219  hypothetical protein  42.39 
 
 
207 aa  142  6e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.175029  normal  0.346292 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3089  hypothetical protein  38.65 
 
 
218 aa  142  7e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.99224  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0986  hypothetical protein  39.47 
 
 
302 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1921  hypothetical protein  40 
 
 
300 aa  139  3.9999999999999997e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1995  hypothetical protein  40 
 
 
212 aa  139  6e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.368022  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0098  hypothetical protein  35.79 
 
 
202 aa  113  3e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3256  hypothetical protein  38.42 
 
 
226 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.143218  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2376  hypothetical protein  33.85 
 
 
195 aa  102  5e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0665662 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3082  hypothetical protein  36.53 
 
 
218 aa  90.1  4e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000038787  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3208  protein of unknown function DUF218  28.79 
 
 
196 aa  86.3  6e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000349402  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1055  protein of unknown function DUF218  30.05 
 
 
195 aa  85.5  8e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000273108 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3070  protein of unknown function DUF218  37.5 
 
 
213 aa  84  0.000000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00556969  normal  0.0219592 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0699  hypothetical protein  34.9 
 
 
182 aa  81.6  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.514208  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3011  hypothetical protein  33.33 
 
 
177 aa  82  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2281  protein of unknown function DUF218  30 
 
 
198 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00040439  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2396  hypothetical protein  31.03 
 
 
198 aa  75.5  0.0000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000041288  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2233  hypothetical protein  29.28 
 
 
199 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0295734  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3157  hypothetical protein  28.71 
 
 
199 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000253328  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2322  hypothetical protein  29.41 
 
 
200 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000278714  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2890  hypothetical protein  32.2 
 
 
176 aa  65.5  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.743347  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0467  hypothetical protein  28.5 
 
 
264 aa  62  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1020  protein of unknown function DUF218  29.01 
 
 
242 aa  55.8  0.0000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0755  protein of unknown function DUF218  29.17 
 
 
264 aa  47  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000325401 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1258  hypothetical protein  28.81 
 
 
268 aa  47.4  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2846  hypothetical protein  25.82 
 
 
280 aa  43.5  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1177  hypothetical protein  28.21 
 
 
268 aa  43.1  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00488097  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2970  protein of unknown function DUF218  28.28 
 
 
211 aa  42.4  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.606259  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1136  hypothetical protein  28.21 
 
 
268 aa  42.4  0.009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000241931  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>