41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3011 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3011  hypothetical protein  100 
 
 		 177 aa  352  2e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0699  hypothetical protein  50.9 
 
 		 182 aa  171  3.9999999999999995e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.514208  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2890  hypothetical protein  54.82 
 
 		 176 aa  162  2.0000000000000002e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.743347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0098  hypothetical protein  39.39 
 
 		 202 aa  103  1e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1593  hypothetical protein  39.29 
 
 		 208 aa  102  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.434005 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3219  hypothetical protein  40.77 
 
 		 207 aa  102  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.175029  normal  0.346292 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2545  hypothetical protein  40.74 
 
 		 232 aa  99.4  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0020  hypothetical protein  37.13 
 
 		 300 aa  98.2  5e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.275341  normal  0.580582 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3089  hypothetical protein  41.84 
 
 		 218 aa  98.2  6e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.99224  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3867  protein of unknown function DUF218  37.24 
 
 		 238 aa  95.5  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.420451  normal  0.0728404 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3574  protein of unknown function DUF218  38.81 
 
 		 238 aa  95.1  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0583825 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5216  protein of unknown function DUF218  37.08 
 
 		 241 aa  93.2  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.496773  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0945  hypothetical protein  35.75 
 
 		 241 aa  90.9  9e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.238786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4865  hypothetical protein  35.58 
 
 		 240 aa  90.5  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.765936  normal  0.236297 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1178  hypothetical protein  36.81 
 
 		 221 aa  90.5  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.665154 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4029  hypothetical protein  36.36 
 
 		 246 aa  89.7  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0578  hypothetical protein  34.27 
 
 		 241 aa  89  3e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0986  hypothetical protein  36.72 
 
 		 302 aa  89  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0669  hypothetical protein  35.29 
 
 		 238 aa  88.6  5e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.126167  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1995  hypothetical protein  34.07 
 
 		 212 aa  85.5  3e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.368022  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0836  hypothetical protein  38.36 
 
 		 240 aa  85.1  5e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.891978  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1921  hypothetical protein  34.07 
 
 		 300 aa  84  9e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3091  protein of unknown function DUF218  34.46 
 
 		 234 aa  83.2  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.322539  normal  0.57374 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2982  hypothetical protein  33.33 
 
 		 258 aa  82.4  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.216517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3256  hypothetical protein  36.13 
 
 		 226 aa  82  0.000000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.143218  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2865  hypothetical protein  33.33 
 
 		 283 aa  81.6  0.000000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1152  protein of unknown function DUF218  33.71 
 
 		 245 aa  80.5  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.104953  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2985  protein of unknown function DUF218  40.52 
 
 		 234 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.208738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2322  hypothetical protein  37.66 
 
 		 200 aa  78.6  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000278714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2193  hypothetical protein  35.86 
 
 		 245 aa  77.8  0.00000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.123189  normal  0.691165 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1055  protein of unknown function DUF218  38.52 
 
 		 195 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000273108 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3082  hypothetical protein  39.86 
 
 		 218 aa  76.6  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000038787  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3208  protein of unknown function DUF218  33.77 
 
 		 196 aa  75.1  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000349402  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2376  hypothetical protein  33.12 
 
 		 195 aa  74.3  0.0000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0665662 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3070  protein of unknown function DUF218  31.82 
 
 		 213 aa  67.4  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00556969  normal  0.0219592 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3157  hypothetical protein  32.47 
 
 		 199 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000253328  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2233  hypothetical protein  32.26 
 
 		 199 aa  62.8  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0295734  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2281  protein of unknown function DUF218  36.36 
 
 		 198 aa  62  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00040439  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2396  hypothetical protein  37.19 
 
 		 198 aa  61.2  0.000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000041288  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1489  hypothetical protein  26.43 
 
 		 235 aa  43.1  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000603911  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1003  hypothetical protein  32 
 
 		 196 aa  43.1  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.117242 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>