59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1152 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1152  protein of unknown function DUF218  100 
 
 		 245 aa  495  1e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.104953  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2193  hypothetical protein  82.86 
 
 		 245 aa  397  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.123189  normal  0.691165 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2982  hypothetical protein  70.61 
 
 		 258 aa  328  3e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.216517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3091  protein of unknown function DUF218  67.4 
 
 		 234 aa  293  2e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.322539  normal  0.57374 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2865  hypothetical protein  70.5 
 
 		 283 aa  288  7e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2985  protein of unknown function DUF218  68.21 
 
 		 234 aa  271  9e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.208738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0578  hypothetical protein  51.31 
 
 		 241 aa  188  5.999999999999999e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4865  hypothetical protein  47.03 
 
 		 240 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.765936  normal  0.236297 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0020  hypothetical protein  50.51 
 
 		 300 aa  181  9.000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.275341  normal  0.580582 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0669  hypothetical protein  49.72 
 
 		 238 aa  179  4e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.126167  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5216  protein of unknown function DUF218  46.84 
 
 		 241 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.496773  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1178  hypothetical protein  46.32 
 
 		 221 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.665154 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0945  hypothetical protein  42.11 
 
 		 241 aa  172  5e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.238786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0836  hypothetical protein  46.57 
 
 		 240 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.891978  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1593  hypothetical protein  45.36 
 
 		 208 aa  152  5e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.434005 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2545  hypothetical protein  43.39 
 
 		 232 aa  150  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4029  hypothetical protein  43.56 
 
 		 246 aa  148  7e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3574  protein of unknown function DUF218  43.41 
 
 		 238 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0583825 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0986  hypothetical protein  45.76 
 
 		 302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3867  protein of unknown function DUF218  41.12 
 
 		 238 aa  142  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.420451  normal  0.0728404 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3089  hypothetical protein  42.68 
 
 		 218 aa  139  4.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.99224  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1921  hypothetical protein  42.37 
 
 		 300 aa  139  6e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1995  hypothetical protein  42.37 
 
 		 212 aa  138  7e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.368022  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3219  hypothetical protein  43.18 
 
 		 207 aa  137  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.175029  normal  0.346292 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3256  hypothetical protein  38.93 
 
 		 226 aa  110  3e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.143218  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0098  hypothetical protein  36.31 
 
 		 202 aa  103  3e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0699  hypothetical protein  36.36 
 
 		 182 aa  97.4  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.514208  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2376  hypothetical protein  31.35 
 
 		 195 aa  92.8  5e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0665662 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3208  protein of unknown function DUF218  30.65 
 
 		 196 aa  90.5  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000349402  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3070  protein of unknown function DUF218  37.56 
 
 		 213 aa  89  6e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00556969  normal  0.0219592 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1055  protein of unknown function DUF218  29.65 
 
 		 195 aa  87.8  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000273108 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2281  protein of unknown function DUF218  32.37 
 
 		 198 aa  87  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00040439  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3082  hypothetical protein  36.78 
 
 		 218 aa  85.9  5e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000038787  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2322  hypothetical protein  33.77 
 
 		 200 aa  85.1  8e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000278714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2396  hypothetical protein  34.23 
 
 		 198 aa  84.3  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000041288  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3011  hypothetical protein  34.32 
 
 		 177 aa  80.5  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3157  hypothetical protein  31.33 
 
 		 199 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000253328  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2233  hypothetical protein  31.33 
 
 		 199 aa  77  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0295734  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2890  hypothetical protein  34.48 
 
 		 176 aa  72.4  0.000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.743347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0467  hypothetical protein  29.63 
 
 		 264 aa  63.9  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1003  hypothetical protein  29.17 
 
 		 196 aa  64.3  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.117242 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2970  protein of unknown function DUF218  30.43 
 
 		 211 aa  61.2  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.606259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0844  hypothetical protein  23.12 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.527132  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1020  protein of unknown function DUF218  24.87 
 
 		 242 aa  54.3  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0732  hypothetical protein  28 
 
 		 211 aa  54.3  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1489  hypothetical protein  24.88 
 
 		 235 aa  52.4  0.000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000603911  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3832  protein of unknown function DUF218  27.45 
 
 		 210 aa  51.6  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1378  protein of unknown function DUF218  25.29 
 
 		 196 aa  49.3  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.2531  hitchhiker  0.00903728 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0485  hypothetical protein  32.52 
 
 		 225 aa  47  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1216  protein of unknown function DUF218  25.67 
 
 		 196 aa  47  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000413314  decreased coverage  0.000114911 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1349  protein of unknown function DUF218  22.11 
 
 		 196 aa  46.6  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03633  hypothetical protein  27.63 
 
 		 205 aa  45.4  0.0008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1763  hypothetical protein  33.65 
 
 		 252 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.478051 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3453  hypothetical protein  29.6 
 
 		 262 aa  44.3  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1976  protein of unknown function DUF218  27.15 
 
 		 199 aa  43.9  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.05946  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1258  hypothetical protein  29.41 
 
 		 268 aa  43.1  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2389  hypothetical protein  27.69 
 
 		 191 aa  42.7  0.006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0755  protein of unknown function DUF218  27.13 
 
 		 264 aa  42.4  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000325401 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1684  protein of unknown function DUF218  23.08 
 
 		 195 aa  42  0.009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>