86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1378 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1378  protein of unknown function DUF218  100 
 
 		 196 aa  403  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.2531  hitchhiker  0.00903728 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0953  protein of unknown function DUF218  62.24 
 
 		 197 aa  267  7e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.954298  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1349  protein of unknown function DUF218  60.71 
 
 		 196 aa  264  5e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0844  hypothetical protein  60.2 
 
 		 219 aa  260  8e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.527132  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1216  protein of unknown function DUF218  59.69 
 
 		 196 aa  259  2e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000413314  decreased coverage  0.000114911 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1003  hypothetical protein  55.1 
 
 		 196 aa  240  1e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.117242 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1489  hypothetical protein  59.22 
 
 		 235 aa  234  5.0000000000000005e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000603911  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0467  hypothetical protein  29.05 
 
 		 264 aa  86.3  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1684  protein of unknown function DUF218  29.49 
 
 		 195 aa  65.5  0.0000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03633  hypothetical protein  31.9 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2846  hypothetical protein  28.71 
 
 		 280 aa  61.2  0.000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0924  hypothetical protein  34.19 
 
 		 182 aa  59.7  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0820  hypothetical protein  34.19 
 
 		 182 aa  59.7  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3653  hypothetical protein  28.93 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1340  protein of unknown function DUF218  26.74 
 
 		 208 aa  58.5  0.00000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3832  protein of unknown function DUF218  29.88 
 
 		 210 aa  58.2  0.00000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0732  hypothetical protein  28.57 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1343  hypothetical protein  28.65 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.747417 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1019  hypothetical protein  28.08 
 
 		 461 aa  56.2  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000506367  unclonable  0.00000000514024 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0643  hypothetical protein  29.22 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3208  protein of unknown function DUF218  24.23 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000349402  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2322  hypothetical protein  24.4 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000278714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2729  protein of unknown function DUF218  33.03 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00326918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1976  protein of unknown function DUF218  25.68 
 
 		 199 aa  55.1  0.0000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.05946  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2339  protein of unknown function DUF218  33.33 
 
 		 190 aa  54.3  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.196018 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1708  hypothetical protein  31.71 
 
 		 190 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.100199  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2970  protein of unknown function DUF218  27.61 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.606259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3157  hypothetical protein  24.62 
 
 		 199 aa  54.3  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000253328  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0105  putative secreted protein  24.87 
 
 		 249 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0103  hypothetical protein  25.4 
 
 		 237 aa  53.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.501432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3378  hypothetical protein  28.99 
 
 		 206 aa  53.1  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.620452  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2730  protein of unknown function DUF218  30.17 
 
 		 279 aa  52.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.111496 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4635  hypothetical protein  28.67 
 
 		 189 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.940029  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0485  hypothetical protein  29.17 
 
 		 225 aa  52  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2460  putative transmembrane protein  32.17 
 
 		 185 aa  51.6  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.919961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1673  protein of unknown function DUF218  24.28 
 
 		 209 aa  51.2  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2396  hypothetical protein  23.56 
 
 		 198 aa  51.2  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000041288  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4260  hypothetical protein  28.74 
 
 		 193 aa  50.1  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0369  Bme2 protein  28.21 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16316  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1152  protein of unknown function DUF218  24.61 
 
 		 245 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.104953  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2233  hypothetical protein  23.27 
 
 		 199 aa  49.7  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0295734  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0049  protein of unknown function DUF218  30.82 
 
 		 185 aa  49.3  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.291592  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1127  hypothetical protein  29.13 
 
 		 252 aa  49.3  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0426  Bme2 protein  28.21 
 
 		 205 aa  49.7  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0911545  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2597  hypothetical protein  25.97 
 
 		 207 aa  49.3  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0104  putative secreted protein  25.13 
 
 		 206 aa  49.3  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.900889  normal  0.196325 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1178  hypothetical protein  26.04 
 
 		 221 aa  48.5  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.665154 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1055  protein of unknown function DUF218  22.68 
 
 		 195 aa  48.5  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000273108 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0110  putative secreted protein  24.6 
 
 		 206 aa  48.1  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.741627 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0925  hypothetical protein  27.61 
 
 		 215 aa  47.8  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.816716  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4868  hypothetical protein  26 
 
 		 202 aa  47.4  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5216  protein of unknown function DUF218  26.2 
 
 		 241 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.496773  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2261  protein of unknown function DUF218  33.64 
 
 		 181 aa  46.6  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1689  hypothetical protein  30.3 
 
 		 176 aa  47  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.143634  normal  0.399616 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1277  hypothetical protein  26.24 
 
 		 245 aa  45.4  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.995866 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1302  hypothetical protein  26.79 
 
 		 215 aa  45.4  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0955164  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0864  hypothetical protein  33.06 
 
 		 315 aa  45.4  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.898014  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2281  protein of unknown function DUF218  22.35 
 
 		 198 aa  45.1  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00040439  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0148  hypothetical protein  29.27 
 
 		 251 aa  44.3  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.692112  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4865  hypothetical protein  24.74 
 
 		 240 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.765936  normal  0.236297 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1256  hypothetical protein  27.34 
 
 		 195 aa  43.1  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.202454  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3127  hypothetical protein  29.05 
 
 		 210 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.226539  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13720  hypothetical protein  26.55 
 
 		 210 aa  43.9  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.195466 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2819  hypothetical protein  29.05 
 
 		 210 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2273  protein of unknown function DUF218  29.1 
 
 		 188 aa  43.1  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0836  hypothetical protein  24.14 
 
 		 240 aa  43.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.891978  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3129  hypothetical protein  29.05 
 
 		 210 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00135729  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2141  hypothetical protein  29.05 
 
 		 210 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0625  protein of unknown function DUF218  32.33 
 
 		 248 aa  42.7  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0050402  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3110  hypothetical protein  29.05 
 
 		 210 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3095  hypothetical protein  29.05 
 
 		 210 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.937684  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2858  hypothetical protein  29.05 
 
 		 210 aa  42.4  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00183972  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2890  hypothetical protein  29.05 
 
 		 210 aa  42.4  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00431016  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3106  hypothetical protein  29.05 
 
 		 210 aa  42.4  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866641  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2313  hypothetical protein  27.85 
 
 		 251 aa  42  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01847  hypothetical protein  26.42 
 
 		 212 aa  41.6  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0399  hypothetical protein  25.17 
 
 		 263 aa  41.6  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.30478 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0376  protein of unknown function DUF218  28.83 
 
 		 188 aa  41.6  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2611  hypothetical protein  26.35 
 
 		 202 aa  41.6  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0237  hypothetical protein  25.93 
 
 		 210 aa  41.6  0.008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0945  hypothetical protein  21.43 
 
 		 241 aa  41.6  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.238786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2287  protein of unknown function DUF218  30.25 
 
 		 259 aa  41.2  0.009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2482  hypothetical protein  26.45 
 
 		 218 aa  41.2  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.341723 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2122  hypothetical protein  28.57 
 
 		 228 aa  41.2  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0673185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2446  hypothetical protein  30.07 
 
 		 206 aa  41.2  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2067  hypothetical protein  28.57 
 
 		 209 aa  41.2  0.01  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0351391  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>