53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5542 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5542  hypothetical protein  100 
 
 		 195 aa  400  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.286849 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1773  protein of unknown function DUF218  30.41 
 
 		 220 aa  77.4  0.0000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.185676  normal  0.489345 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3480  H+/gluconate symporter and related permease-like protein  31.49 
 
 		 187 aa  68.9  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.266773 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1711  protein of unknown function DUF218  27.05 
 
 		 232 aa  64.3  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.725568  hitchhiker  0.00117492 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0643  hypothetical protein  24.5 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1089  hypothetical protein  25.7 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00875904  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3306  hypothetical protein  21.74 
 
 		 189 aa  58.2  0.00000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0952  hypothetical protein  25.14 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0206967  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0832  hypothetical protein  33.07 
 
 		 251 aa  53.5  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000170655  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2482  hypothetical protein  33.33 
 
 		 218 aa  53.1  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.341723 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1451  hypothetical protein  30.19 
 
 		 257 aa  50.8  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00698749  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1256  hypothetical protein  31 
 
 		 257 aa  50.1  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000112269  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0237  hypothetical protein  26.87 
 
 		 210 aa  49.7  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3664  hypothetical protein  30.77 
 
 		 192 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.98369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1680  hypothetical protein  30.77 
 
 		 192 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0426  Bme2 protein  26.22 
 
 		 205 aa  48.5  0.00007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0911545  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1976  protein of unknown function DUF218  41.43 
 
 		 199 aa  48.1  0.00008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.05946  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3516  hypothetical protein  25.27 
 
 		 225 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0369  Bme2 protein  25.61 
 
 		 205 aa  47.4  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16316  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3912  protein of unknown function DUF218  28.26 
 
 		 222 aa  46.6  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265733  normal  0.345064 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3524  hypothetical protein  24.02 
 
 		 225 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1645  hypothetical protein  30.77 
 
 		 172 aa  46.2  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.840516  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1488  hypothetical protein  30.77 
 
 		 192 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1526  hypothetical protein  30.77 
 
 		 192 aa  45.8  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.107471  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1498  hypothetical protein  30.77 
 
 		 192 aa  45.8  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00465852  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1530  hypothetical protein  25.83 
 
 		 194 aa  45.8  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1788  hypothetical protein  30.77 
 
 		 159 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1711  hypothetical protein  30.77 
 
 		 192 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3513  hypothetical protein  23.46 
 
 		 225 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1734  hypothetical protein  30.77 
 
 		 192 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0564328  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2461  hypothetical protein  29.92 
 
 		 224 aa  45.4  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.921411  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1684  protein of unknown function DUF218  29.79 
 
 		 195 aa  45.1  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01847  hypothetical protein  31.45 
 
 		 212 aa  45.1  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02150  hypothetical protein  27.78 
 
 		 225 aa  45.1  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3269  hypothetical protein  24.18 
 
 		 251 aa  44.7  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.106822  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2112  hypothetical protein  28.49 
 
 		 211 aa  44.7  0.0009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.418722  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2028  hypothetical protein  28.49 
 
 		 226 aa  44.3  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.573264  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1763  hypothetical protein  44.26 
 
 		 252 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.478051 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1302  hypothetical protein  29.78 
 
 		 215 aa  43.5  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0955164  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1279  protein of unknown function DUF218  25 
 
 		 215 aa  43.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2313  hypothetical protein  28.57 
 
 		 251 aa  43.1  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1340  protein of unknown function DUF218  27.18 
 
 		 208 aa  42.7  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3559  hypothetical protein  23.63 
 
 		 225 aa  42.7  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0925  hypothetical protein  25.97 
 
 		 215 aa  42.7  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.816716  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3299  hypothetical protein  23.63 
 
 		 251 aa  42.7  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.23381  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0069  protein of unknown function DUF218  34.12 
 
 		 333 aa  42  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2141  protein of unknown function DUF218  33.73 
 
 		 346 aa  42.4  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00423736  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0951  hypothetical protein  28.75 
 
 		 271 aa  42  0.005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1772  hypothetical protein  30.95 
 
 		 262 aa  42  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.442971  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1272  protein of unknown function DUF218  28.41 
 
 		 212 aa  41.6  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0757  hypothetical protein  31.76 
 
 		 207 aa  41.6  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.482457  hitchhiker  0.00142809 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003835  hypothetical protein  29.03 
 
 		 212 aa  41.6  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0887084  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3378  hypothetical protein  25.93 
 
 		 206 aa  41.2  0.01  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.620452  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>