127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3306 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3306  hypothetical protein  100 
 
 		 189 aa  392  1e-108  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1089  hypothetical protein  39.79 
 
 		 199 aa  135  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00875904  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0952  hypothetical protein  39.27 
 
 		 199 aa  132  3e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0206967  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0467  hypothetical protein  30.52 
 
 		 264 aa  71.6  0.000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3378  hypothetical protein  28.3 
 
 		 206 aa  68.9  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.620452  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1773  protein of unknown function DUF218  32.31 
 
 		 220 aa  68.9  0.00000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.185676  normal  0.489345 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1302  hypothetical protein  28.79 
 
 		 215 aa  67.4  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0955164  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0426  Bme2 protein  26.63 
 
 		 205 aa  65.9  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0911545  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3912  protein of unknown function DUF218  30.16 
 
 		 222 aa  65.9  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265733  normal  0.345064 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0808  hypothetical protein  28.65 
 
 		 212 aa  65.1  0.0000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0369  Bme2 protein  26.04 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16316  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0925  hypothetical protein  27.74 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.816716  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3480  H+/gluconate symporter and related permease-like protein  25.43 
 
 		 187 aa  60.1  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.266773 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01847  hypothetical protein  26.87 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1763  hypothetical protein  27.74 
 
 		 252 aa  59.3  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.478051 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003221  hypothetical protein  27.65 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003183  hypothetical protein  27.65 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5542  hypothetical protein  21.74 
 
 		 195 aa  58.2  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.286849 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2461  hypothetical protein  28.23 
 
 		 224 aa  58.2  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.921411  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2482  hypothetical protein  29.69 
 
 		 218 aa  58.2  0.00000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.341723 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2028  hypothetical protein  31.5 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.573264  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1343  hypothetical protein  24.28 
 
 		 213 aa  57  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.747417 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0237  hypothetical protein  30.71 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2112  hypothetical protein  31.25 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.418722  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003835  hypothetical protein  24.81 
 
 		 212 aa  54.7  0.0000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0887084  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02150  hypothetical protein  36.62 
 
 		 225 aa  53.1  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3230  hypothetical protein  27.48 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.227113  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0951  hypothetical protein  27.07 
 
 		 271 aa  52.8  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37780  hypothetical protein  27.48 
 
 		 212 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000551578  normal  0.191816 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2685  hypothetical protein  28.96 
 
 		 251 aa  52.4  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0188872  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1451  hypothetical protein  29.79 
 
 		 257 aa  52  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00698749  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0643  hypothetical protein  31.3 
 
 		 192 aa  52  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2551  hypothetical protein  28.91 
 
 		 206 aa  52  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3516  hypothetical protein  26.71 
 
 		 225 aa  51.6  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3520  hypothetical protein  35.45 
 
 		 263 aa  51.2  0.000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0399  hypothetical protein  32.73 
 
 		 263 aa  50.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.30478 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3513  hypothetical protein  23.94 
 
 		 225 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1256  hypothetical protein  29.08 
 
 		 257 aa  50.1  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000112269  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1279  protein of unknown function DUF218  24.6 
 
 		 215 aa  49.3  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0629  hypothetical protein  31.25 
 
 		 253 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0550137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0452  protein of unknown function DUF218  29.53 
 
 		 260 aa  49.3  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2233  hypothetical protein  31.18 
 
 		 199 aa  49.3  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0295734  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0022  hypothetical protein  31.87 
 
 		 337 aa  48.9  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1753  hypothetical protein  31.91 
 
 		 240 aa  48.9  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245002  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3157  hypothetical protein  22.93 
 
 		 199 aa  48.9  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000253328  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2014  hypothetical protein  35.71 
 
 		 235 aa  49.3  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.82136  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3524  hypothetical protein  23.24 
 
 		 225 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1073  hypothetical protein  31.91 
 
 		 240 aa  48.9  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1908  hypothetical protein  31.91 
 
 		 240 aa  48.5  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.676098  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1516  hypothetical protein  31.91 
 
 		 240 aa  48.9  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.746081  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0183  hypothetical protein  31.91 
 
 		 240 aa  48.9  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00678491  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1731  hypothetical protein  31.91 
 
 		 240 aa  48.5  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.138234  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09020  hypothetical protein  31.31 
 
 		 253 aa  48.5  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1158  hypothetical protein  34.07 
 
 		 237 aa  48.1  0.00007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00819427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3269  hypothetical protein  23.21 
 
 		 251 aa  48.1  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.106822  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4955  hypothetical protein  32.04 
 
 		 259 aa  47.8  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.371656 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3299  hypothetical protein  23.21 
 
 		 251 aa  47.8  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.23381  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3213  group-specific protein  24.81 
 
 		 183 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3559  hypothetical protein  23.78 
 
 		 225 aa  47.4  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2596  hypothetical protein  27.93 
 
 		 250 aa  47.4  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3069  protein of unknown function DUF218  29.36 
 
 		 231 aa  47.4  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000320027 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1673  hypothetical protein  26.26 
 
 		 284 aa  47.8  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.255885 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1910  protein of unknown function DUF218  30.61 
 
 		 251 aa  47.4  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0244729 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2460  putative transmembrane protein  27.13 
 
 		 185 aa  46.6  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.919961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2322  hypothetical protein  26.09 
 
 		 200 aa  47  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000278714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01910  uncharacterized membrane protein  25.78 
 
 		 229 aa  47  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.850313  normal  0.329563 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2141  protein of unknown function DUF218  39.34 
 
 		 346 aa  46.6  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00423736  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4260  hypothetical protein  22.76 
 
 		 193 aa  46.6  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2729  protein of unknown function DUF218  26.61 
 
 		 192 aa  46.6  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00326918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3208  protein of unknown function DUF218  20.37 
 
 		 196 aa  47  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000349402  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2200  hypothetical protein  24.37 
 
 		 252 aa  45.8  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0454  protein of unknown function DUF218  32.74 
 
 		 265 aa  46.2  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2339  protein of unknown function DUF218  26.45 
 
 		 190 aa  46.2  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.196018 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3001  hypothetical protein  27.45 
 
 		 278 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.836994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3226  protein of unknown function DUF218  27.45 
 
 		 265 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.836956 
 
 
-
 
NC_004310  BR1177  hypothetical protein  34.52 
 
 		 268 aa  45.8  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00488097  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2573  hypothetical protein  27.35 
 
 		 301 aa  45.8  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0806  hypothetical protein  29.46 
 
 		 206 aa  45.8  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2008  hypothetical protein  28.44 
 
 		 213 aa  45.4  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.456188 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0732  hypothetical protein  23.56 
 
 		 211 aa  45.4  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2058  hypothetical protein  33.73 
 
 		 185 aa  45.1  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4400  hypothetical protein  31.78 
 
 		 273 aa  45.1  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.846693  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1839  hypothetical protein  41.18 
 
 		 373 aa  44.7  0.0007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.07336 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2382  hypothetical protein  29.27 
 
 		 322 aa  45.1  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2428  hypothetical protein  29.27 
 
 		 322 aa  45.1  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.445616  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1335  hypothetical protein  30.14 
 
 		 193 aa  45.1  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04767  hypothetical protein  34.4 
 
 		 365 aa  45.1  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1119  hypothetical protein  32.97 
 
 		 237 aa  44.7  0.0008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0242849  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1136  hypothetical protein  34.52 
 
 		 268 aa  44.7  0.0008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000241931  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4276  protein of unknown function DUF218  29.75 
 
 		 272 aa  44.7  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2313  hypothetical protein  33.33 
 
 		 251 aa  44.7  0.0009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3190  protein of unknown function DUF218  28.57 
 
 		 278 aa  44.7  0.0009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.463529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3239  protein of unknown function DUF218  29.09 
 
 		 336 aa  44.7  0.0009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0146  lipoprotein transmembrane  31.73 
 
 		 251 aa  44.3  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.207162  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2124  hypothetical protein  34.25 
 
 		 185 aa  43.9  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.564401  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2062  hypothetical protein  34.25 
 
 		 185 aa  43.9  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.59257  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2278  hypothetical protein  34.25 
 
 		 185 aa  43.9  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1217  hypothetical protein  30.84 
 
 		 219 aa  44.3  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0441  protein of unknown function DUF218  31.86 
 
 		 265 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2304  hypothetical protein  34.25 
 
 		 185 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.195603 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>