143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1272 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_1272  protein of unknown function DUF218  100 
 
 
212 aa  426  1e-118  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13720  hypothetical protein  59.89 
 
 
210 aa  217  1e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.195466 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0864  hypothetical protein  56.25 
 
 
315 aa  205  5e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.898014  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3216  protein of unknown function DUF218  53.48 
 
 
244 aa  197  7e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.101173  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0746  protein of unknown function DUF218  55.74 
 
 
370 aa  191  7e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.770006 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1277  hypothetical protein  46.63 
 
 
245 aa  180  1e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.995866 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1673  protein of unknown function DUF218  52.07 
 
 
209 aa  178  5.999999999999999e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2122  hypothetical protein  46.35 
 
 
228 aa  167  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0673185  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2611  hypothetical protein  37.57 
 
 
202 aa  117  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0376  protein of unknown function DUF218  33.33 
 
 
188 aa  114  7.999999999999999e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1930  protein of unknown function DUF218  45.56 
 
 
203 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000562665 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0110  putative secreted protein  34.2 
 
 
206 aa  108  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.741627 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0104  putative secreted protein  33.82 
 
 
206 aa  106  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.900889  normal  0.196325 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0103  hypothetical protein  33.82 
 
 
237 aa  105  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.501432  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0105  putative secreted protein  33.82 
 
 
249 aa  105  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0643  hypothetical protein  31.52 
 
 
192 aa  97.8  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2167  protein of unknown function DUF218  30.27 
 
 
194 aa  97.4  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000011898 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1691  hypothetical protein  40.29 
 
 
204 aa  95.9  4e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0187033  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4868  hypothetical protein  31.44 
 
 
202 aa  92.4  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2067  hypothetical protein  32.34 
 
 
209 aa  89  5e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0351391  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2882  hypothetical protein  30.96 
 
 
210 aa  87.8  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0452063  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3127  hypothetical protein  28.35 
 
 
210 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.226539  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1689  hypothetical protein  35.8 
 
 
176 aa  87  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.143634  normal  0.399616 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2819  hypothetical protein  28.35 
 
 
210 aa  86.3  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3129  hypothetical protein  28.35 
 
 
210 aa  86.3  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00135729  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2261  protein of unknown function DUF218  40.32 
 
 
181 aa  85.1  8e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1340  protein of unknown function DUF218  28.11 
 
 
208 aa  84.3  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4822  hypothetical protein  28.93 
 
 
215 aa  84  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.953087  normal  0.244929 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2890  hypothetical protein  28.57 
 
 
210 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00431016  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2858  hypothetical protein  28.57 
 
 
210 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00183972  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3106  hypothetical protein  28.57 
 
 
210 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866641  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3110  hypothetical protein  28.57 
 
 
210 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3095  hypothetical protein  28.57 
 
 
210 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.937684  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2141  hypothetical protein  28.57 
 
 
210 aa  81.6  0.000000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1684  protein of unknown function DUF218  27.04 
 
 
195 aa  80.1  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3832  protein of unknown function DUF218  28.8 
 
 
210 aa  78.6  0.00000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03633  hypothetical protein  29.59 
 
 
205 aa  75.5  0.0000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2002  hypothetical protein  34.57 
 
 
198 aa  70.5  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.596969  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4335  protein of unknown function DUF218  30.81 
 
 
189 aa  67.8  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0069  protein of unknown function DUF218  38.13 
 
 
333 aa  64.7  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0110  hypothetical protein  32.41 
 
 
165 aa  62.8  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1976  protein of unknown function DUF218  31.58 
 
 
199 aa  62.4  0.000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.05946  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4671  hypothetical protein  33.14 
 
 
225 aa  62  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175198  normal  0.0210644 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2124  hypothetical protein  29.3 
 
 
185 aa  61.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.564401  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2062  hypothetical protein  29.3 
 
 
185 aa  61.2  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.59257  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2278  hypothetical protein  29.3 
 
 
185 aa  61.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1019  hypothetical protein  29.45 
 
 
461 aa  61.2  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000506367  unclonable  0.00000000514024 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2304  hypothetical protein  29.3 
 
 
185 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.195603 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2058  hypothetical protein  26.28 
 
 
185 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3433  hypothetical protein  35.54 
 
 
230 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4935  hypothetical protein  35.54 
 
 
230 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  unclonable  0.0000188472 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5353  hypothetical protein  35.54 
 
 
230 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00600694  normal  0.075763 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1256  hypothetical protein  33.33 
 
 
195 aa  58.9  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.202454  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0924  hypothetical protein  30.07 
 
 
182 aa  58.9  0.00000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0820  hypothetical protein  30.07 
 
 
182 aa  58.9  0.00000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2388  hypothetical protein  28.66 
 
 
185 aa  58.2  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.623326  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0865  protein of unknown function DUF218  28.98 
 
 
350 aa  57.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.127642 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3239  protein of unknown function DUF218  27.43 
 
 
336 aa  57.4  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3064  hypothetical protein  25.64 
 
 
178 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3132  protein of unknown function DUF218  31.93 
 
 
236 aa  57  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0793  hypothetical protein  21.55 
 
 
206 aa  57  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.112822  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2459  protein of unknown function DUF218  25.5 
 
 
256 aa  57.4  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2261  hypothetical protein  25.64 
 
 
185 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4365  hypothetical protein  30.77 
 
 
210 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.980357  hitchhiker  0.000669718 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04460  uncharacterized membrane protein  36.43 
 
 
216 aa  56.6  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.155058 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4882  hypothetical protein  30.77 
 
 
219 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000000206501 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1734  hypothetical protein  21.69 
 
 
192 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0564328  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2312  hypothetical protein  25.64 
 
 
185 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.927622  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0757  hypothetical protein  35.77 
 
 
207 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.482457  hitchhiker  0.00142809 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1670  hypothetical protein  24.36 
 
 
185 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06790  uncharacterized membrane protein  28.72 
 
 
212 aa  55.5  0.0000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.979895 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0466  protein of unknown function DUF218  35.16 
 
 
183 aa  55.5  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2098  hypothetical protein  25.64 
 
 
185 aa  55.5  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.864287  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0806  hypothetical protein  21.55 
 
 
206 aa  55.5  0.0000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1772  hypothetical protein  26.21 
 
 
262 aa  55.1  0.0000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.442971  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1530  hypothetical protein  23.08 
 
 
194 aa  55.1  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0298  protein of unknown function DUF218  35.43 
 
 
230 aa  54.3  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0471  protein of unknown function DUF218  30.57 
 
 
216 aa  54.7  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0469  protein of unknown function DUF218  35.34 
 
 
201 aa  53.9  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.365925 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3664  hypothetical protein  21.69 
 
 
192 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.98369  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4635  hypothetical protein  32.5 
 
 
189 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.940029  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1526  hypothetical protein  23.65 
 
 
192 aa  52.8  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.107471  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1498  hypothetical protein  23.65 
 
 
192 aa  52.8  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00465852  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3069  protein of unknown function DUF218  37.5 
 
 
231 aa  52  0.000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000320027 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2382  hypothetical protein  29.86 
 
 
322 aa  52  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2428  hypothetical protein  29.86 
 
 
322 aa  52  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.445616  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1451  hypothetical protein  27.47 
 
 
257 aa  51.6  0.000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00698749  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0558  hypothetical protein  35.34 
 
 
153 aa  51.6  0.000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3427  hypothetical protein  31.88 
 
 
205 aa  51.6  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.117678 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1256  hypothetical protein  25.84 
 
 
257 aa  50.8  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000112269  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0951  hypothetical protein  29.29 
 
 
271 aa  50.8  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1335  hypothetical protein  22.44 
 
 
193 aa  51.2  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2025  protein of unknown function DUF218  22.62 
 
 
216 aa  50.8  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0343136  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01910  uncharacterized membrane protein  28.48 
 
 
229 aa  51.2  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.850313  normal  0.329563 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3776  hypothetical protein  33.33 
 
 
280 aa  50.4  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.892211  normal  0.779131 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1706  protein of unknown function DUF218  28.1 
 
 
217 aa  50.1  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.080419  hitchhiker  1.73003e-16 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1488  hypothetical protein  22.92 
 
 
192 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4551  membrane spanning protein  23.17 
 
 
345 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5055  hypothetical protein  23.17 
 
 
345 aa  50.1  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0316  hypothetical protein  23.49 
 
 
345 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>