50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3427 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3427  hypothetical protein  100 
 
 		 205 aa  406  1e-113  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.117678 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1144  hypothetical protein  71.43 
 
 		 196 aa  241  7.999999999999999e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.574729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0105  putative secreted protein  31.33 
 
 		 249 aa  76.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0103  hypothetical protein  31.33 
 
 		 237 aa  77  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.501432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0104  putative secreted protein  34.33 
 
 		 206 aa  74.7  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.900889  normal  0.196325 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4868  hypothetical protein  32.63 
 
 		 202 aa  74.3  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0110  putative secreted protein  30.72 
 
 		 206 aa  73.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.741627 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1340  protein of unknown function DUF218  30.07 
 
 		 208 aa  67.4  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2141  hypothetical protein  29.22 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3127  hypothetical protein  30.52 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.226539  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2819  hypothetical protein  30.52 
 
 		 210 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3129  hypothetical protein  30.52 
 
 		 210 aa  65.5  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00135729  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3095  hypothetical protein  28.57 
 
 		 210 aa  65.1  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.937684  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3106  hypothetical protein  28.57 
 
 		 210 aa  65.1  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866641  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2858  hypothetical protein  28.57 
 
 		 210 aa  65.1  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00183972  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2890  hypothetical protein  28.57 
 
 		 210 aa  65.1  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00431016  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3110  hypothetical protein  28.57 
 
 		 210 aa  65.1  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03633  hypothetical protein  29.7 
 
 		 205 aa  64.7  0.0000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2611  hypothetical protein  27.56 
 
 		 202 aa  63.9  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1673  protein of unknown function DUF218  33.53 
 
 		 209 aa  64.7  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0376  protein of unknown function DUF218  29.19 
 
 		 188 aa  63.2  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2882  hypothetical protein  30.67 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0452063  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2067  hypothetical protein  27.45 
 
 		 209 aa  61.6  0.000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0351391  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1277  hypothetical protein  30 
 
 		 245 aa  60.1  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.995866 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3216  protein of unknown function DUF218  29.63 
 
 		 244 aa  59.3  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.101173  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0110  hypothetical protein  30.26 
 
 		 165 aa  58.5  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0864  hypothetical protein  28.3 
 
 		 315 aa  58.5  0.00000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.898014  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13720  hypothetical protein  34.75 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.195466 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4822  hypothetical protein  25.95 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.953087  normal  0.244929 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2167  protein of unknown function DUF218  28.48 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000011898 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3832  protein of unknown function DUF218  30.41 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2122  hypothetical protein  30.91 
 
 		 228 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0673185  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4635  hypothetical protein  27.89 
 
 		 189 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.940029  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1272  protein of unknown function DUF218  31.76 
 
 		 212 aa  51.6  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1976  protein of unknown function DUF218  29.02 
 
 		 199 aa  49.7  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.05946  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2653  protein of unknown function DUF218  31.94 
 
 		 199 aa  48.5  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.344395 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1256  hypothetical protein  32.52 
 
 		 195 aa  47.8  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.202454  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1930  protein of unknown function DUF218  35.29 
 
 		 203 aa  47.4  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000562665 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0820  hypothetical protein  25.68 
 
 		 182 aa  46.6  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0924  hypothetical protein  25.68 
 
 		 182 aa  46.6  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0369  Bme2 protein  31.67 
 
 		 205 aa  45.8  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16316  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0426  Bme2 protein  31.67 
 
 		 205 aa  45.8  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0911545  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0889  protein of unknown function DUF218  27.42 
 
 		 236 aa  45.4  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.779041  hitchhiker  0.000145326 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0746  protein of unknown function DUF218  26.75 
 
 		 370 aa  45.8  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.770006 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2261  protein of unknown function DUF218  29.37 
 
 		 181 aa  45.1  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1349  protein of unknown function DUF218  32.93 
 
 		 196 aa  44.3  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1689  hypothetical protein  35.24 
 
 		 176 aa  44.3  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.143634  normal  0.399616 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1691  hypothetical protein  29.55 
 
 		 204 aa  44.7  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0187033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0643  hypothetical protein  23.62 
 
 		 192 aa  43.1  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2025  protein of unknown function DUF218  21.64 
 
 		 216 aa  41.6  0.007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0343136  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>