37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1144 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_1144  hypothetical protein  100 
 
 
196 aa  388  1e-107  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.574729  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3427  hypothetical protein  71.43 
 
 
205 aa  237  6.999999999999999e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.117678 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4868  hypothetical protein  32.48 
 
 
202 aa  68.6  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0104  putative secreted protein  30.12 
 
 
206 aa  65.5  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.900889  normal  0.196325 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0103  hypothetical protein  30.12 
 
 
237 aa  65.1  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.501432  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0105  putative secreted protein  30.12 
 
 
249 aa  65.1  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0110  putative secreted protein  30.12 
 
 
206 aa  64.7  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.741627 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03633  hypothetical protein  28.19 
 
 
205 aa  60.1  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2611  hypothetical protein  27.07 
 
 
202 aa  59.7  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1340  protein of unknown function DUF218  25.32 
 
 
208 aa  58.5  0.00000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2141  hypothetical protein  30.91 
 
 
210 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3127  hypothetical protein  29.01 
 
 
210 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.226539  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3129  hypothetical protein  29.01 
 
 
210 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00135729  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2167  protein of unknown function DUF218  27.81 
 
 
194 aa  57  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000011898 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2819  hypothetical protein  29.01 
 
 
210 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3110  hypothetical protein  30 
 
 
210 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3095  hypothetical protein  30 
 
 
210 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.937684  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3106  hypothetical protein  30 
 
 
210 aa  56.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866641  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2858  hypothetical protein  30 
 
 
210 aa  56.2  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00183972  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2890  hypothetical protein  30 
 
 
210 aa  56.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00431016  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3832  protein of unknown function DUF218  29.65 
 
 
210 aa  55.5  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2882  hypothetical protein  29.01 
 
 
210 aa  55.5  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0452063  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2067  hypothetical protein  22.37 
 
 
209 aa  51.6  0.000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0351391  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4635  hypothetical protein  29.55 
 
 
189 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.940029  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1277  hypothetical protein  29.41 
 
 
245 aa  51.2  0.000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.995866 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0110  hypothetical protein  30.08 
 
 
165 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1272  protein of unknown function DUF218  30.12 
 
 
212 aa  50.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1673  protein of unknown function DUF218  30.34 
 
 
209 aa  49.3  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13720  hypothetical protein  31.58 
 
 
210 aa  48.5  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.195466 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0376  protein of unknown function DUF218  27.82 
 
 
188 aa  47.8  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0820  hypothetical protein  24.83 
 
 
182 aa  46.2  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0924  hypothetical protein  24.83 
 
 
182 aa  46.2  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2122  hypothetical protein  31.03 
 
 
228 aa  45.1  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0673185  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1036  protein of unknown function DUF218  28.57 
 
 
248 aa  44.7  0.0009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1930  protein of unknown function DUF218  32.56 
 
 
203 aa  43.1  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000562665 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0864  hypothetical protein  25.49 
 
 
315 aa  43.9  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.898014  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2025  protein of unknown function DUF218  23.46 
 
 
216 aa  43.9  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0343136  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>