136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1930 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1930  protein of unknown function DUF218  100 
 
 		 203 aa  390  1e-107  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000562665 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13720  hypothetical protein  56.8 
 
 		 210 aa  164  6.9999999999999995e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.195466 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0864  hypothetical protein  46.97 
 
 		 315 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.898014  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1673  protein of unknown function DUF218  54.55 
 
 		 209 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1277  hypothetical protein  46.07 
 
 		 245 aa  148  7e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.995866 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0746  protein of unknown function DUF218  47.94 
 
 		 370 aa  144  6e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.770006 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1272  protein of unknown function DUF218  44.27 
 
 		 212 aa  141  6e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2122  hypothetical protein  44.74 
 
 		 228 aa  140  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0673185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0376  protein of unknown function DUF218  41.71 
 
 		 188 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3216  protein of unknown function DUF218  47.67 
 
 		 244 aa  135  5e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.101173  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2611  hypothetical protein  39.86 
 
 		 202 aa  103  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4868  hypothetical protein  33.86 
 
 		 202 aa  104  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1689  hypothetical protein  42.18 
 
 		 176 aa  102  5e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.143634  normal  0.399616 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2261  protein of unknown function DUF218  39.47 
 
 		 181 aa  95.5  4e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4822  hypothetical protein  30.27 
 
 		 215 aa  91.3  9e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.953087  normal  0.244929 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1691  hypothetical protein  40.25 
 
 		 204 aa  90.1  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0187033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03633  hypothetical protein  34.76 
 
 		 205 aa  90.1  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2002  hypothetical protein  43.23 
 
 		 198 aa  85.5  5e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.596969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3832  protein of unknown function DUF218  34.93 
 
 		 210 aa  83.6  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0110  putative secreted protein  29.32 
 
 		 206 aa  82.8  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.741627 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3127  hypothetical protein  31.3 
 
 		 210 aa  82  0.000000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.226539  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0104  putative secreted protein  29.32 
 
 		 206 aa  82  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.900889  normal  0.196325 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2819  hypothetical protein  31.3 
 
 		 210 aa  81.3  0.000000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3129  hypothetical protein  31.3 
 
 		 210 aa  81.3  0.000000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00135729  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1684  protein of unknown function DUF218  27.89 
 
 		 195 aa  81.3  0.000000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0105  putative secreted protein  29.32 
 
 		 249 aa  80.9  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0103  hypothetical protein  29.32 
 
 		 237 aa  81.3  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.501432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2141  hypothetical protein  31.3 
 
 		 210 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2067  hypothetical protein  31.82 
 
 		 209 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0351391  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2167  protein of unknown function DUF218  27.67 
 
 		 194 aa  80.5  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000011898 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2890  hypothetical protein  30.53 
 
 		 210 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00431016  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2858  hypothetical protein  30.53 
 
 		 210 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00183972  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3106  hypothetical protein  30.53 
 
 		 210 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866641  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3095  hypothetical protein  30.53 
 
 		 210 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.937684  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3110  hypothetical protein  30.53 
 
 		 210 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2882  hypothetical protein  31.3 
 
 		 210 aa  78.2  0.00000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0452063  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0643  hypothetical protein  24.36 
 
 		 192 aa  78.2  0.00000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0924  hypothetical protein  32.64 
 
 		 182 aa  75.1  0.0000000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0820  hypothetical protein  32.64 
 
 		 182 aa  75.1  0.0000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1340  protein of unknown function DUF218  23.32 
 
 		 208 aa  70.9  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3239  protein of unknown function DUF218  35.61 
 
 		 336 aa  65.9  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1772  hypothetical protein  31.3 
 
 		 262 aa  65.1  0.0000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.442971  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06205  hypothetical protein  30.06 
 
 		 219 aa  64.3  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.687571  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4335  protein of unknown function DUF218  34.72 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2382  hypothetical protein  27.27 
 
 		 322 aa  58.9  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2428  hypothetical protein  27.27 
 
 		 322 aa  58.9  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.445616  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01910  uncharacterized membrane protein  35.77 
 
 		 229 aa  58.5  0.00000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.850313  normal  0.329563 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4635  hypothetical protein  35.54 
 
 		 189 aa  58.2  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.940029  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2380  hypothetical protein  28.57 
 
 		 253 aa  58.2  0.00000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0558  hypothetical protein  34.67 
 
 		 153 aa  57.8  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0110  hypothetical protein  29.46 
 
 		 165 aa  57.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1019  hypothetical protein  33.61 
 
 		 461 aa  57  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000506367  unclonable  0.00000000514024 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2025  protein of unknown function DUF218  28.95 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0343136  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1910  protein of unknown function DUF218  28 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0244729 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1732  protein of unknown function DUF218  27.47 
 
 		 250 aa  55.8  0.0000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000709574  normal  0.252079 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3064  hypothetical protein  22.15 
 
 		 178 aa  55.1  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0148  hypothetical protein  31.28 
 
 		 251 aa  53.1  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.692112  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2653  protein of unknown function DUF218  39.17 
 
 		 199 aa  53.1  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.344395 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3427  hypothetical protein  36.36 
 
 		 205 aa  52.8  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.117678 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1666  hypothetical protein  31.07 
 
 		 246 aa  52.4  0.000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0951  hypothetical protein  29.45 
 
 		 271 aa  52  0.000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2261  hypothetical protein  22.6 
 
 		 185 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1256  hypothetical protein  31.29 
 
 		 195 aa  52  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.202454  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0298  protein of unknown function DUF218  35.83 
 
 		 230 aa  51.6  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2730  protein of unknown function DUF218  27.78 
 
 		 279 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.111496 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2459  protein of unknown function DUF218  24.41 
 
 		 256 aa  51.2  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0454  protein of unknown function DUF218  28.92 
 
 		 265 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2124  hypothetical protein  24.81 
 
 		 185 aa  50.1  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.564401  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2062  hypothetical protein  24.81 
 
 		 185 aa  50.1  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.59257  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2058  hypothetical protein  24.81 
 
 		 185 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2278  hypothetical protein  24.81 
 
 		 185 aa  50.1  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3776  hypothetical protein  31.1 
 
 		 280 aa  50.4  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.892211  normal  0.779131 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1127  hypothetical protein  33.8 
 
 		 252 aa  50.4  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0441  protein of unknown function DUF218  28.92 
 
 		 265 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2304  hypothetical protein  24.81 
 
 		 185 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.195603 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3100  protein of unknown function DUF218  30.34 
 
 		 190 aa  49.7  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2098  hypothetical protein  25.83 
 
 		 185 aa  49.3  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.864287  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0901  protein of unknown function DUF218  29.14 
 
 		 201 aa  49.3  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2312  hypothetical protein  24.81 
 
 		 185 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.927622  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0483  protein of unknown function DUF218  29.07 
 
 		 224 aa  48.9  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.470585 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1021  hypothetical protein  30.43 
 
 		 267 aa  48.9  0.00005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47504  normal  0.0154431 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1144  hypothetical protein  33.33 
 
 		 196 aa  48.9  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.574729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3132  protein of unknown function DUF218  34.78 
 
 		 236 aa  48.9  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0806  hypothetical protein  23.08 
 
 		 206 aa  48.5  0.00006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0793  hypothetical protein  20.62 
 
 		 206 aa  48.5  0.00006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.112822  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1976  protein of unknown function DUF218  27.44 
 
 		 199 aa  48.5  0.00006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.05946  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2388  hypothetical protein  24.03 
 
 		 185 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.623326  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07170  hypothetical protein  30.91 
 
 		 338 aa  48.1  0.00009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0469  protein of unknown function DUF218  32.86 
 
 		 201 aa  48.1  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.365925 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0438  protein of unknown function DUF218  29.88 
 
 		 215 aa  47.8  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06790  uncharacterized membrane protein  27.11 
 
 		 212 aa  47.4  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.979895 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2551  hypothetical protein  35.59 
 
 		 206 aa  48.1  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04460  uncharacterized membrane protein  36 
 
 		 216 aa  47.4  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.155058 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0451  hypothetical protein  29.83 
 
 		 230 aa  47.8  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0851165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1123  hypothetical protein  33.71 
 
 		 253 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.569543  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0399  hypothetical protein  30.37 
 
 		 263 aa  47  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.30478 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0692  hypothetical protein  32.5 
 
 		 229 aa  46.6  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0213382  normal  0.759811 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1670  hypothetical protein  20.25 
 
 		 185 aa  47.4  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2048  hypothetical protein  27.67 
 
 		 264 aa  46.6  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000229439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4882  hypothetical protein  31.21 
 
 		 219 aa  46.2  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000000206501 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>