101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1672 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_1672  hypothetical protein  100 
 
 		 259 aa  536  1e-151  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.485835  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1943  hypothetical protein  91.89 
 
 		 259 aa  473  1e-132  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.16005  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1566  hypothetical protein  80.24 
 
 		 247 aa  412  1e-114  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.5849  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2403  hypothetical protein  83.77 
 
 		 251 aa  396  1e-109  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.655564  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0827  hypothetical protein  84.26 
 
 		 239 aa  384  1e-106  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2304  hypothetical protein  78.7 
 
 		 250 aa  384  1e-106  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02073  hypothetical protein  84.26 
 
 		 239 aa  384  1e-105  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1514  protein of unknown function DUF218  84.26 
 
 		 239 aa  384  1e-105  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.54049  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2464  hypothetical protein  76.33 
 
 		 245 aa  383  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2278  hypothetical protein  84.26 
 
 		 239 aa  384  1e-105  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2439  hypothetical protein  84.26 
 
 		 239 aa  384  1e-105  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3021  hypothetical protein  76.33 
 
 		 245 aa  383  1e-105  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0104814 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2563  hypothetical protein  75.92 
 
 		 245 aa  381  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1504  hypothetical protein  84.26 
 
 		 239 aa  384  1e-105  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2291  hypothetical protein  84.26 
 
 		 239 aa  384  1e-105  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207497 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3276  hypothetical protein  84.26 
 
 		 239 aa  384  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.731411 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02032  hypothetical protein  84.26 
 
 		 239 aa  384  1e-105  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2747  hypothetical protein  77.82 
 
 		 239 aa  379  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.608544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2374  hypothetical protein  79.08 
 
 		 239 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2419  hypothetical protein  79.08 
 
 		 239 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2423  hypothetical protein  79.08 
 
 		 239 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2330  hypothetical protein  79.08 
 
 		 239 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2531  hypothetical protein  79.08 
 
 		 239 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.379289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02033  hypothetical protein  50.43 
 
 		 244 aa  222  6e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0807  sanA protein  54.21 
 
 		 221 aa  221  9.999999999999999e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003738  SanA protein  52.09 
 
 		 224 aa  220  1.9999999999999999e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.28642  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1272  vancomycin resistance protein SanA  48.57 
 
 		 225 aa  209  4e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.732001  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1077  SanA protein  45.93 
 
 		 231 aa  187  2e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000060635  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2215  protein of unknown function DUF218  45.11 
 
 		 268 aa  160  2e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2226  protein of unknown function DUF218  41.79 
 
 		 222 aa  160  3e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0993936  normal  0.236375 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2646  protein of unknown function DUF218  42.16 
 
 		 201 aa  150  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3378  putative SanA protein  40.36 
 
 		 227 aa  148  9e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.613446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0614  hypothetical protein  39.91 
 
 		 227 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3553  putative SanA protein  39.91 
 
 		 227 aa  146  3e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.322967  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02955  predicted thioredoxin-like protein  40.57 
 
 		 230 aa  145  8.000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0615  protein of unknown function DUF218  40.57 
 
 		 230 aa  145  8.000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.319627  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02905  hypothetical protein  40.57 
 
 		 230 aa  145  8.000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3268  putative SanA protein  39.91 
 
 		 227 aa  145  9e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3522  putative SanA protein  40 
 
 		 227 aa  144  1e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3483  SanA protein  39.56 
 
 		 230 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3517  hypothetical protein  39.56 
 
 		 230 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.743597  hitchhiker  0.000023852 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3413  SanA protein  42.02 
 
 		 210 aa  143  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3409  SanA protein  39.56 
 
 		 230 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3579  SanA protein  39.56 
 
 		 230 aa  143  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.129921 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4400  putative SanA protein  40 
 
 		 230 aa  143  3e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.801219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1238  hypothetical protein  42.25 
 
 		 237 aa  140  3e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.56645  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1706  protein of unknown function DUF218  38.55 
 
 		 217 aa  133  3e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.080419  hitchhiker  1.73003e-16 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2025  protein of unknown function DUF218  32.23 
 
 		 216 aa  129  5.0000000000000004e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0343136  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3447  hypothetical protein  32 
 
 		 233 aa  122  7e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.246532  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4671  hypothetical protein  37.44 
 
 		 225 aa  111  9e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175198  normal  0.0210644 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0889  protein of unknown function DUF218  31.22 
 
 		 236 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.779041  hitchhiker  0.000145326 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1036  protein of unknown function DUF218  36.22 
 
 		 248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2325  hypothetical protein  38.38 
 
 		 270 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0430  hypothetical protein  29.17 
 
 		 219 aa  107  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2333  sanA protein, putative  28.51 
 
 		 226 aa  102  6e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.182308  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6010  hypothetical protein  35.67 
 
 		 226 aa  99.8  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0036076  normal  0.534674 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0471  protein of unknown function DUF218  38.69 
 
 		 216 aa  99  7e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06205  hypothetical protein  29.25 
 
 		 219 aa  99  7e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.687571  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0298  protein of unknown function DUF218  35.5 
 
 		 230 aa  96.3  5e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2008  hypothetical protein  29.44 
 
 		 213 aa  94.4  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.456188 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04460  uncharacterized membrane protein  33.17 
 
 		 216 aa  93.6  3e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.155058 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2577  protein of unknown function DUF218  27.8 
 
 		 223 aa  87.4  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.439933  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3132  protein of unknown function DUF218  37.9 
 
 		 236 aa  86.7  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01910  uncharacterized membrane protein  34.65 
 
 		 229 aa  81.3  0.00000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.850313  normal  0.329563 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3069  protein of unknown function DUF218  34.42 
 
 		 231 aa  81.6  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000320027 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0469  protein of unknown function DUF218  36.22 
 
 		 201 aa  77  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.365925 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0438  protein of unknown function DUF218  31.58 
 
 		 215 aa  76.3  0.0000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06790  uncharacterized membrane protein  29.11 
 
 		 212 aa  75.5  0.0000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.979895 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4335  protein of unknown function DUF218  32.05 
 
 		 189 aa  66.2  0.0000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3100  protein of unknown function DUF218  29.29 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0466  protein of unknown function DUF218  30.51 
 
 		 183 aa  58.5  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0643  hypothetical protein  25.39 
 
 		 192 aa  55.1  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3127  hypothetical protein  26.32 
 
 		 210 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.226539  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2819  hypothetical protein  26.32 
 
 		 210 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3129  hypothetical protein  26.32 
 
 		 210 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00135729  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2882  hypothetical protein  27.82 
 
 		 210 aa  52.8  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0452063  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2890  hypothetical protein  26.47 
 
 		 210 aa  52.4  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00431016  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2858  hypothetical protein  26.47 
 
 		 210 aa  52.4  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00183972  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3106  hypothetical protein  26.47 
 
 		 210 aa  52.4  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866641  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3095  hypothetical protein  26.47 
 
 		 210 aa  52.4  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.937684  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3110  hypothetical protein  26.47 
 
 		 210 aa  52.4  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2141  hypothetical protein  26.47 
 
 		 210 aa  52  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4822  hypothetical protein  30.16 
 
 		 215 aa  51.6  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.953087  normal  0.244929 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0119  protein of unknown function DUF218  30.21 
 
 		 348 aa  50.8  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.422825  normal  0.192252 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1689  hypothetical protein  29.51 
 
 		 176 aa  50.1  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.143634  normal  0.399616 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1976  protein of unknown function DUF218  26.17 
 
 		 199 aa  48.5  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.05946  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4882  hypothetical protein  28.49 
 
 		 219 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000000206501 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2261  protein of unknown function DUF218  25.52 
 
 		 181 aa  47  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03633  hypothetical protein  26.8 
 
 		 205 aa  46.6  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2067  hypothetical protein  24.71 
 
 		 209 aa  46.2  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0351391  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4635  hypothetical protein  26.11 
 
 		 189 aa  45.4  0.0009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.940029  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4365  hypothetical protein  28.44 
 
 		 210 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.980357  hitchhiker  0.000669718 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1684  protein of unknown function DUF218  25.29 
 
 		 195 aa  44.3  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1256  hypothetical protein  26.15 
 
 		 195 aa  43.1  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.202454  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3832  protein of unknown function DUF218  22.35 
 
 		 210 aa  42.7  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4689  protein of unknown function DUF218  26.98 
 
 		 262 aa  42.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.584502  normal  0.95613 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3433  hypothetical protein  26.72 
 
 		 230 aa  42.4  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4935  hypothetical protein  26.72 
 
 		 230 aa  42.4  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000188472 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5353  hypothetical protein  26.72 
 
 		 230 aa  42.4  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00600694  normal  0.075763 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0746  protein of unknown function DUF218  26.09 
 
 		 370 aa  42.4  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.770006 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>