83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_1077 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_1077  SanA protein  100 
 
 		 231 aa  477  1e-134  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000060635  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3021  hypothetical protein  49.22 
 
 		 245 aa  192  3e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0104814 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2563  hypothetical protein  49.22 
 
 		 245 aa  192  3e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02033  hypothetical protein  47.96 
 
 		 244 aa  192  3e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2464  hypothetical protein  49.22 
 
 		 245 aa  192  3e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003738  SanA protein  46.57 
 
 		 224 aa  191  1e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.28642  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1943  hypothetical protein  46.41 
 
 		 259 aa  186  2e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.16005  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1566  hypothetical protein  45.05 
 
 		 247 aa  186  3e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.5849  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1672  hypothetical protein  47.67 
 
 		 259 aa  185  5e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.485835  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2403  hypothetical protein  45.45 
 
 		 251 aa  185  6e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.655564  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1272  vancomycin resistance protein SanA  46.11 
 
 		 225 aa  183  2.0000000000000003e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.732001  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2374  hypothetical protein  49.21 
 
 		 239 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2419  hypothetical protein  49.21 
 
 		 239 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2423  hypothetical protein  49.21 
 
 		 239 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2330  hypothetical protein  49.21 
 
 		 239 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2531  hypothetical protein  49.21 
 
 		 239 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.379289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0827  hypothetical protein  47.34 
 
 		 239 aa  179  2e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3276  hypothetical protein  47.34 
 
 		 239 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.731411 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2291  hypothetical protein  47.34 
 
 		 239 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207497 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1504  hypothetical protein  47.34 
 
 		 239 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2304  hypothetical protein  45.45 
 
 		 250 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02073  hypothetical protein  47.34 
 
 		 239 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2439  hypothetical protein  47.34 
 
 		 239 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2278  hypothetical protein  47.34 
 
 		 239 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1514  protein of unknown function DUF218  47.34 
 
 		 239 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.54049  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0807  sanA protein  45 
 
 		 221 aa  179  2.9999999999999997e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02032  hypothetical protein  47.34 
 
 		 239 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2747  hypothetical protein  48.4 
 
 		 239 aa  176  3e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.608544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2226  protein of unknown function DUF218  38.57 
 
 		 222 aa  149  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0993936  normal  0.236375 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2215  protein of unknown function DUF218  44.19 
 
 		 268 aa  147  1.0000000000000001e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2646  protein of unknown function DUF218  46.25 
 
 		 201 aa  143  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1238  hypothetical protein  40.83 
 
 		 237 aa  135  4e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.56645  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3378  putative SanA protein  35.58 
 
 		 227 aa  134  8e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.613446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3579  SanA protein  36.53 
 
 		 230 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.129921 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3413  SanA protein  37.69 
 
 		 210 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3268  putative SanA protein  33.79 
 
 		 227 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3483  SanA protein  36.53 
 
 		 230 aa  129  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3517  hypothetical protein  36.53 
 
 		 230 aa  129  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.743597  hitchhiker  0.000023852 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3409  SanA protein  36.53 
 
 		 230 aa  129  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4400  putative SanA protein  33.79 
 
 		 230 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.801219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3553  putative SanA protein  33.79 
 
 		 227 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.322967  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0614  hypothetical protein  33.33 
 
 		 227 aa  128  8.000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1706  protein of unknown function DUF218  39.47 
 
 		 217 aa  127  1.0000000000000001e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.080419  hitchhiker  1.73003e-16 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02905  hypothetical protein  32.88 
 
 		 230 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02955  predicted thioredoxin-like protein  32.88 
 
 		 230 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3522  putative SanA protein  33.33 
 
 		 227 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0615  protein of unknown function DUF218  32.88 
 
 		 230 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.319627  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04460  uncharacterized membrane protein  32.02 
 
 		 216 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.155058 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2025  protein of unknown function DUF218  31.34 
 
 		 216 aa  108  5e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0343136  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0430  hypothetical protein  28.16 
 
 		 219 aa  108  8.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6010  hypothetical protein  33.33 
 
 		 226 aa  105  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0036076  normal  0.534674 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0298  protein of unknown function DUF218  33.13 
 
 		 230 aa  105  7e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0471  protein of unknown function DUF218  36.09 
 
 		 216 aa  104  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2325  hypothetical protein  33.53 
 
 		 270 aa  104  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06205  hypothetical protein  36.16 
 
 		 219 aa  102  5e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.687571  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4671  hypothetical protein  32.43 
 
 		 225 aa  100  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175198  normal  0.0210644 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1036  protein of unknown function DUF218  32.16 
 
 		 248 aa  98.6  8e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0469  protein of unknown function DUF218  31.93 
 
 		 201 aa  95.1  8e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.365925 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3132  protein of unknown function DUF218  29.67 
 
 		 236 aa  94.4  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2333  sanA protein, putative  31.75 
 
 		 226 aa  91.3  1e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.182308  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3447  hypothetical protein  25.64 
 
 		 233 aa  91.7  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.246532  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3069  protein of unknown function DUF218  33.33 
 
 		 231 aa  90.9  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000320027 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2577  protein of unknown function DUF218  29.44 
 
 		 223 aa  86.3  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.439933  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0438  protein of unknown function DUF218  29.61 
 
 		 215 aa  84.3  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01910  uncharacterized membrane protein  31.52 
 
 		 229 aa  81.3  0.00000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.850313  normal  0.329563 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0889  protein of unknown function DUF218  35.37 
 
 		 236 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.779041  hitchhiker  0.000145326 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06790  uncharacterized membrane protein  24.62 
 
 		 212 aa  73.2  0.000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.979895 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2008  hypothetical protein  25.15 
 
 		 213 aa  70.5  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.456188 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3100  protein of unknown function DUF218  28.26 
 
 		 190 aa  68.2  0.00000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0466  protein of unknown function DUF218  27.16 
 
 		 183 aa  66.2  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4335  protein of unknown function DUF218  30 
 
 		 189 aa  63.9  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1976  protein of unknown function DUF218  23.73 
 
 		 199 aa  54.7  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.05946  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1689  hypothetical protein  25.62 
 
 		 176 aa  51.6  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.143634  normal  0.399616 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0643  hypothetical protein  28.33 
 
 		 192 aa  46.6  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4635  hypothetical protein  25.23 
 
 		 189 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.940029  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3832  protein of unknown function DUF218  23.44 
 
 		 210 aa  45.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2261  protein of unknown function DUF218  20.97 
 
 		 181 aa  45.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1340  protein of unknown function DUF218  19.78 
 
 		 208 aa  43.9  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3095  hypothetical protein  25.19 
 
 		 210 aa  42  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.937684  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3110  hypothetical protein  25.19 
 
 		 210 aa  42  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2890  hypothetical protein  25.19 
 
 		 210 aa  42  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00431016  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2858  hypothetical protein  25.19 
 
 		 210 aa  42  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00183972  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3106  hypothetical protein  25.19 
 
 		 210 aa  42  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866641  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>