95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1892 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_1892  hypothetical protein  100 
 
 
361 aa  716    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1939  hypothetical protein  36.7 
 
 
335 aa  188  2e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1839  hypothetical protein  36.84 
 
 
373 aa  138  1e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.07336 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3467  hypothetical protein  32.04 
 
 
345 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4919  hypothetical protein  36.49 
 
 
344 aa  136  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4534  hypothetical protein  36.49 
 
 
344 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4551  membrane spanning protein  33.72 
 
 
345 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5055  hypothetical protein  33.33 
 
 
345 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4694  hypothetical protein  33.33 
 
 
345 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4938  hypothetical protein  32.51 
 
 
344 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4924  hypothetical protein  32.41 
 
 
345 aa  133  5e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4954  hypothetical protein  33.33 
 
 
345 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0316  hypothetical protein  30.24 
 
 
345 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4633  hypothetical protein  30.09 
 
 
344 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07170  hypothetical protein  38.49 
 
 
338 aa  126  5e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1098  hypothetical protein  39.78 
 
 
342 aa  120  3e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0131403  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0865  protein of unknown function DUF218  37.62 
 
 
350 aa  115  8.999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.127642 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3239  protein of unknown function DUF218  38.19 
 
 
336 aa  109  6e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0069  protein of unknown function DUF218  38.12 
 
 
333 aa  108  1e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0171  hypothetical protein  32.72 
 
 
365 aa  88.6  2e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0710  protein of unknown function DUF218  32.29 
 
 
393 aa  87.8  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.059458  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1229  protein of unknown function DUF218  31.66 
 
 
378 aa  86.7  5e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1256  hypothetical protein  31.65 
 
 
257 aa  82.8  0.000000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000112269  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0806  hypothetical protein  31.58 
 
 
206 aa  80.1  0.00000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1335  hypothetical protein  33.51 
 
 
193 aa  79.7  0.00000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0793  hypothetical protein  34 
 
 
206 aa  79.7  0.00000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.112822  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1670  hypothetical protein  31.75 
 
 
185 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1451  hypothetical protein  32.12 
 
 
257 aa  79  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00698749  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0376  protein of unknown function DUF218  33.12 
 
 
258 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1950  hypothetical protein  34 
 
 
318 aa  76.3  0.0000000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1772  hypothetical protein  31.18 
 
 
262 aa  75.9  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.442971  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3664  hypothetical protein  30.85 
 
 
192 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.98369  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2428  hypothetical protein  30.95 
 
 
322 aa  75.1  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.445616  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2382  hypothetical protein  30.95 
 
 
322 aa  75.1  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1680  hypothetical protein  35.33 
 
 
192 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2312  hypothetical protein  32.48 
 
 
185 aa  72.8  0.000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.927622  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3064  hypothetical protein  32.05 
 
 
178 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1976  protein of unknown function DUF218  30.57 
 
 
199 aa  71.2  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.05946  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1488  hypothetical protein  31.28 
 
 
192 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2261  hypothetical protein  32.05 
 
 
185 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1711  hypothetical protein  31.28 
 
 
192 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2388  hypothetical protein  30.57 
 
 
185 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.623326  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1498  hypothetical protein  31.28 
 
 
192 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00465852  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2098  hypothetical protein  32.47 
 
 
185 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.864287  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1526  hypothetical protein  31.28 
 
 
192 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.107471  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1530  hypothetical protein  34 
 
 
194 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1734  hypothetical protein  30.73 
 
 
192 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0564328  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2058  hypothetical protein  30.57 
 
 
185 aa  69.3  0.00000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1645  hypothetical protein  32.3 
 
 
172 aa  69.3  0.00000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.840516  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2124  hypothetical protein  29.94 
 
 
185 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.564401  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2062  hypothetical protein  29.94 
 
 
185 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.59257  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2278  hypothetical protein  29.94 
 
 
185 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2304  hypothetical protein  29.94 
 
 
185 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.195603 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1788  hypothetical protein  34.44 
 
 
159 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2459  protein of unknown function DUF218  30.57 
 
 
256 aa  65.1  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2380  hypothetical protein  28.57 
 
 
253 aa  65.5  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0951  hypothetical protein  30.07 
 
 
271 aa  62.8  0.000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0119  protein of unknown function DUF218  27.04 
 
 
348 aa  62.8  0.000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.422825  normal  0.192252 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1684  protein of unknown function DUF218  27.98 
 
 
195 aa  62  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2372  hypothetical protein  28.07 
 
 
259 aa  60.5  0.00000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.462548 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2157  protein of unknown function DUF218  33.88 
 
 
243 aa  60.5  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3190  protein of unknown function DUF218  34.01 
 
 
278 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.463529  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0832  hypothetical protein  29.53 
 
 
251 aa  60.1  0.00000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000170655  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1021  hypothetical protein  28.19 
 
 
267 aa  60.1  0.00000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47504  normal  0.0154431 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3226  protein of unknown function DUF218  35.9 
 
 
265 aa  59.7  0.00000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.836956 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3776  hypothetical protein  29.73 
 
 
280 aa  59.7  0.00000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.892211  normal  0.779131 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3001  hypothetical protein  35.9 
 
 
278 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.836994  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2048  hypothetical protein  26.74 
 
 
264 aa  59.3  0.0000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000229439  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19360  hypothetical protein  28.7 
 
 
246 aa  58.5  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000354408 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4822  hypothetical protein  25.7 
 
 
215 aa  54.3  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.953087  normal  0.244929 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0022  hypothetical protein  30.2 
 
 
337 aa  53.5  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0643  hypothetical protein  25.58 
 
 
192 aa  52.8  0.000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1340  protein of unknown function DUF218  31.47 
 
 
208 aa  52.8  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0463  hypothetical protein  28.81 
 
 
178 aa  52.4  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1158  hypothetical protein  26.88 
 
 
237 aa  51.6  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00819427  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1119  hypothetical protein  26.71 
 
 
237 aa  50.4  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0242849  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1689  hypothetical protein  31.2 
 
 
176 aa  50.4  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.143634  normal  0.399616 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0755  protein of unknown function DUF218  25.29 
 
 
264 aa  49.7  0.00008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000325401 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1691  hypothetical protein  29.41 
 
 
204 aa  49.3  0.00009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0187033  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4675  hypothetical protein  28.67 
 
 
270 aa  49.3  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.139137  normal  0.101849 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1673  hypothetical protein  32.2 
 
 
284 aa  48.1  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.255885 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2743  hypothetical protein  38.67 
 
 
281 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.519484 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6345  hypothetical protein  34.19 
 
 
273 aa  46.2  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.842525  hitchhiker  0.00886625 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1708  hypothetical protein  35.11 
 
 
280 aa  45.1  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050766  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0549  protein of unknown function DUF218  30.4 
 
 
262 aa  44.3  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2008  hypothetical protein  24.82 
 
 
213 aa  44.3  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.456188 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3832  protein of unknown function DUF218  25.62 
 
 
210 aa  44.3  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000748  hypothetical protein  28.41 
 
 
280 aa  44.3  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.852715  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4689  protein of unknown function DUF218  31.75 
 
 
262 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.584502  normal  0.95613 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3784  hypothetical protein  30.16 
 
 
256 aa  43.5  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.570332 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06790  uncharacterized membrane protein  24.58 
 
 
212 aa  43.5  0.006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.979895 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2202  hypothetical protein  30.77 
 
 
259 aa  43.5  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2014  hypothetical protein  33.33 
 
 
235 aa  43.1  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.82136  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2313  hypothetical protein  27.84 
 
 
251 aa  42.7  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2577  protein of unknown function DUF218  26.42 
 
 
223 aa  42.7  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.439933  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>