136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_1372 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_1372  hypothetical protein  100 
 
 		 231 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.651893  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1471  hypothetical protein  82.17 
 
 		 248 aa  392  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.135208  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1476  hypothetical protein  82.61 
 
 		 248 aa  380  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1507  hypothetical protein  83.48 
 
 		 248 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2876  protein of unknown function DUF218  82.17 
 
 		 233 aa  360  9e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.380038  hitchhiker  0.0000392401 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1657  hypothetical protein  77.31 
 
 		 244 aa  345  3e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2615  hypothetical protein  75 
 
 		 244 aa  329  2e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.175692  hitchhiker  0.0000511139 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2682  hypothetical protein  74.14 
 
 		 244 aa  322  4e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.566632  unclonable  0.000043441 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2789  hypothetical protein  74.46 
 
 		 244 aa  321  7e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0155604 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1709  hypothetical protein  60.28 
 
 		 264 aa  265  5.999999999999999e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.221791  normal  0.939525 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1429  hypothetical protein  56.09 
 
 		 246 aa  261  4.999999999999999e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0479174  normal  0.153342 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2936  hypothetical protein  57.76 
 
 		 251 aa  245  4.9999999999999997e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0201692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1442  hypothetical protein  55.6 
 
 		 256 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000191712  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1322  hypothetical protein  52.12 
 
 		 252 aa  236  3e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2230  hypothetical protein  53.04 
 
 		 245 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.951055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2600  hypothetical protein  51.92 
 
 		 264 aa  195  5.000000000000001e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0668  hypothetical protein  39.68 
 
 		 255 aa  129  3e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0731  hypothetical protein  36.91 
 
 		 287 aa  122  3e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.853147  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01585  hypothetical protein  38.25 
 
 		 268 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003938  membrane protein functionally coupled to the MukBEF chromosome partitioning mechanism  36.87 
 
 		 261 aa  109  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0113551  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2225  hypothetical protein  32.58 
 
 		 254 aa  108  6e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.433325  normal  0.444103 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2405  hypothetical protein  36.52 
 
 		 259 aa  108  6e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000200717  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1321  hypothetical protein  34.6 
 
 		 282 aa  108  9.000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000340007  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00924  conserved inner membrane protein  36.09 
 
 		 259 aa  107  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0692012  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2723  protein of unknown function DUF218  36.09 
 
 		 259 aa  107  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00143107  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1080  hypothetical protein  36.09 
 
 		 259 aa  107  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00727998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1027  hypothetical protein  36.09 
 
 		 259 aa  107  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000464041  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1017  hypothetical protein  36.09 
 
 		 259 aa  107  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000186844  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2676  hypothetical protein  36.09 
 
 		 259 aa  107  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000584627  normal  0.41839 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2201  hypothetical protein  36.09 
 
 		 259 aa  107  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000670511  normal  0.151519 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00931  hypothetical protein  36.09 
 
 		 259 aa  107  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0659639  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1023  hypothetical protein  36.4 
 
 		 258 aa  106  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.14835  normal  0.458616 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2878  protein of unknown function DUF218  36.75 
 
 		 260 aa  106  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1088  hypothetical protein  36.4 
 
 		 258 aa  106  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.213248  normal  0.252564 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1104  hypothetical protein  36.4 
 
 		 258 aa  106  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0147337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0996  hypothetical protein  36.4 
 
 		 258 aa  105  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.490044  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1055  hypothetical protein  36.4 
 
 		 258 aa  105  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.102955 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2554  hypothetical protein  37.93 
 
 		 264 aa  105  8e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.509149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0127  protein of unknown function DUF218  31.69 
 
 		 258 aa  102  4e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.703428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1439  hypothetical protein  35.16 
 
 		 259 aa  99.8  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.270449  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2681  hypothetical protein  33.48 
 
 		 250 aa  98.2  9e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2002  hypothetical protein  28.27 
 
 		 254 aa  98.2  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1775  hypothetical protein  31.53 
 
 		 282 aa  96.3  4e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2047  hypothetical protein  31.53 
 
 		 282 aa  95.9  5e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2553  hypothetical protein  32.62 
 
 		 250 aa  92  7e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2202  hypothetical protein  32.57 
 
 		 259 aa  88.6  7e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2397  integral membrane protein  34.85 
 
 		 250 aa  87.4  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2303  hypothetical protein  33.16 
 
 		 258 aa  85.1  9e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.682762  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2266  hypothetical protein  31.09 
 
 		 268 aa  80.1  0.00000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1721  hypothetical protein  32.29 
 
 		 257 aa  79.7  0.00000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.944065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2290  hypothetical protein  35.48 
 
 		 252 aa  79.3  0.00000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0260341  normal  0.357814 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1020  protein of unknown function DUF218  29.61 
 
 		 242 aa  77  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22350  hypothetical protein  25.42 
 
 		 256 aa  73.6  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1206  hypothetical protein  28.64 
 
 		 251 aa  71.2  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2201  protein of unknown function DUF218  31.2 
 
 		 264 aa  68.9  0.00000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0561041  normal  0.0364927 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2571  hypothetical protein  31.2 
 
 		 266 aa  68.9  0.00000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1177  hypothetical protein  29.29 
 
 		 268 aa  65.1  0.0000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00488097  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12821  hypothetical protein  27.85 
 
 		 236 aa  64.7  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1136  hypothetical protein  29.29 
 
 		 268 aa  64.3  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000241931  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3226  protein of unknown function DUF218  30.57 
 
 		 265 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.836956 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1541  hypothetical protein  28.64 
 
 		 214 aa  64.3  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00754119  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3001  hypothetical protein  29.96 
 
 		 278 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.836994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2494  protein of unknown function DUF218  30.62 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1119  hypothetical protein  30.13 
 
 		 237 aa  62  0.000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0242849  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1158  hypothetical protein  31.17 
 
 		 237 aa  62  0.000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00819427  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2313  hypothetical protein  26.61 
 
 		 251 aa  60.5  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3520  hypothetical protein  28.87 
 
 		 263 aa  59.7  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1708  hypothetical protein  29.36 
 
 		 280 aa  58.9  0.00000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050766  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2014  hypothetical protein  27.88 
 
 		 235 aa  58.5  0.00000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.82136  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4052  protein of unknown function DUF218  27.59 
 
 		 262 aa  57  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3403  hypothetical protein  31.09 
 
 		 280 aa  56.2  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0162  hypothetical protein  31.94 
 
 		 247 aa  56.2  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0452  protein of unknown function DUF218  33.56 
 
 		 260 aa  56.2  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3190  protein of unknown function DUF218  26.99 
 
 		 278 aa  55.8  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.463529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4460  hypothetical protein  27.71 
 
 		 267 aa  55.5  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.472125  normal  0.336495 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4373  protein of unknown function DUF218  26.84 
 
 		 262 aa  55.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845031  normal  0.225585 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3086  hypothetical protein  27.31 
 
 		 255 aa  54.7  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1685  hypothetical protein  26.27 
 
 		 255 aa  54.3  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.730157  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0733  hypothetical protein  26.27 
 
 		 255 aa  54.3  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2573  hypothetical protein  26.38 
 
 		 301 aa  53.9  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1688  hypothetical protein  26.27 
 
 		 255 aa  54.3  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.330152  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1895  hypothetical protein  26.27 
 
 		 255 aa  54.3  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.845232  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0454  protein of unknown function DUF218  31.09 
 
 		 265 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2400  hypothetical protein  26.27 
 
 		 255 aa  54.3  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.115236  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2263  hypothetical protein  26.27 
 
 		 255 aa  54.3  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.338192  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0567  hypothetical protein  26.27 
 
 		 255 aa  54.3  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.323416  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1765  hypothetical protein  23.18 
 
 		 281 aa  53.5  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.280276  normal  0.0749745 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4689  protein of unknown function DUF218  33.33 
 
 		 262 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.584502  normal  0.95613 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0069  protein of unknown function DUF218  26.29 
 
 		 261 aa  53.5  0.000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3048  hypothetical protein  30.57 
 
 		 280 aa  53.5  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.09156  normal  0.289832 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1763  hypothetical protein  35.78 
 
 		 252 aa  53.1  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.478051 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2743  hypothetical protein  26.14 
 
 		 281 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.519484 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3453  hypothetical protein  27.03 
 
 		 262 aa  52.4  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0441  protein of unknown function DUF218  30.57 
 
 		 265 aa  52.4  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1557  hypothetical protein  27.15 
 
 		 249 aa  52  0.000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4612  hypothetical protein  27.81 
 
 		 262 aa  50.1  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467736  normal  0.160891 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2685  hypothetical protein  28.03 
 
 		 251 aa  49.3  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0188872  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0399  hypothetical protein  30.77 
 
 		 263 aa  48.9  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.30478 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1366  hypothetical protein  32.56 
 
 		 266 aa  48.9  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.90388  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0413  hypothetical protein  25.68 
 
 		 272 aa  47.8  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>