More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4015 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3931  Rhs element Vgr protein  63.02 
 
 		 616 aa  798    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.410968  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3260  Rhs element Vgr protein  55.17 
 
 		 602 aa  679    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.386521  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4015  Rhs element Vgr protein  100 
 
 		 602 aa  1247    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.211679  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5894  Rhs element Vgr protein  29.79 
 
 		 615 aa  235  2.0000000000000002e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6416  Rhs element Vgr protein  28.81 
 
 		 617 aa  211  2e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1796  Rhs element Vgr protein  27.15 
 
 		 619 aa  178  3e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0660  hypothetical protein  26.92 
 
 		 605 aa  172  2e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.279373 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3589  Rhs element Vgr protein  24.24 
 
 		 612 aa  158  3e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.512863 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3220  Rhs element Vgr protein  25.37 
 
 		 618 aa  131  3e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4109  Rhs element Vgr protein  25.93 
 
 		 576 aa  125  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0273732 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4864  Rhs element Vgr protein  24.58 
 
 		 599 aa  118  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0846936  normal  0.155196 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1191  Rhs element Vgr protein  23.05 
 
 		 703 aa  101  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1269  Rhs element Vgr protein  22.15 
 
 		 661 aa  95.9  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0412192  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1436  Rhs element Vgr protein  22.89 
 
 		 661 aa  95.5  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.064161  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1057  Rhs element Vgr protein  22.15 
 
 		 661 aa  95.9  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.517121  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0511  Rhs element Vgr protein  22.15 
 
 		 661 aa  95.9  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1401  Rhs element Vgr protein  22.15 
 
 		 661 aa  95.9  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764688  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0240  Rhs element Vgr protein  22.15 
 
 		 661 aa  95.9  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5985  type VI secretion system Vgr family protein  24.56 
 
 		 641 aa  95.1  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2568  Rhs element Vgr protein  21.99 
 
 		 661 aa  94.7  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1320  Rhs element Vgr protein  21.99 
 
 		 661 aa  94.4  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.249702  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0983  hypothetical protein  31.11 
 
 		 218 aa  92.8  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208742  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1538  two component LuxR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 621 aa  93.2  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3019  type VI secretion system Vgr family protein  24.17 
 
 		 1048 aa  89.7  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.103132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6682  type VI secretion system Vgr family protein  24.32 
 
 		 1057 aa  89  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5384  Rhs element Vgr protein  30.2 
 
 		 602 aa  89.4  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3177  Rhs family protein  25.54 
 
 		 697 aa  88.6  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2094  Rhs element Vgr protein  25.14 
 
 		 646 aa  87.8  6e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.730907  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3415  Rhs element Vgr protein  23.67 
 
 		 669 aa  87.8  6e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.960838  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3106  hypothetical protein  25.57 
 
 		 618 aa  86.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.166384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0769  Rhs element Vgr protein  29.05 
 
 		 248 aa  85.9  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0250  type VI secretion system Vgr family protein  23.03 
 
 		 794 aa  85.9  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1726  Rhs element Vgr protein  24.22 
 
 		 642 aa  85.1  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3822  Rhs element Vgr protein  29.52 
 
 		 578 aa  83.2  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.112104  normal  0.0443202 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1732  Rhs element Vgr protein  31.84 
 
 		 641 aa  80.9  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00520263 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_36  VgrG protein, VgrG-2  25.39 
 
 		 754 aa  80.5  0.00000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4080  type VI secretion system Vgr family protein  22.35 
 
 		 771 aa  80.5  0.00000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000279673 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4080  Rhs element Vgr protein  24.73 
 
 		 853 aa  80.1  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2888  hypothetical protein  22.5 
 
 		 668 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.882104  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3609  Rhs element Vgr protein  25.56 
 
 		 574 aa  79.7  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000128418 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2618  Rhs element Vgr protein  25 
 
 		 618 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.576781 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50870  Rhs element Vgr protein  23.29 
 
 		 668 aa  78.2  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2744  type VI secretion system Vgr family protein  23.02 
 
 		 851 aa  77.8  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1613  Rhs element Vgr protein  23.06 
 
 		 858 aa  77.8  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0166  Rhs element Vgr protein  23.06 
 
 		 930 aa  77.8  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.275346  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0143  Rhs element Vgr protein  23.06 
 
 		 896 aa  77.8  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420233  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1626  Rhs element Vgr protein  30.46 
 
 		 592 aa  77.8  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0131276 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01965  hypothetical protein  23.05 
 
 		 771 aa  77.4  0.0000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3752  Rhs element Vgr protein  22.12 
 
 		 755 aa  77.8  0.0000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.617325 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3558  type VI secretion system Vgr family protein  21.83 
 
 		 782 aa  77  0.0000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.125148  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2817  Rhs element Vgr protein  23.04 
 
 		 593 aa  77  0.0000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000448  VgrG protein  24.6 
 
 		 692 aa  76.6  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000107078  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3429  Rhs element Vgr protein  21.83 
 
 		 782 aa  76.6  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3914  type VI secretion system Vgr family protein  24.28 
 
 		 845 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.120628  normal  0.788068 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2760  type VI secretion system Vgr family protein  23.78 
 
 		 613 aa  76.3  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.68949 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0129  Rhs element Vgr protein  23.28 
 
 		 872 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176404  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33960  hypothetical protein  22.51 
 
 		 668 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000148732  normal  0.101757 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6124  type VI secretion system Vgr family protein  22.63 
 
 		 714 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.029227  normal  0.478766 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0838  Rhs element Vgr protein  23.01 
 
 		 697 aa  74.7  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2788  type VI secretion system Vgr family protein  23.98 
 
 		 889 aa  74.7  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.154315 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2047  Rhs element Vgr protein  23.42 
 
 		 572 aa  74.3  0.000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0926  Rhs element Vgr protein  27.36 
 
 		 587 aa  74.3  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.91076  normal  0.482817 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4009  Rhs element Vgr protein  22.61 
 
 		 756 aa  73.9  0.000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0849352  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2267  Rhs element Vgr protein  28.34 
 
 		 610 aa  73.2  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.267374  hitchhiker  0.000675551 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1216  type VI secretion system Vgr family protein  23.11 
 
 		 683 aa  73.6  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1509  Rhs element Vgr protein  30.69 
 
 		 239 aa  73.2  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1145  Rhs element Vgr protein  24.12 
 
 		 706 aa  73.2  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2360  Rhs element Vgr protein  31.28 
 
 		 618 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2735  Rhs element Vgr protein  21.97 
 
 		 788 aa  73.2  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0298298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1358  VgrG preotein, VgrG-2  25.55 
 
 		 754 aa  72.8  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0023  type VI secretion system Vgr family protein  22.68 
 
 		 885 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1581  Rhs element Vgr protein  21.91 
 
 		 757 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.206829 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0286  Rhs element Vgr protein:Gp5-like  24.26 
 
 		 709 aa  72.8  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.856224 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1374  Rhs element Vgr protein  29.13 
 
 		 916 aa  72  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1486  type VI secretion system Vgr family protein  29.13 
 
 		 922 aa  72  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0985  Rhs element Vgr protein  23.91 
 
 		 843 aa  72  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5744  type VI secretion system Vgr family protein  22.42 
 
 		 920 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1906  Rhs element Vgr protein  28.31 
 
 		 606 aa  72  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0194585  hitchhiker  0.0014616 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1934  hypothetical protein  29.13 
 
 		 874 aa  72  0.00000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.652792  normal  0.85907 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0449  type VI secretion system Vgr family protein  23.43 
 
 		 840 aa  71.6  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.462145  normal  0.972856 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1663  Rhs element Vgr protein  31.29 
 
 		 589 aa  71.6  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.485896  normal  0.191701 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0043  Rhs element Vgr protein  24.48 
 
 		 320 aa  71.6  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0319  Rhs family protein  24.38 
 
 		 729 aa  70.9  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.946115  normal  0.027027 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0065  type VI secretion system Vgr family protein  21.51 
 
 		 822 aa  70.9  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000029  hypothetical protein  32.28 
 
 		 611 aa  70.9  0.00000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2959  hypothetical protein  30 
 
 		 644 aa  70.9  0.00000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027443 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5197  type VI secretion system Vgr family protein  22.42 
 
 		 837 aa  70.5  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0918871 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2550  Rhs element Vgr protein  26.11 
 
 		 589 aa  70.5  0.00000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05870  hypothetical protein  24.38 
 
 		 692 aa  70.1  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0201  type VI secretion system Vgr family protein  23.6 
 
 		 777 aa  70.1  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2329  Rhs element Vgr protein  22.19 
 
 		 968 aa  70.1  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0310  Rhs family protein  23.7 
 
 		 729 aa  69.7  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261642  normal  0.473286 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1932  type VI secretion system Vgr family protein  22.42 
 
 		 918 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2064  type VI secretion system Vgr family protein  23.4 
 
 		 702 aa  69.7  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.201838  normal  0.0713545 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5597  Rhs element Vgr protein  23.69 
 
 		 1118 aa  69.7  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3486  Rhs element Vgr protein  21.4 
 
 		 774 aa  69.3  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.740933  normal  0.610265 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1953  Rhs element Vgr protein  26.52 
 
 		 275 aa  68.6  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0241  Rhs element Vgr protein  23 
 
 		 907 aa  68.9  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2127  Rhs element Vgr protein  21.4 
 
 		 748 aa  68.2  0.0000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.519632 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0650  Rhs element Vgr protein  24.39 
 
 		 727 aa  68.6  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0732792  normal  0.0253872 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>