More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5384 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5384  Rhs element Vgr protein  100 
 
 		 602 aa  1190    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0926  Rhs element Vgr protein  44.28 
 
 		 587 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.91076  normal  0.482817 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2267  Rhs element Vgr protein  45.31 
 
 		 610 aa  453  1.0000000000000001e-126  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.267374  hitchhiker  0.000675551 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1906  Rhs element Vgr protein  45.05 
 
 		 606 aa  451  1e-125  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0194585  hitchhiker  0.0014616 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2945  Rhs element Vgr protein  37.28 
 
 		 589 aa  313  3.9999999999999997e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.703955  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3822  Rhs element Vgr protein  33.5 
 
 		 578 aa  267  5e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.112104  normal  0.0443202 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4390  Rhs element Vgr protein  30.59 
 
 		 652 aa  265  2e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.86257  normal  0.698434 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1626  Rhs element Vgr protein  31.52 
 
 		 592 aa  264  4.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0131276 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2817  Rhs element Vgr protein  32.08 
 
 		 593 aa  262  2e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1663  Rhs element Vgr protein  32.63 
 
 		 589 aa  253  8.000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.485896  normal  0.191701 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1732  Rhs element Vgr protein  28.24 
 
 		 641 aa  228  3e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00520263 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1051  Rhs element Vgr protein  28.96 
 
 		 594 aa  187  5e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26590  hypothetical protein  29.66 
 
 		 599 aa  176  9.999999999999999e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0848935  normal  0.672502 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2462  hypothetical protein  26.33 
 
 		 595 aa  130  7.000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1682  Rhs element Vgr protein  24.95 
 
 		 589 aa  127  7e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0369  Rhs element Vgr protein  26.7 
 
 		 596 aa  125  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0769  Rhs element Vgr protein  33.74 
 
 		 248 aa  119  9.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0983  hypothetical protein  35.4 
 
 		 218 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208742  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3927  Rhs element Vgr protein  25.48 
 
 		 604 aa  117  5e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00332693  hitchhiker  0.00450013 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2550  Rhs element Vgr protein  24.21 
 
 		 589 aa  117  6.9999999999999995e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5250  Rhs element Vgr protein  23.76 
 
 		 596 aa  114  6e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012293 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0676  Rhs element Vgr protein  25.77 
 
 		 596 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3684  Rhs element Vgr protein  36.32 
 
 		 247 aa  110  6e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.149401  hitchhiker  0.000521794 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1509  Rhs element Vgr protein  35.12 
 
 		 239 aa  110  9.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1953  Rhs element Vgr protein  35.42 
 
 		 275 aa  105  2e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1080  hypothetical protein  24.57 
 
 		 599 aa  105  3e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.752206 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3003  Rhs element Vgr protein  25.05 
 
 		 598 aa  104  4e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1564  hypothetical protein  27.62 
 
 		 504 aa  103  9e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.21515 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0669  Rhs element Vgr protein  25.54 
 
 		 576 aa  101  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3931  Rhs element Vgr protein  34.27 
 
 		 616 aa  100  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.410968  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0982  hypothetical protein  27.47 
 
 		 362 aa  99  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1508  phage protein D  27.02 
 
 		 348 aa  99.4  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3155  Rhs element Vgr protein  22.76 
 
 		 581 aa  97.1  9e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0660  hypothetical protein  23.17 
 
 		 605 aa  96.3  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.279373 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4015  Rhs element Vgr protein  30.2 
 
 		 602 aa  93.2  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.211679  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3260  Rhs element Vgr protein  28.51 
 
 		 602 aa  92  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.386521  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1042  phosphoserine phosphatase SerB  25.24 
 
 		 565 aa  91.3  5e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3609  Rhs element Vgr protein  25.97 
 
 		 574 aa  90.5  7e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000128418 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4864  Rhs element Vgr protein  23.29 
 
 		 599 aa  90.5  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0846936  normal  0.155196 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3589  Rhs element Vgr protein  30.33 
 
 		 612 aa  90.1  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.512863 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4109  Rhs element Vgr protein  24.9 
 
 		 576 aa  87.8  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0273732 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3664  hypothetical protein  29.13 
 
 		 360 aa  87.4  6e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000879822 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3666  Rhs element Vgr protein  28.77 
 
 		 226 aa  86.3  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.408922  decreased coverage  0.0000749166 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2892  hypothetical protein  27.19 
 
 		 499 aa  85.5  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0896  Rhs element Vgr protein  20.37 
 
 		 545 aa  85.1  0.000000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.79786 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1040  Rhs element Vgr protein  20.37 
 
 		 545 aa  85.1  0.000000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.605907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0770  Phage protein D-like protein  24.67 
 
 		 341 aa  80.9  0.00000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.737587  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6416  Rhs element Vgr protein  32.65 
 
 		 617 aa  78.2  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3042  hypothetical protein  30.27 
 
 		 361 aa  77.4  0.0000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000069589 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1954  Phage protein D-like protein  26.67 
 
 		 407 aa  77.4  0.0000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3106  hypothetical protein  36.81 
 
 		 618 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.166384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3665  Rhs element Vgr protein  29.96 
 
 		 245 aa  72.4  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.412379  hitchhiker  0.000248141 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2760  type VI secretion system Vgr family protein  26.87 
 
 		 613 aa  71.6  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.68949 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2517  type VI secretion system Vgr family protein  47.3 
 
 		 616 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5894  Rhs element Vgr protein  20.95 
 
 		 615 aa  70.1  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0250  type VI secretion system Vgr family protein  25.89 
 
 		 794 aa  69.3  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1538  two component LuxR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 621 aa  69.3  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2618  Rhs element Vgr protein  45.95 
 
 		 618 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.576781 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2447  type VI secretion system Vgr family protein  31 
 
 		 735 aa  68.6  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.764507  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4347  hypothetical protein  28.57 
 
 		 393 aa  68.9  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.21518  normal  0.0759441 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67230  hypothetical protein  30.9 
 
 		 790 aa  68.9  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4983  Rhs element Vgr protein  45.95 
 
 		 614 aa  68.2  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0764  type VI secretion system Vgr family protein  26.29 
 
 		 741 aa  68.2  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2360  Rhs element Vgr protein  28.05 
 
 		 618 aa  68.2  0.0000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0696  putative VgrG protein  26.29 
 
 		 741 aa  68.2  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2555  hypothetical protein  27.94 
 
 		 273 aa  67.8  0.0000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000216389 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0163  hypothetical protein  24.36 
 
 		 646 aa  67.4  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.766784  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1436  Rhs element Vgr protein  29.13 
 
 		 661 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.064161  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4187  Rhs element Vgr protein  30.29 
 
 		 769 aa  66.6  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1183  Rhs element Vgr protein  45.45 
 
 		 694 aa  66.2  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2014  type VI secretion system Vgr family protein  28.57 
 
 		 753 aa  66.2  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.758033  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0053  type VI secretion system Vgr family protein  27.71 
 
 		 617 aa  66.2  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1212  Rhs element Vgr protein  44.16 
 
 		 699 aa  65.9  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01110  hypothetical protein  23.93 
 
 		 643 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.124023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1194  Rhs element Vgr protein  45.45 
 
 		 655 aa  65.9  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69550  hypothetical protein  30.47 
 
 		 680 aa  66.2  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.256731  normal  0.401785 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3429  Rhs element Vgr protein  38.14 
 
 		 782 aa  65.5  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3558  type VI secretion system Vgr family protein  38.14 
 
 		 782 aa  65.5  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.125148  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2959  hypothetical protein  38.14 
 
 		 644 aa  65.5  0.000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027443 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3960  hypothetical protein  28.04 
 
 		 689 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43080  hypothetical protein  30.47 
 
 		 680 aa  65.5  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000000176027  normal  0.282542 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2094  Rhs element Vgr protein  25.5 
 
 		 646 aa  65.1  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.730907  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1401  Rhs element Vgr protein  28.16 
 
 		 661 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764688  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0648  type VI secretion system Vgr family protein  25.76 
 
 		 609 aa  65.1  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1269  Rhs element Vgr protein  28.16 
 
 		 661 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0412192  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1057  Rhs element Vgr protein  28.16 
 
 		 661 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.517121  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0511  Rhs element Vgr protein  28.16 
 
 		 661 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0240  Rhs element Vgr protein  28.16 
 
 		 661 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2439  type VI secretion system Vgr family protein  24.16 
 
 		 712 aa  64.7  0.000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2568  Rhs element Vgr protein  28.16 
 
 		 661 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0339  putative VgrG protein  40.54 
 
 		 732 aa  63.9  0.000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1320  Rhs element Vgr protein  28.16 
 
 		 661 aa  63.9  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.249702  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0345  type VI secretion system Vgr family protein  25.51 
 
 		 619 aa  63.9  0.000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0169  hypothetical protein  32 
 
 		 741 aa  63.5  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0328  Rhs element Vgr protein  40.54 
 
 		 740 aa  63.5  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1216  type VI secretion system Vgr family protein  28.51 
 
 		 683 aa  63.5  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0401  type VI secretion system Vgr family protein  40.54 
 
 		 740 aa  63.5  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000029  hypothetical protein  24.71 
 
 		 611 aa  63.5  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00256  Rhs-family protein  23.95 
 
 		 645 aa  63.5  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2357  type VI secretion system Vgr family protein  25.97 
 
 		 619 aa  62.8  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.116837 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>