250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2945 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2945  Rhs element Vgr protein  100 
 
 		 589 aa  1176    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.703955  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1906  Rhs element Vgr protein  40.32 
 
 		 606 aa  367  1e-100  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0194585  hitchhiker  0.0014616 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0926  Rhs element Vgr protein  38.99 
 
 		 587 aa  362  7.0000000000000005e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.91076  normal  0.482817 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4390  Rhs element Vgr protein  34.5 
 
 		 652 aa  319  1e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.86257  normal  0.698434 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5384  Rhs element Vgr protein  37.46 
 
 		 602 aa  304  2.0000000000000002e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2267  Rhs element Vgr protein  37.12 
 
 		 610 aa  302  9e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.267374  hitchhiker  0.000675551 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3822  Rhs element Vgr protein  31.9 
 
 		 578 aa  255  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.112104  normal  0.0443202 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2817  Rhs element Vgr protein  31.89 
 
 		 593 aa  218  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1663  Rhs element Vgr protein  30.32 
 
 		 589 aa  211  3e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.485896  normal  0.191701 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1626  Rhs element Vgr protein  25.94 
 
 		 592 aa  172  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0131276 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1732  Rhs element Vgr protein  25.25 
 
 		 641 aa  151  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00520263 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1051  Rhs element Vgr protein  27.55 
 
 		 594 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1682  Rhs element Vgr protein  25.22 
 
 		 589 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2550  Rhs element Vgr protein  25.53 
 
 		 589 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1564  hypothetical protein  29.39 
 
 		 504 aa  120  6e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.21515 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26590  hypothetical protein  27.46 
 
 		 599 aa  116  1.0000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0848935  normal  0.672502 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3664  hypothetical protein  29.79 
 
 		 360 aa  111  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000879822 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0369  Rhs element Vgr protein  25.13 
 
 		 596 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3155  Rhs element Vgr protein  22.5 
 
 		 581 aa  101  5e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2462  hypothetical protein  24.48 
 
 		 595 aa  96.7  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0676  Rhs element Vgr protein  25.72 
 
 		 596 aa  93.6  9e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0982  hypothetical protein  27.46 
 
 		 362 aa  90.5  7e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3927  Rhs element Vgr protein  23.7 
 
 		 604 aa  90.5  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00332693  hitchhiker  0.00450013 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0669  Rhs element Vgr protein  22.73 
 
 		 576 aa  89.7  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1042  phosphoserine phosphatase SerB  23.96 
 
 		 565 aa  90.1  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1953  Rhs element Vgr protein  39.13 
 
 		 275 aa  87.8  5e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3609  Rhs element Vgr protein  25.77 
 
 		 574 aa  87.4  7e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000128418 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0769  Rhs element Vgr protein  30 
 
 		 248 aa  82.8  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5250  Rhs element Vgr protein  23.43 
 
 		 596 aa  83.6  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012293 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4864  Rhs element Vgr protein  26.67 
 
 		 599 aa  79.7  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0846936  normal  0.155196 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0983  hypothetical protein  32.18 
 
 		 218 aa  79  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208742  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1509  Rhs element Vgr protein  28.43 
 
 		 239 aa  79  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6416  Rhs element Vgr protein  23.31 
 
 		 617 aa  78.2  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1080  hypothetical protein  22.18 
 
 		 599 aa  75.9  0.000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.752206 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1508  phage protein D  30.96 
 
 		 348 aa  76.3  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2892  hypothetical protein  26.07 
 
 		 499 aa  73.2  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3666  Rhs element Vgr protein  36.67 
 
 		 226 aa  72.4  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.408922  decreased coverage  0.0000749166 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0770  Phage protein D-like protein  23.93 
 
 		 341 aa  71.2  0.00000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.737587  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0896  Rhs element Vgr protein  21.56 
 
 		 545 aa  70.5  0.00000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.79786 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1040  Rhs element Vgr protein  21.56 
 
 		 545 aa  70.5  0.00000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.605907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1954  Phage protein D-like protein  25.91 
 
 		 407 aa  68.9  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3003  Rhs element Vgr protein  21.44 
 
 		 598 aa  68.2  0.0000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3684  Rhs element Vgr protein  32.12 
 
 		 247 aa  67.8  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.149401  hitchhiker  0.000521794 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3260  Rhs element Vgr protein  28.9 
 
 		 602 aa  65.9  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.386521  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5894  Rhs element Vgr protein  23.28 
 
 		 615 aa  65.9  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0204  Rhs element Vgr protein  37.19 
 
 		 869 aa  65.1  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2254  Rhs element Vgr protein  37.19 
 
 		 875 aa  65.1  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2274  Rhs element Vgr protein  37.19 
 
 		 871 aa  64.3  0.000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0838  Rhs element Vgr protein  38.83 
 
 		 697 aa  63.5  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1145  Rhs element Vgr protein  28.74 
 
 		 706 aa  63.5  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3042  hypothetical protein  27.42 
 
 		 361 aa  62.4  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000069589 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0650  Rhs element Vgr protein  38.83 
 
 		 727 aa  62.4  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0732792  normal  0.0253872 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26600  Rhs element Vgr protein  24.23 
 
 		 687 aa  62  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.417964  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4015  Rhs element Vgr protein  29.32 
 
 		 602 aa  62  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.211679  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0660  hypothetical protein  22.8 
 
 		 605 aa  61.6  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.279373 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3019  type VI secretion system Vgr family protein  27.49 
 
 		 1048 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.103132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0753  phage late control gene D protein GPD  28.14 
 
 		 480 aa  60.8  0.00000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.514992  normal  0.317434 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1726  Rhs element Vgr protein  29.82 
 
 		 642 aa  60.5  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1876  hypothetical protein  25.91 
 
 		 349 aa  60.5  0.00000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.16394  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3931  Rhs element Vgr protein  41.1 
 
 		 616 aa  60.5  0.00000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.410968  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0143  Rhs element Vgr protein  41.98 
 
 		 896 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420233  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000029  hypothetical protein  26.41 
 
 		 611 aa  58.9  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6682  type VI secretion system Vgr family protein  43.21 
 
 		 1057 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1613  Rhs element Vgr protein  41.98 
 
 		 858 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0129  Rhs element Vgr protein  41.98 
 
 		 872 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176404  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0166  Rhs element Vgr protein  41.98 
 
 		 930 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.275346  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0006  type VI secretion system Vgr family protein  27.93 
 
 		 852 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0359048  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0446  Rhs element Vgr protein  29.91 
 
 		 762 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.232565  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2082  Rhs element Vgr protein  29.91 
 
 		 762 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2009  Rhs element Vgr protein  29.91 
 
 		 762 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0709  Rhs element Vgr protein  29.91 
 
 		 762 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.730029  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0740  Rhs element Vgr protein  29.91 
 
 		 762 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1035  Rhs element Vgr protein  29.91 
 
 		 762 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.508183  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0797  Rhs element Vgr protein  29.46 
 
 		 762 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2555  hypothetical protein  29.53 
 
 		 273 aa  57.4  0.0000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000216389 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0352  type VI secretion system Vgr family protein  26.32 
 
 		 1059 aa  57  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3415  Rhs element Vgr protein  30.94 
 
 		 669 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.960838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2517  type VI secretion system Vgr family protein  28.64 
 
 		 616 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0251  Rhs element Vgr protein  39.18 
 
 		 775 aa  55.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.628249  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0796  Rhs element Vgr protein  28.88 
 
 		 763 aa  55.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1901  Rhs element Vgr protein  39.18 
 
 		 775 aa  55.5  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1703  Rhs element Vgr protein  39.18 
 
 		 775 aa  55.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2081  Rhs element Vgr protein  28.88 
 
 		 763 aa  55.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2174  Rhs element Vgr protein  39.18 
 
 		 775 aa  55.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1893  Rhs element Vgr protein  29.17 
 
 		 762 aa  55.8  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0342  Rhs element Vgr protein  39.18 
 
 		 775 aa  55.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.795549  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0434  type VI secretion system Vgr family protein  29.03 
 
 		 1063 aa  55.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000011014 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0707  Rhs element Vgr protein  28.88 
 
 		 763 aa  55.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0912  Rhs element Vgr protein  39.18 
 
 		 775 aa  55.5  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2959  hypothetical protein  36.84 
 
 		 644 aa  55.5  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027443 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1199  Rhs element Vgr protein  39.18 
 
 		 775 aa  55.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0445  Rhs element Vgr protein  28.73 
 
 		 748 aa  55.1  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2010  Rhs element Vgr protein  28.73 
 
 		 748 aa  55.1  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1538  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 621 aa  55.5  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0043  Rhs element Vgr protein  39.73 
 
 		 320 aa  55.5  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0019  type VI secretion system Vgr family protein  26.79 
 
 		 730 aa  55.5  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0741  Rhs element Vgr protein  28.73 
 
 		 748 aa  55.1  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1036  Rhs element Vgr protein  28.73 
 
 		 748 aa  55.1  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.288355  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3558  type VI secretion system Vgr family protein  36.84 
 
 		 782 aa  55.1  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.125148  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3429  Rhs element Vgr protein  36.84 
 
 		 782 aa  55.1  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>