More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3931 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3260  Rhs element Vgr protein  54.33 
 
 		 602 aa  672    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.386521  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3931  Rhs element Vgr protein  100 
 
 		 616 aa  1281    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.410968  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4015  Rhs element Vgr protein  63.02 
 
 		 602 aa  798    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.211679  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5894  Rhs element Vgr protein  26.92 
 
 		 615 aa  211  4e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6416  Rhs element Vgr protein  29.47 
 
 		 617 aa  210  5e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1796  Rhs element Vgr protein  27.77 
 
 		 619 aa  197  6e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0660  hypothetical protein  29.65 
 
 		 605 aa  194  3e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.279373 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3589  Rhs element Vgr protein  23.65 
 
 		 612 aa  138  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.512863 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3220  Rhs element Vgr protein  24.41 
 
 		 618 aa  134  5e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4109  Rhs element Vgr protein  26.09 
 
 		 576 aa  132  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0273732 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4864  Rhs element Vgr protein  25.27 
 
 		 599 aa  125  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0846936  normal  0.155196 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1732  Rhs element Vgr protein  27.02 
 
 		 641 aa  104  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00520263 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0983  hypothetical protein  32.98 
 
 		 218 aa  97.8  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208742  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1191  Rhs element Vgr protein  25.1 
 
 		 703 aa  97.1  8e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5384  Rhs element Vgr protein  33.15 
 
 		 602 aa  95.5  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0769  Rhs element Vgr protein  30.49 
 
 		 248 aa  95.1  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1626  Rhs element Vgr protein  35.29 
 
 		 592 aa  91.7  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0131276 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3822  Rhs element Vgr protein  25.24 
 
 		 578 aa  91.7  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.112104  normal  0.0443202 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1269  Rhs element Vgr protein  22.74 
 
 		 661 aa  90.9  6e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0412192  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1057  Rhs element Vgr protein  22.74 
 
 		 661 aa  90.9  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.517121  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0511  Rhs element Vgr protein  22.74 
 
 		 661 aa  90.9  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0240  Rhs element Vgr protein  22.74 
 
 		 661 aa  90.9  6e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1401  Rhs element Vgr protein  22.56 
 
 		 661 aa  90.5  9e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764688  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1320  Rhs element Vgr protein  22.38 
 
 		 661 aa  89.7  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.249702  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2568  Rhs element Vgr protein  22.38 
 
 		 661 aa  89  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1436  Rhs element Vgr protein  22.9 
 
 		 661 aa  89  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.064161  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2094  Rhs element Vgr protein  26.4 
 
 		 646 aa  85.9  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.730907  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2267  Rhs element Vgr protein  31.18 
 
 		 610 aa  85.1  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.267374  hitchhiker  0.000675551 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1726  Rhs element Vgr protein  23.14 
 
 		 642 aa  83.2  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1374  Rhs element Vgr protein  24.05 
 
 		 916 aa  83.2  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1486  type VI secretion system Vgr family protein  24.05 
 
 		 922 aa  83.2  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1934  hypothetical protein  24.05 
 
 		 874 aa  83.2  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.652792  normal  0.85907 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2817  Rhs element Vgr protein  31.44 
 
 		 593 aa  82.4  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1509  Rhs element Vgr protein  32.32 
 
 		 239 aa  81.6  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0926  Rhs element Vgr protein  46.25 
 
 		 587 aa  81.3  0.00000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.91076  normal  0.482817 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1906  Rhs element Vgr protein  31.05 
 
 		 606 aa  80.5  0.00000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0194585  hitchhiker  0.0014616 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5250  Rhs element Vgr protein  32.83 
 
 		 596 aa  80.5  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012293 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4429  Rhs element Vgr protein  24.45 
 
 		 724 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5985  type VI secretion system Vgr family protein  22.8 
 
 		 641 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2360  Rhs element Vgr protein  29.65 
 
 		 618 aa  78.6  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1953  Rhs element Vgr protein  41.18 
 
 		 275 aa  79  0.0000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1538  two component LuxR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 621 aa  78.6  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1663  Rhs element Vgr protein  25.06 
 
 		 589 aa  78.2  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.485896  normal  0.191701 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3609  Rhs element Vgr protein  28.57 
 
 		 574 aa  77.8  0.0000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000128418 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2788  type VI secretion system Vgr family protein  21.84 
 
 		 889 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.154315 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0676  Rhs element Vgr protein  27.62 
 
 		 596 aa  76.3  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01965  hypothetical protein  22.59 
 
 		 771 aa  75.5  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1682  Rhs element Vgr protein  27.75 
 
 		 589 aa  74.7  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33960  hypothetical protein  29.48 
 
 		 668 aa  75.1  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000148732  normal  0.101757 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1042  phosphoserine phosphatase SerB  27.59 
 
 		 565 aa  74.7  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2888  hypothetical protein  28.78 
 
 		 668 aa  73.9  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.882104  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3177  Rhs family protein  29.02 
 
 		 697 aa  73.9  0.000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2550  Rhs element Vgr protein  26.99 
 
 		 589 aa  73.2  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0394  Rhs element Vgr protein  43.84 
 
 		 811 aa  72.8  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.787309 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000448  VgrG protein  22.61 
 
 		 692 aa  72.8  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000107078  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6682  type VI secretion system Vgr family protein  23.56 
 
 		 1057 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0391  Rhs element Vgr protein  43.84 
 
 		 1094 aa  72  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.437245 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3415  Rhs element Vgr protein  23.73 
 
 		 669 aa  72.4  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.960838  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26600  Rhs element Vgr protein  24.69 
 
 		 687 aa  72  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.417964  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3684  Rhs element Vgr protein  33.51 
 
 		 247 aa  71.6  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.149401  hitchhiker  0.000521794 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01110  hypothetical protein  23.79 
 
 		 643 aa  71.6  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.124023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2618  Rhs element Vgr protein  24.6 
 
 		 618 aa  71.2  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.576781 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3133  Rhs element Vgr protein  22.66 
 
 		 767 aa  70.9  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.054847  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000029  hypothetical protein  31.52 
 
 		 611 aa  70.5  0.00000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0129  Rhs element Vgr protein  23.65 
 
 		 872 aa  70.5  0.00000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176404  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4080  Rhs element Vgr protein  23.11 
 
 		 853 aa  70.1  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2744  type VI secretion system Vgr family protein  23.44 
 
 		 851 aa  70.1  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01160  hypothetical protein  25.24 
 
 		 741 aa  70.1  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29390  hypothetical protein  24.05 
 
 		 689 aa  70.1  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0531  type VI secretion system Vgr family protein  28.83 
 
 		 1003 aa  69.7  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0023  type VI secretion system Vgr family protein  21.48 
 
 		 885 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0250  type VI secretion system Vgr family protein  23.27 
 
 		 794 aa  69.3  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1613  Rhs element Vgr protein  23.24 
 
 		 858 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50870  Rhs element Vgr protein  27.36 
 
 		 668 aa  69.3  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3019  type VI secretion system Vgr family protein  23.53 
 
 		 1048 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.103132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2357  type VI secretion system Vgr family protein  22.86 
 
 		 619 aa  69.3  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.116837 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0166  Rhs element Vgr protein  23.24 
 
 		 930 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.275346  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0143  Rhs element Vgr protein  23.24 
 
 		 896 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420233  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3960  hypothetical protein  24.7 
 
 		 689 aa  68.6  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3489  hypothetical protein  22.29 
 
 		 767 aa  68.6  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.159566  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0286  Rhs element Vgr protein:Gp5-like  31 
 
 		 709 aa  68.9  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.856224 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0669  Rhs element Vgr protein  31.29 
 
 		 576 aa  68.2  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0319  Rhs family protein  25.83 
 
 		 729 aa  67.8  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.946115  normal  0.027027 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26590  hypothetical protein  41.56 
 
 		 599 aa  67.8  0.0000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0848935  normal  0.672502 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_36  VgrG protein, VgrG-2  31.91 
 
 		 754 aa  67.4  0.0000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01940  putative VGR-related protein  29.75 
 
 		 1006 aa  67.4  0.0000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1932  type VI secretion system Vgr family protein  21.23 
 
 		 918 aa  67.4  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04687  putative VGR-related protein  31.01 
 
 		 962 aa  67  0.0000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0163  hypothetical protein  23.03 
 
 		 646 aa  67  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.766784  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2332  Rhs element Vgr protein  32.82 
 
 		 741 aa  67  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00996193  normal  0.0126654 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5744  type VI secretion system Vgr family protein  20.97 
 
 		 920 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2760  type VI secretion system Vgr family protein  24.2 
 
 		 613 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.68949 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0310  Rhs family protein  25.59 
 
 		 729 aa  66.2  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261642  normal  0.473286 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3558  type VI secretion system Vgr family protein  31.67 
 
 		 782 aa  65.1  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.125148  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2959  hypothetical protein  31.67 
 
 		 644 aa  65.1  0.000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027443 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5197  type VI secretion system Vgr family protein  20.97 
 
 		 837 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0918871 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2014  type VI secretion system Vgr family protein  28.44 
 
 		 753 aa  65.1  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.758033  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3429  Rhs element Vgr protein  31.67 
 
 		 782 aa  65.1  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4080  type VI secretion system Vgr family protein  32.5 
 
 		 771 aa  65.5  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000279673 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2182  Rhs element Vgr protein  30.13 
 
 		 911 aa  65.1  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.368954  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>