More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2817 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2817  Rhs element Vgr protein  100 
 
 		 593 aa  1204    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1663  Rhs element Vgr protein  76.56 
 
 		 589 aa  932    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.485896  normal  0.191701 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1626  Rhs element Vgr protein  38.42 
 
 		 592 aa  378  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0131276 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1732  Rhs element Vgr protein  32.61 
 
 		 641 aa  314  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00520263 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1906  Rhs element Vgr protein  35.38 
 
 		 606 aa  290  5.0000000000000004e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0194585  hitchhiker  0.0014616 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0926  Rhs element Vgr protein  33.72 
 
 		 587 aa  284  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.91076  normal  0.482817 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3822  Rhs element Vgr protein  32.99 
 
 		 578 aa  269  1e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.112104  normal  0.0443202 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2267  Rhs element Vgr protein  30.81 
 
 		 610 aa  256  1.0000000000000001e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.267374  hitchhiker  0.000675551 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5384  Rhs element Vgr protein  31.59 
 
 		 602 aa  249  1e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1051  Rhs element Vgr protein  31.91 
 
 		 594 aa  226  6e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2945  Rhs element Vgr protein  31.89 
 
 		 589 aa  203  7e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.703955  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3155  Rhs element Vgr protein  26.37 
 
 		 581 aa  189  2e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3609  Rhs element Vgr protein  26.35 
 
 		 574 aa  180  5.999999999999999e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000128418 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3664  hypothetical protein  35.82 
 
 		 360 aa  179  1e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000879822 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5250  Rhs element Vgr protein  28.55 
 
 		 596 aa  175  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012293 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26590  hypothetical protein  29.79 
 
 		 599 aa  170  8e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0848935  normal  0.672502 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1564  hypothetical protein  27.36 
 
 		 504 aa  168  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.21515 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4390  Rhs element Vgr protein  27.75 
 
 		 652 aa  166  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.86257  normal  0.698434 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2892  hypothetical protein  30 
 
 		 499 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2462  hypothetical protein  26.18 
 
 		 595 aa  163  7e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1508  phage protein D  30.12 
 
 		 348 aa  159  1e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0676  Rhs element Vgr protein  25.51 
 
 		 596 aa  158  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2550  Rhs element Vgr protein  26.01 
 
 		 589 aa  151  3e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1042  phosphoserine phosphatase SerB  25.13 
 
 		 565 aa  151  4e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0982  hypothetical protein  31.55 
 
 		 362 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0983  hypothetical protein  37.99 
 
 		 218 aa  147  6e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208742  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0369  Rhs element Vgr protein  26.54 
 
 		 596 aa  146  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0660  hypothetical protein  26.33 
 
 		 605 aa  145  2e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.279373 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1682  Rhs element Vgr protein  24.54 
 
 		 589 aa  144  5e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1509  Rhs element Vgr protein  36.72 
 
 		 239 aa  143  8e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0769  Rhs element Vgr protein  32.93 
 
 		 248 aa  139  1e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3927  Rhs element Vgr protein  26.08 
 
 		 604 aa  139  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00332693  hitchhiker  0.00450013 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3003  Rhs element Vgr protein  26.1 
 
 		 598 aa  137  4e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0669  Rhs element Vgr protein  25.1 
 
 		 576 aa  135  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3684  Rhs element Vgr protein  40 
 
 		 247 aa  129  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.149401  hitchhiker  0.000521794 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6416  Rhs element Vgr protein  26.67 
 
 		 617 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1080  hypothetical protein  26.15 
 
 		 599 aa  122  1.9999999999999998e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.752206 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1954  Phage protein D-like protein  27 
 
 		 407 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4864  Rhs element Vgr protein  26.06 
 
 		 599 aa  115  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0846936  normal  0.155196 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0896  Rhs element Vgr protein  23.65 
 
 		 545 aa  110  5e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.79786 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1040  Rhs element Vgr protein  23.65 
 
 		 545 aa  110  5e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.605907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5894  Rhs element Vgr protein  26.91 
 
 		 615 aa  110  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1953  Rhs element Vgr protein  32.93 
 
 		 275 aa  108  3e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1869  hypothetical protein  28.04 
 
 		 406 aa  108  3e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3666  Rhs element Vgr protein  34.1 
 
 		 226 aa  107  5e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.408922  decreased coverage  0.0000749166 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3260  Rhs element Vgr protein  32.99 
 
 		 602 aa  100  6e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.386521  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3043  Rhs element Vgr protein  34.21 
 
 		 229 aa  100  6e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000160638 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0770  Phage protein D-like protein  29.96 
 
 		 341 aa  100  8e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.737587  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3589  Rhs element Vgr protein  23.69 
 
 		 612 aa  95.9  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.512863 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1726  Rhs element Vgr protein  24.92 
 
 		 642 aa  94.4  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4187  Rhs element Vgr protein  24.42 
 
 		 769 aa  90.9  7e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4109  Rhs element Vgr protein  22.59 
 
 		 576 aa  90.5  7e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0273732 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33960  hypothetical protein  24.03 
 
 		 668 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000148732  normal  0.101757 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4347  hypothetical protein  26.2 
 
 		 393 aa  88.2  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.21518  normal  0.0759441 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3665  Rhs element Vgr protein  42.06 
 
 		 245 aa  87.4  6e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.412379  hitchhiker  0.000248141 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2094  Rhs element Vgr protein  24.95 
 
 		 646 aa  87  9e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.730907  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2014  type VI secretion system Vgr family protein  22.35 
 
 		 753 aa  85.5  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.758033  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3042  hypothetical protein  27.36 
 
 		 361 aa  84.7  0.000000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000069589 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0938  Phage protein D-like  24.8 
 
 		 427 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0367858  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2439  type VI secretion system Vgr family protein  23.25 
 
 		 712 aa  83.6  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3931  Rhs element Vgr protein  31.44 
 
 		 616 aa  82.4  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.410968  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1138  hypothetical protein  30.48 
 
 		 270 aa  81.6  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1796  Rhs element Vgr protein  22.92 
 
 		 619 aa  81.3  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1876  hypothetical protein  24.28 
 
 		 349 aa  80.9  0.00000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.16394  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2555  hypothetical protein  28.28 
 
 		 273 aa  79.7  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000216389 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3220  Rhs element Vgr protein  23.16 
 
 		 618 aa  79.3  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3822  phage protein D-like  23.8 
 
 		 427 aa  79  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3415  Rhs element Vgr protein  26.52 
 
 		 669 aa  78.2  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.960838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1883  Phage protein D-like  24.53 
 
 		 427 aa  78.2  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.109131  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1137  hypothetical protein  27.35 
 
 		 381 aa  77.8  0.0000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4015  Rhs element Vgr protein  23.04 
 
 		 602 aa  77  0.0000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.211679  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1875  hypothetical protein  29.67 
 
 		 212 aa  76.6  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.133633  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2447  type VI secretion system Vgr family protein  24.26 
 
 		 735 aa  76.3  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.764507  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5985  type VI secretion system Vgr family protein  24.23 
 
 		 641 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2760  type VI secretion system Vgr family protein  28.06 
 
 		 613 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.68949 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0250  type VI secretion system Vgr family protein  23.68 
 
 		 794 aa  70.9  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1868  hypothetical protein  32.85 
 
 		 216 aa  70.1  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2888  hypothetical protein  24.93 
 
 		 668 aa  70.1  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.882104  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0853  hypothetical protein  28.05 
 
 		 193 aa  69.7  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0663  hypothetical protein  28.05 
 
 		 193 aa  68.2  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00256  Rhs-family protein  25.9 
 
 		 645 aa  68.2  0.0000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0838  Rhs element Vgr protein  25.47 
 
 		 697 aa  67.8  0.0000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3778  type VI secretion system Vgr family protein  24.47 
 
 		 796 aa  65.9  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.938556  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1145  Rhs element Vgr protein  24.11 
 
 		 706 aa  65.1  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0852  putative phage late control gene D protein  21.97 
 
 		 417 aa  64.3  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2332  Rhs element Vgr protein  23.55 
 
 		 741 aa  64.3  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00996193  normal  0.0126654 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0497  Rhs element Vgr protein  21.9 
 
 		 841 aa  64.3  0.000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50870  Rhs element Vgr protein  23.85 
 
 		 668 aa  63.9  0.000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0662  putative phage late control gene D protein  22.25 
 
 		 417 aa  63.9  0.000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1748  hypothetical protein  29.3 
 
 		 275 aa  63.9  0.000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.499382  normal  0.986681 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3752  Rhs element Vgr protein  23.4 
 
 		 755 aa  63.5  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.617325 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0650  Rhs element Vgr protein  23.4 
 
 		 727 aa  63.2  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0732792  normal  0.0253872 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3783  Rhs element Vgr protein  24.38 
 
 		 785 aa  63.2  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.757692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3347  Rhs element Vgr protein  21 
 
 		 841 aa  62.4  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.57735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4009  Rhs element Vgr protein  23.05 
 
 		 756 aa  62.4  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0849352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1581  Rhs element Vgr protein  25.62 
 
 		 757 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.206829 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2840  Rhs element Vgr protein  21.64 
 
 		 838 aa  62.8  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.363054  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1502  type VI secretion system Vgr family protein  23.21 
 
 		 617 aa  62.8  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0043  Rhs element Vgr protein  26.4 
 
 		 320 aa  62.4  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0481  Rhs element Vgr protein  21 
 
 		 841 aa  62.4  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>