39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0852 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_0662  putative phage late control gene D protein  95.92 
 
 		 417 aa  798    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0852  putative phage late control gene D protein  100 
 
 		 417 aa  833    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3822  phage protein D-like  27.42 
 
 		 427 aa  134  3e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0938  Phage protein D-like  27.15 
 
 		 427 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0367858  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1883  Phage protein D-like  27.15 
 
 		 427 aa  124  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.109131  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0982  hypothetical protein  25.87 
 
 		 362 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1508  phage protein D  23.22 
 
 		 348 aa  70.5  0.00000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1663  Rhs element Vgr protein  25.15 
 
 		 589 aa  68.2  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.485896  normal  0.191701 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1732  Rhs element Vgr protein  22.74 
 
 		 641 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00520263 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2817  Rhs element Vgr protein  21.97 
 
 		 593 aa  64.3  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1572  late control D family protein  23.16 
 
 		 386 aa  62.4  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.303406  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2556  hypothetical protein  27.92 
 
 		 379 aa  59.3  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000358753 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1216  phage late control D family protein  22.56 
 
 		 339 aa  58.5  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0770  Phage protein D-like protein  23.58 
 
 		 341 aa  58.9  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.737587  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0753  phage late control gene D protein GPD  24.43 
 
 		 480 aa  57.4  0.0000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.514992  normal  0.317434 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2892  hypothetical protein  25.75 
 
 		 499 aa  54.3  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2890  late control D family protein  23.45 
 
 		 384 aa  54.3  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.198906  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0567  prophage P2W3, tail protein D, putative  22.52 
 
 		 314 aa  53.9  0.000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.502953  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3318  phage late control D  24.53 
 
 		 361 aa  52.4  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1137  hypothetical protein  27.95 
 
 		 381 aa  52  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2550  Rhs element Vgr protein  23.57 
 
 		 589 aa  51.6  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1818  hypothetical protein  25.09 
 
 		 352 aa  50.4  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4546  gp47  23.01 
 
 		 347 aa  47.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.494674 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0926  Rhs element Vgr protein  23.08 
 
 		 587 aa  47.4  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.91076  normal  0.482817 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5384  Rhs element Vgr protein  24.83 
 
 		 602 aa  46.2  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2289  phage late control D family protein  20.08 
 
 		 384 aa  45.8  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.775888  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2267  Rhs element Vgr protein  26.01 
 
 		 610 aa  46.2  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.267374  hitchhiker  0.000675551 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1815  hypothetical protein  26.65 
 
 		 384 aa  45.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.553808 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1682  Rhs element Vgr protein  23.03 
 
 		 589 aa  45.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4462  gp21  22.65 
 
 		 347 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4547  gp47  22.71 
 
 		 347 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.92987 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2371  phage late control D  23.77 
 
 		 356 aa  45.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1906  Rhs element Vgr protein  27.84 
 
 		 606 aa  44.7  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0194585  hitchhiker  0.0014616 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3664  hypothetical protein  25.09 
 
 		 360 aa  45.1  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000879822 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1954  Phage protein D-like protein  21.52 
 
 		 407 aa  44.7  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4961  hypothetical protein  36.36 
 
 		 550 aa  43.1  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.645722  normal  0.107979 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2487  phage late control gene D protein  28.14 
 
 		 366 aa  43.1  0.009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0948  phage late control gene D protein  28.14 
 
 		 366 aa  43.1  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.210048  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2911  prophage MuMc02, late control gene D protein, putative  24.85 
 
 		 347 aa  43.1  0.009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>