27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1137 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1137  hypothetical protein  100 
 
 		 381 aa  764    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2556  hypothetical protein  50.27 
 
 		 379 aa  365  1e-100  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000358753 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1749  hypothetical protein  48.45 
 
 		 384 aa  328  7e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.698415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1815  hypothetical protein  29.4 
 
 		 384 aa  107  4e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.553808 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2817  Rhs element Vgr protein  27.35 
 
 		 593 aa  77.8  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0669  Rhs element Vgr protein  24.93 
 
 		 576 aa  77.8  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1494  hypothetical protein  26.33 
 
 		 375 aa  76.6  0.0000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1663  Rhs element Vgr protein  27.16 
 
 		 589 aa  67.8  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.485896  normal  0.191701 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3155  Rhs element Vgr protein  22.51 
 
 		 581 aa  62  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1818  hypothetical protein  22.61 
 
 		 352 aa  61.2  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0369  Rhs element Vgr protein  26.11 
 
 		 596 aa  60.5  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1883  Phage protein D-like  23 
 
 		 427 aa  57.8  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.109131  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0938  Phage protein D-like  23.32 
 
 		 427 aa  58.2  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0367858  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2550  Rhs element Vgr protein  21.27 
 
 		 589 aa  57  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3003  Rhs element Vgr protein  24.32 
 
 		 598 aa  56.6  0.0000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3822  phage protein D-like  22.91 
 
 		 427 aa  54.3  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0854  hypothetical protein  46.55 
 
 		 380 aa  54.3  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1682  Rhs element Vgr protein  21.82 
 
 		 589 aa  53.1  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0852  putative phage late control gene D protein  27.95 
 
 		 417 aa  52.4  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2267  Rhs element Vgr protein  38 
 
 		 610 aa  52  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.267374  hitchhiker  0.000675551 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0982  hypothetical protein  24.36 
 
 		 362 aa  50.8  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0822  hypothetical protein  23.13 
 
 		 371 aa  50.1  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0662  putative phage late control gene D protein  28.63 
 
 		 417 aa  48.9  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5250  Rhs element Vgr protein  22.67 
 
 		 596 aa  46.6  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012293 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3927  Rhs element Vgr protein  19.5 
 
 		 604 aa  44.7  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00332693  hitchhiker  0.00450013 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3609  Rhs element Vgr protein  24.26 
 
 		 574 aa  43.1  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000128418 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2462  hypothetical protein  25.53 
 
 		 595 aa  42.7  0.01  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>