18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2556 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2556  hypothetical protein  100 
 
 		 379 aa  766    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000358753 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1137  hypothetical protein  50.27 
 
 		 381 aa  366  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1749  hypothetical protein  44.91 
 
 		 384 aa  291  1e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.698415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1815  hypothetical protein  28.74 
 
 		 384 aa  87  5e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.553808 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1494  hypothetical protein  27.09 
 
 		 375 aa  76.3  0.0000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0938  Phage protein D-like  25.63 
 
 		 427 aa  62  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0367858  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1883  Phage protein D-like  25.32 
 
 		 427 aa  60.5  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.109131  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3822  phage protein D-like  25 
 
 		 427 aa  59.7  0.00000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0852  putative phage late control gene D protein  27.92 
 
 		 417 aa  59.3  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1818  hypothetical protein  24.17 
 
 		 352 aa  57.4  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0662  putative phage late control gene D protein  27.56 
 
 		 417 aa  56.6  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1663  Rhs element Vgr protein  25.82 
 
 		 589 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.485896  normal  0.191701 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0669  Rhs element Vgr protein  23.71 
 
 		 576 aa  54.7  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0982  hypothetical protein  24.24 
 
 		 362 aa  52.8  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0822  hypothetical protein  22.7 
 
 		 371 aa  47.8  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1954  Phage protein D-like protein  21.88 
 
 		 407 aa  48.1  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0854  hypothetical protein  41.38 
 
 		 380 aa  45.1  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1682  Rhs element Vgr protein  23.78 
 
 		 589 aa  43.5  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>