40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1883 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0938  Phage protein D-like  96.49 
 
 		 427 aa  851    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0367858  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1883  Phage protein D-like  100 
 
 		 427 aa  875    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.109131  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3822  phage protein D-like  95.55 
 
 		 427 aa  846    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0662  putative phage late control gene D protein  26.65 
 
 		 417 aa  130  6e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0852  putative phage late control gene D protein  27.15 
 
 		 417 aa  124  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0982  hypothetical protein  26.63 
 
 		 362 aa  93.6  6e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2817  Rhs element Vgr protein  24.53 
 
 		 593 aa  78.2  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1663  Rhs element Vgr protein  23.68 
 
 		 589 aa  72.8  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.485896  normal  0.191701 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1869  hypothetical protein  22.72 
 
 		 406 aa  70.9  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1508  phage protein D  27.3 
 
 		 348 aa  67.4  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1682  Rhs element Vgr protein  24.38 
 
 		 589 aa  64.7  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2550  Rhs element Vgr protein  23.77 
 
 		 589 aa  62.4  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0676  Rhs element Vgr protein  22.07 
 
 		 596 aa  62  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1954  Phage protein D-like protein  22.62 
 
 		 407 aa  61.6  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2556  hypothetical protein  25.32 
 
 		 379 aa  60.5  0.00000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000358753 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4347  hypothetical protein  34.25 
 
 		 393 aa  56.6  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.21518  normal  0.0759441 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1137  hypothetical protein  22.33 
 
 		 381 aa  56.2  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1749  hypothetical protein  22.82 
 
 		 384 aa  55.8  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.698415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0369  Rhs element Vgr protein  22.04 
 
 		 596 aa  53.5  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1626  Rhs element Vgr protein  24.92 
 
 		 592 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0131276 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0770  Phage protein D-like protein  21.09 
 
 		 341 aa  52  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.737587  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5250  Rhs element Vgr protein  20.94 
 
 		 596 aa  51.2  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012293 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1732  Rhs element Vgr protein  26.13 
 
 		 641 aa  50.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00520263 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2842  phage late control D family protein  25.35 
 
 		 366 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1572  late control D family protein  21.93 
 
 		 386 aa  48.5  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.303406  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2911  prophage MuMc02, late control gene D protein, putative  23.34 
 
 		 347 aa  48.9  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1359  phage late control D family protein  28.64 
 
 		 366 aa  48.9  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3025  phage late control D family protein  25.89 
 
 		 366 aa  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00666291 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3003  Rhs element Vgr protein  21.21 
 
 		 598 aa  48.1  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2890  late control D family protein  22.73 
 
 		 384 aa  47  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.198906  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3664  hypothetical protein  23.38 
 
 		 360 aa  46.2  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000879822 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0669  Rhs element Vgr protein  21.24 
 
 		 576 aa  45.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0926  Rhs element Vgr protein  24.75 
 
 		 587 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.91076  normal  0.482817 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4546  gp47  26.15 
 
 		 347 aa  43.9  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.494674 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4547  gp47  27.04 
 
 		 347 aa  43.9  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.92987 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4390  Rhs element Vgr protein  24.27 
 
 		 652 aa  44.3  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.86257  normal  0.698434 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4389  late control gene D protein  28.19 
 
 		 389 aa  43.9  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.725346  normal  0.0652944 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4462  gp21  25.64 
 
 		 347 aa  43.5  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2487  phage late control gene D protein  27.49 
 
 		 366 aa  43.1  0.009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2267  Rhs element Vgr protein  20.27 
 
 		 610 aa  43.1  0.01  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.267374  hitchhiker  0.000675551 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>