84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A3025 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009800  EcHS_A0948  phage late control gene D protein  85.25 
 
 		 366 aa  640    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.210048  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2487  phage late control gene D protein  85.79 
 
 		 366 aa  642    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2751  late control D family protein  84.97 
 
 		 366 aa  638    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000516519 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2842  phage late control D family protein  97.81 
 
 		 366 aa  734    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3025  phage late control D family protein  100 
 
 		 366 aa  749    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00666291 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1359  phage late control D family protein  90.71 
 
 		 366 aa  686    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2352  late control D family protein  65.35 
 
 		 364 aa  483  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.065296  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2193  late control gene D protein  65.07 
 
 		 364 aa  483  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2305  late control D family protein  64.51 
 
 		 364 aa  479  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3198  late control D family protein  54.42 
 
 		 382 aa  402  1e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000789216  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4389  late control gene D protein  53.35 
 
 		 389 aa  401  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.725346  normal  0.0652944 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3024  phage late control gene D protein  52.15 
 
 		 387 aa  393  1e-108  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.051519 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0998  phage late control gene D protein  51.89 
 
 		 387 aa  390  1e-107  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.780637  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4351  phage late control gene D protein  51.35 
 
 		 387 aa  388  1e-107  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.395546 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3476  phage late control D family protein  51.76 
 
 		 387 aa  376  1e-103  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.216601  normal  0.122645 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4862  late control D family protein  52.75 
 
 		 383 aa  363  2e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0171627  normal  0.29405 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0179  late control D family protein  53.62 
 
 		 383 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.457524  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2665  late control D family protein  54.75 
 
 		 377 aa  360  2e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.132861  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2889  late control D family protein  47.89 
 
 		 375 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0857  late control D family protein  46.67 
 
 		 363 aa  327  2.0000000000000001e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000149579  hitchhiker  0.00128029 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1912  hypothetical protein  44.93 
 
 		 374 aa  317  2e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0970485  normal  0.714106 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3315  phage late control D family protein  43.97 
 
 		 344 aa  301  1e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.154413  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37340  Phage late control gene D protein-like protein  44.6 
 
 		 402 aa  296  3e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1372  phage late control D  43.52 
 
 		 338 aa  294  2e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.475376  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01338  bacteriophage P2 gpD protein  44.61 
 
 		 328 aa  290  2e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.405212  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1809  late control D family protein  39.47 
 
 		 391 aa  276  5e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000332404  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1325  fels-2 prophage protein  42.12 
 
 		 366 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.370429  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2620  late control D family protein  39.42 
 
 		 333 aa  255  9e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000538396  hitchhiker  0.00000000174337 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2586  late control D family protein  39.42 
 
 		 333 aa  255  9e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000462859  hitchhiker  0.00000849595 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2105  late control D family protein  35.29 
 
 		 401 aa  239  4e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0758552  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00856  hypothetical protein  93.64 
 
 		 122 aa  217  2e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00850  putative regulator of late gene expression  93.64 
 
 		 122 aa  217  2e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08150  putative phage late control gene D protein  35.38 
 
 		 329 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000948229  hitchhiker  0.000300765 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1218  late control D family protein  34.5 
 
 		 347 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.868183  hitchhiker  0.000188343 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3390  tail protein D  33.92 
 
 		 347 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.231627  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3065  pyocin R2_PP, tail formation  32.16 
 
 		 347 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.561868  normal  0.32013 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1854  phage late control D family protein  31.47 
 
 		 349 aa  172  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.491572  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0772  tail protein D  33.33 
 
 		 331 aa  170  3e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.325808  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1278  phage late control D  32.49 
 
 		 332 aa  163  6e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.487247 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32130  Phage late control D protein  39.34 
 
 		 274 aa  158  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1918  pyocin R2_PP, tail formation  32.82 
 
 		 350 aa  157  3e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.319398  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1130  phage-related tail protein  31.73 
 
 		 360 aa  154  2.9999999999999998e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0391  phage-related tail protein  31.73 
 
 		 360 aa  154  2.9999999999999998e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1152  late control D family protein  31.44 
 
 		 360 aa  150  2e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4034  late control D family protein  35.26 
 
 		 344 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.356651  unclonable  0.0000000000000337876 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2289  phage late control D family protein  36.08 
 
 		 384 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.775888  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3359  Phage tail protein D  37.39 
 
 		 324 aa  145  2e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0567  prophage P2W3, tail protein D, putative  29.19 
 
 		 314 aa  145  2e-33  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.502953  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3003  phage late control D family protein  31.58 
 
 		 324 aa  143  4e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0881  late control D family protein  29.46 
 
 		 357 aa  142  7e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0986779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3318  phage late control D  27.3 
 
 		 361 aa  133  5e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2045  late control D family protein  35.02 
 
 		 373 aa  131  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0753  phage late control gene D protein GPD  27.68 
 
 		 480 aa  126  8.000000000000001e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.514992  normal  0.317434 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2371  phage late control D  26.96 
 
 		 356 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1623  phage-related tail protein  27.84 
 
 		 325 aa  108  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2890  late control D family protein  27.07 
 
 		 384 aa  106  8e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.198906  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1572  late control D family protein  28.21 
 
 		 386 aa  105  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.303406  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0700  Phage protein D-like  23.51 
 
 		 328 aa  100  3e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2506  phage late control D family protein  25.15 
 
 		 338 aa  97.8  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02002  hypothetical protein  30.41 
 
 		 337 aa  96.3  7e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1151  Phage protein D-like  32.24 
 
 		 342 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0185813  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0254  tail protein D, putative  24.3 
 
 		 325 aa  95.1  2e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2678  putative tail protein  60.27 
 
 		 107 aa  86.3  8e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.705828  normal  0.016098 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0698  late control D family protein  27.71 
 
 		 358 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4910  late control D family protein  24.79 
 
 		 329 aa  83.6  0.000000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.642723 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4546  gp47  27.12 
 
 		 347 aa  83.2  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.494674 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0355  late control D family protein  29.02 
 
 		 229 aa  82  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4547  gp47  26.55 
 
 		 347 aa  81.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.92987 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4462  gp21  27.12 
 
 		 347 aa  81.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2347  hypothetical protein  24.85 
 
 		 337 aa  75.5  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0628868  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1216  phage late control D family protein  23.84 
 
 		 339 aa  74.3  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2911  prophage MuMc02, late control gene D protein, putative  27.84 
 
 		 347 aa  72.4  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1485  phage late control D family protein  23.28 
 
 		 371 aa  69.7  0.00000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0928  Phage protein D-like protein  25.84 
 
 		 362 aa  62  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4124  late control D family protein  29.65 
 
 		 358 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.442041 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0570  late control D family protein  25.7 
 
 		 342 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0938  Phage protein D-like  26.24 
 
 		 427 aa  50.8  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0367858  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1883  Phage protein D-like  25.89 
 
 		 427 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.109131  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2267  Rhs element Vgr protein  23.55 
 
 		 610 aa  48.5  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.267374  hitchhiker  0.000675551 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3822  phage protein D-like  25.53 
 
 		 427 aa  45.8  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1040  Rhs element Vgr protein  26.83 
 
 		 545 aa  45.8  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.605907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0896  Rhs element Vgr protein  26.83 
 
 		 545 aa  45.8  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.79786 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1906  Rhs element Vgr protein  27.37 
 
 		 606 aa  43.9  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0194585  hitchhiker  0.0014616 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3664  hypothetical protein  29.03 
 
 		 360 aa  43.1  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000879822 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>