38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_00850 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00850  putative regulator of late gene expression  100 
 
 		 122 aa  253  4e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00856  hypothetical protein  100 
 
 		 122 aa  253  4e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0948  phage late control gene D protein  98.36 
 
 		 366 aa  251  3e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.210048  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2487  phage late control gene D protein  98.36 
 
 		 366 aa  251  3e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2842  phage late control D family protein  88.52 
 
 		 366 aa  229  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2751  late control D family protein  98.18 
 
 		 366 aa  227  4e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000516519 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3025  phage late control D family protein  87.7 
 
 		 366 aa  225  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00666291 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1359  phage late control D family protein  86.89 
 
 		 366 aa  222  1e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2193  late control gene D protein  71.17 
 
 		 364 aa  172  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2352  late control D family protein  71.17 
 
 		 364 aa  170  5.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.065296  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2305  late control D family protein  70.27 
 
 		 364 aa  169  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3198  late control D family protein  57.02 
 
 		 382 aa  144  3e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000789216  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3024  phage late control gene D protein  55.56 
 
 		 387 aa  137  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.051519 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4351  phage late control gene D protein  54.78 
 
 		 387 aa  135  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.395546 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0998  phage late control gene D protein  55.65 
 
 		 387 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.780637  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4389  late control gene D protein  55.36 
 
 		 389 aa  134  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.725346  normal  0.0652944 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4862  late control D family protein  58.82 
 
 		 383 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0171627  normal  0.29405 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0179  late control D family protein  56.86 
 
 		 383 aa  124  5e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.457524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2889  late control D family protein  49.59 
 
 		 375 aa  121  3e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3476  phage late control D family protein  51.85 
 
 		 387 aa  119  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.216601  normal  0.122645 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2665  late control D family protein  52.17 
 
 		 377 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.132861  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1912  hypothetical protein  44.17 
 
 		 374 aa  102  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0970485  normal  0.714106 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0857  late control D family protein  46.46 
 
 		 363 aa  100  8e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000149579  hitchhiker  0.00128029 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01338  bacteriophage P2 gpD protein  44.44 
 
 		 328 aa  88.6  3e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.405212  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1809  late control D family protein  36.15 
 
 		 391 aa  85.5  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000332404  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1372  phage late control D  43 
 
 		 338 aa  83.2  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.475376  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3315  phage late control D family protein  40.4 
 
 		 344 aa  81.6  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.154413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1325  fels-2 prophage protein  47.12 
 
 		 366 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.370429  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2105  late control D family protein  36.43 
 
 		 401 aa  78.2  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0758552  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37340  Phage late control gene D protein-like protein  38.83 
 
 		 402 aa  74.7  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2586  late control D family protein  38.04 
 
 		 333 aa  58.9  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000462859  hitchhiker  0.00000849595 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2620  late control D family protein  38.04 
 
 		 333 aa  58.9  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000538396  hitchhiker  0.00000000174337 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08150  putative phage late control gene D protein  34.62 
 
 		 329 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000948229  hitchhiker  0.000300765 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0772  tail protein D  31.73 
 
 		 331 aa  47  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.325808  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3390  tail protein D  35.06 
 
 		 347 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.231627  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3065  pyocin R2_PP, tail formation  30.61 
 
 		 347 aa  42  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.561868  normal  0.32013 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1218  late control D family protein  29.59 
 
 		 347 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.868183  hitchhiker  0.000188343 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1623  phage-related tail protein  32.53 
 
 		 325 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>