76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2620 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2586  late control D family protein  100 
 
 		 333 aa  687    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000462859  hitchhiker  0.00000849595 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2620  late control D family protein  100 
 
 		 333 aa  687    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000538396  hitchhiker  0.00000000174337 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3315  phage late control D family protein  51.71 
 
 		 344 aa  355  3.9999999999999996e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.154413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01338  bacteriophage P2 gpD protein  46.44 
 
 		 328 aa  306  4.0000000000000004e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.405212  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1372  phage late control D  43.9 
 
 		 338 aa  300  3e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.475376  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2193  late control gene D protein  42 
 
 		 364 aa  295  6e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2352  late control D family protein  41.43 
 
 		 364 aa  295  7e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.065296  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1325  fels-2 prophage protein  47.4 
 
 		 366 aa  293  2e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.370429  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2305  late control D family protein  41.71 
 
 		 364 aa  292  4e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4862  late control D family protein  43.31 
 
 		 383 aa  286  5e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0171627  normal  0.29405 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2889  late control D family protein  39.53 
 
 		 375 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0179  late control D family protein  42.61 
 
 		 383 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.457524  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37340  Phage late control gene D protein-like protein  42.59 
 
 		 402 aa  278  1e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1912  hypothetical protein  42.82 
 
 		 374 aa  275  7e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0970485  normal  0.714106 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2487  phage late control gene D protein  40.58 
 
 		 366 aa  269  4e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0948  phage late control gene D protein  40.87 
 
 		 366 aa  269  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.210048  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2751  late control D family protein  40.29 
 
 		 366 aa  268  1e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000516519 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4389  late control gene D protein  38.4 
 
 		 389 aa  266  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.725346  normal  0.0652944 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2842  phage late control D family protein  39.42 
 
 		 366 aa  266  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3025  phage late control D family protein  39.42 
 
 		 366 aa  266  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00666291 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1359  phage late control D family protein  38.84 
 
 		 366 aa  262  6e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0998  phage late control gene D protein  37.12 
 
 		 387 aa  257  2e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.780637  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3476  phage late control D family protein  36.56 
 
 		 387 aa  256  5e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.216601  normal  0.122645 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0857  late control D family protein  37.98 
 
 		 363 aa  254  1.0000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000149579  hitchhiker  0.00128029 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4351  phage late control gene D protein  36.84 
 
 		 387 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.395546 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3024  phage late control gene D protein  36.84 
 
 		 387 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.051519 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2665  late control D family protein  35.92 
 
 		 377 aa  251  1e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.132861  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3198  late control D family protein  35.39 
 
 		 382 aa  249  4e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000789216  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1809  late control D family protein  34.27 
 
 		 391 aa  216  5e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000332404  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2105  late control D family protein  33.73 
 
 		 401 aa  192  6e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0758552  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3065  pyocin R2_PP, tail formation  31.27 
 
 		 347 aa  172  5e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.561868  normal  0.32013 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08150  putative phage late control gene D protein  33.33 
 
 		 329 aa  168  9e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000948229  hitchhiker  0.000300765 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1218  late control D family protein  29.72 
 
 		 347 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.868183  hitchhiker  0.000188343 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0772  tail protein D  32.82 
 
 		 331 aa  152  7e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.325808  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1854  phage late control D family protein  30.12 
 
 		 349 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.491572  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2045  late control D family protein  30.25 
 
 		 373 aa  145  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3390  tail protein D  28.79 
 
 		 347 aa  145  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.231627  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1918  pyocin R2_PP, tail formation  32.2 
 
 		 350 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.319398  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0753  phage late control gene D protein GPD  29.61 
 
 		 480 aa  141  1.9999999999999998e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.514992  normal  0.317434 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32130  Phage late control D protein  36.07 
 
 		 274 aa  140  3.9999999999999997e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3359  Phage tail protein D  29.43 
 
 		 324 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3318  phage late control D  27.41 
 
 		 361 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0567  prophage P2W3, tail protein D, putative  23.78 
 
 		 314 aa  130  3e-29  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.502953  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3003  phage late control D family protein  29.11 
 
 		 324 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0391  phage-related tail protein  29.27 
 
 		 360 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1130  phage-related tail protein  29.27 
 
 		 360 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1152  late control D family protein  29.57 
 
 		 360 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1278  phage late control D  26.44 
 
 		 332 aa  127  3e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.487247 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2289  phage late control D family protein  28.26 
 
 		 384 aa  127  3e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.775888  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1623  phage-related tail protein  29.05 
 
 		 325 aa  125  8.000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4034  late control D family protein  30.07 
 
 		 344 aa  123  6e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.356651  unclonable  0.0000000000000337876 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2371  phage late control D  26.48 
 
 		 356 aa  122  9e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0881  late control D family protein  27.11 
 
 		 357 aa  121  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0986779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0700  Phage protein D-like  26.59 
 
 		 328 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1572  late control D family protein  31.07 
 
 		 386 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.303406  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2890  late control D family protein  29.94 
 
 		 384 aa  108  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.198906  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1151  Phage protein D-like  28.52 
 
 		 342 aa  107  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0185813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4462  gp21  30.11 
 
 		 347 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02002  hypothetical protein  27.42 
 
 		 337 aa  97.8  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4546  gp47  29.55 
 
 		 347 aa  95.9  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.494674 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2911  prophage MuMc02, late control gene D protein, putative  29.61 
 
 		 347 aa  95.5  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4547  gp47  29.55 
 
 		 347 aa  94.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.92987 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2506  phage late control D family protein  24.17 
 
 		 338 aa  92  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0254  tail protein D, putative  22.22 
 
 		 325 aa  89.7  7e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1485  phage late control D family protein  22.82 
 
 		 371 aa  80.1  0.00000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0355  late control D family protein  30.5 
 
 		 229 aa  78.6  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0698  late control D family protein  22.26 
 
 		 358 aa  76.3  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2678  putative tail protein  46.05 
 
 		 107 aa  73.6  0.000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.705828  normal  0.016098 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2347  hypothetical protein  25 
 
 		 337 aa  72.8  0.000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0628868  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1216  phage late control D family protein  24.55 
 
 		 339 aa  71.2  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00856  hypothetical protein  38.04 
 
 		 122 aa  69.3  0.00000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00850  putative regulator of late gene expression  38.04 
 
 		 122 aa  69.3  0.00000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4910  late control D family protein  28.57 
 
 		 329 aa  61.2  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.642723 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0570  late control D family protein  22.16 
 
 		 342 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4124  late control D family protein  21.02 
 
 		 358 aa  46.6  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.442041 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1876  hypothetical protein  34.43 
 
 		 349 aa  44.3  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.16394  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>