81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_1359 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E2487  phage late control gene D protein  84.97 
 
 
366 aa  634    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2842  phage late control D family protein  90.71 
 
 
366 aa  690    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1359  phage late control D family protein  100 
 
 
366 aa  750    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3025  phage late control D family protein  90.71 
 
 
366 aa  686    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00666291 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0948  phage late control gene D protein  84.15 
 
 
366 aa  630  1e-180  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.210048  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2751  late control D family protein  83.88 
 
 
366 aa  628  1e-179  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000516519 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2352  late control D family protein  64.23 
 
 
364 aa  468  1.0000000000000001e-131  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.065296  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2193  late control gene D protein  63.38 
 
 
364 aa  467  9.999999999999999e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2305  late control D family protein  62.82 
 
 
364 aa  462  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3024  phage late control gene D protein  53.37 
 
 
387 aa  398  9.999999999999999e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.051519 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4389  late control gene D protein  53.64 
 
 
389 aa  397  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.725346  normal  0.0652944 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4351  phage late control gene D protein  52.56 
 
 
387 aa  392  1e-108  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.395546 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3198  late control D family protein  53.23 
 
 
382 aa  393  1e-108  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000789216  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0998  phage late control gene D protein  53.1 
 
 
387 aa  393  1e-108  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.780637  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3476  phage late control D family protein  50.41 
 
 
387 aa  365  1e-100  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.216601  normal  0.122645 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4862  late control D family protein  52.59 
 
 
383 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0171627  normal  0.29405 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0179  late control D family protein  53.45 
 
 
383 aa  360  3e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.457524  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2889  late control D family protein  47.68 
 
 
375 aa  354  1e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2665  late control D family protein  54.37 
 
 
377 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.132861  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0857  late control D family protein  47.54 
 
 
363 aa  328  7e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000149579  hitchhiker  0.00128029 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1912  hypothetical protein  43.09 
 
 
374 aa  308  6.999999999999999e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0970485  normal  0.714106 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3315  phage late control D family protein  42.24 
 
 
344 aa  293  3e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.154413  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01338  bacteriophage P2 gpD protein  45.19 
 
 
328 aa  287  2e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.405212  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37340  Phage late control gene D protein-like protein  43.64 
 
 
402 aa  286  4e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1372  phage late control D  42.65 
 
 
338 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.475376  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1325  fels-2 prophage protein  42.98 
 
 
366 aa  277  2e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.370429  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1809  late control D family protein  40.61 
 
 
391 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000332404  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2620  late control D family protein  38.84 
 
 
333 aa  251  1e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000538396  hitchhiker  0.00000000174337 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2586  late control D family protein  38.84 
 
 
333 aa  251  1e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000462859  hitchhiker  0.00000849595 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2105  late control D family protein  35.96 
 
 
401 aa  243  3e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0758552  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00856  hypothetical protein  93.58 
 
 
122 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00850  putative regulator of late gene expression  93.58 
 
 
122 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08150  putative phage late control gene D protein  35.8 
 
 
329 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000948229  hitchhiker  0.000300765 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1218  late control D family protein  33.33 
 
 
347 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.868183  hitchhiker  0.000188343 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3390  tail protein D  33.92 
 
 
347 aa  176  8e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.231627  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3065  pyocin R2_PP, tail formation  31.29 
 
 
347 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.561868  normal  0.32013 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0772  tail protein D  33.04 
 
 
331 aa  168  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.325808  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1854  phage late control D family protein  30.67 
 
 
349 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.491572  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32130  Phage late control D protein  38.86 
 
 
274 aa  156  6e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1918  pyocin R2_PP, tail formation  32.52 
 
 
350 aa  152  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.319398  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1278  phage late control D  31.36 
 
 
332 aa  151  2e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.487247 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2289  phage late control D family protein  29.51 
 
 
384 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.775888  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4034  late control D family protein  33.55 
 
 
344 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.356651  unclonable  0.0000000000000337876 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0391  phage-related tail protein  30.03 
 
 
360 aa  144  3e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1130  phage-related tail protein  30.03 
 
 
360 aa  144  3e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0567  prophage P2W3, tail protein D, putative  29.81 
 
 
314 aa  142  9.999999999999999e-33  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.502953  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1152  late control D family protein  30.03 
 
 
360 aa  141  1.9999999999999998e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0881  late control D family protein  29.25 
 
 
357 aa  138  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0986779  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3003  phage late control D family protein  30.99 
 
 
324 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3318  phage late control D  28.16 
 
 
361 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3359  Phage tail protein D  30.41 
 
 
324 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2045  late control D family protein  35.02 
 
 
373 aa  131  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0753  phage late control gene D protein GPD  27.84 
 
 
480 aa  124  4e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.514992  normal  0.317434 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2371  phage late control D  27.25 
 
 
356 aa  123  6e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1623  phage-related tail protein  28.12 
 
 
325 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1572  late control D family protein  27.38 
 
 
386 aa  107  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.303406  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2890  late control D family protein  27.89 
 
 
384 aa  103  4e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.198906  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02002  hypothetical protein  25.94 
 
 
337 aa  98.2  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0700  Phage protein D-like  23.12 
 
 
328 aa  97.8  2e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2506  phage late control D family protein  24.85 
 
 
338 aa  93.6  4e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1151  Phage protein D-like  31.82 
 
 
342 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0185813  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0254  tail protein D, putative  23.18 
 
 
325 aa  90.1  6e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2678  putative tail protein  61.64 
 
 
107 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.705828  normal  0.016098 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0698  late control D family protein  29.77 
 
 
358 aa  87.4  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4546  gp47  23.41 
 
 
347 aa  81.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.494674 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4462  gp21  26.55 
 
 
347 aa  81.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4547  gp47  25.99 
 
 
347 aa  79  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.92987 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0355  late control D family protein  27.68 
 
 
229 aa  78.2  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4910  late control D family protein  23.61 
 
 
329 aa  76.6  0.0000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.642723 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2347  hypothetical protein  24.49 
 
 
337 aa  72.8  0.000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0628868  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2911  prophage MuMc02, late control gene D protein, putative  26.4 
 
 
347 aa  69.7  0.00000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1485  phage late control D family protein  23.28 
 
 
371 aa  67.8  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1216  phage late control D family protein  22.5 
 
 
339 aa  66.6  0.0000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0928  Phage protein D-like protein  26.97 
 
 
362 aa  64.3  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4124  late control D family protein  29.65 
 
 
358 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.442041 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0938  Phage protein D-like  30.68 
 
 
427 aa  52  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0367858  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0570  late control D family protein  30.23 
 
 
342 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3822  phage protein D-like  30.11 
 
 
427 aa  50.8  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1883  Phage protein D-like  28.64 
 
 
427 aa  48.9  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.109131  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2267  Rhs element Vgr protein  36.25 
 
 
610 aa  46.6  0.0007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.267374  hitchhiker  0.000675551 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1906  Rhs element Vgr protein  27.32 
 
 
606 aa  45.8  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0194585  hitchhiker  0.0014616 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>