50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_2678 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_2678  putative tail protein  100 
 
 
107 aa  218  3e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.705828  normal  0.016098 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2889  late control D family protein  60.27 
 
 
375 aa  93.6  8e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2352  late control D family protein  54.22 
 
 
364 aa  88.6  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.065296  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2193  late control gene D protein  54.22 
 
 
364 aa  89  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2665  late control D family protein  51.65 
 
 
377 aa  89.4  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.132861  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2305  late control D family protein  54.22 
 
 
364 aa  88.6  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4351  phage late control gene D protein  59.15 
 
 
387 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.395546 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2487  phage late control gene D protein  55.42 
 
 
366 aa  88.6  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0948  phage late control gene D protein  55.42 
 
 
366 aa  88.2  4e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.210048  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1359  phage late control D family protein  61.64 
 
 
366 aa  87.4  6e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2751  late control D family protein  54.22 
 
 
366 aa  86.7  9e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000516519 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3024  phage late control gene D protein  59.15 
 
 
387 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.051519 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3025  phage late control D family protein  60.27 
 
 
366 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00666291 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0998  phage late control gene D protein  59.15 
 
 
387 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.780637  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2842  phage late control D family protein  60.27 
 
 
366 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3198  late control D family protein  69.64 
 
 
382 aa  80.9  0.000000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000789216  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3476  phage late control D family protein  60.71 
 
 
387 aa  79.3  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.216601  normal  0.122645 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1809  late control D family protein  45.45 
 
 
391 aa  76.6  0.00000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000332404  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4389  late control gene D protein  60.34 
 
 
389 aa  76.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.725346  normal  0.0652944 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2620  late control D family protein  46.05 
 
 
333 aa  73.9  0.0000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000538396  hitchhiker  0.00000000174337 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2586  late control D family protein  46.05 
 
 
333 aa  73.9  0.0000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000462859  hitchhiker  0.00000849595 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4862  late control D family protein  51.28 
 
 
383 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0171627  normal  0.29405 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0857  late control D family protein  45.83 
 
 
363 aa  69.7  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000149579  hitchhiker  0.00128029 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1912  hypothetical protein  45.24 
 
 
374 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0970485  normal  0.714106 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2105  late control D family protein  56.36 
 
 
401 aa  68.6  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0758552  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0179  late control D family protein  47.44 
 
 
383 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.457524  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37340  Phage late control gene D protein-like protein  42.31 
 
 
402 aa  68.2  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1325  fels-2 prophage protein  47.22 
 
 
366 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.370429  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3315  phage late control D family protein  47.95 
 
 
344 aa  67  0.00000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.154413  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01338  bacteriophage P2 gpD protein  43.84 
 
 
328 aa  64.7  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.405212  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08150  putative phage late control gene D protein  46.75 
 
 
329 aa  63.9  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000948229  hitchhiker  0.000300765 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1854  phage late control D family protein  42.03 
 
 
349 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.491572  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32130  Phage late control D protein  40.85 
 
 
274 aa  63.2  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3003  phage late control D family protein  45.83 
 
 
324 aa  60.8  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3359  Phage tail protein D  44.44 
 
 
324 aa  59.7  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1918  pyocin R2_PP, tail formation  39.13 
 
 
350 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.319398  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1372  phage late control D  52.83 
 
 
338 aa  55.5  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.475376  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3390  tail protein D  36.62 
 
 
347 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.231627  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1218  late control D family protein  33.8 
 
 
347 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.868183  hitchhiker  0.000188343 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3065  pyocin R2_PP, tail formation  33.8 
 
 
347 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.561868  normal  0.32013 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2045  late control D family protein  45.21 
 
 
373 aa  50.8  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4034  late control D family protein  38.03 
 
 
344 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.356651  unclonable  0.0000000000000337876 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2289  phage late control D family protein  32.05 
 
 
384 aa  46.6  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.775888  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0772  tail protein D  36.62 
 
 
331 aa  47  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.325808  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1485  phage late control D family protein  38.78 
 
 
371 aa  43.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1152  late control D family protein  34.33 
 
 
360 aa  42.4  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1130  phage-related tail protein  34.33 
 
 
360 aa  42.4  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0391  phage-related tail protein  34.33 
 
 
360 aa  42.4  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2890  late control D family protein  30.11 
 
 
384 aa  41.6  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.198906  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0881  late control D family protein  35.82 
 
 
357 aa  40.8  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0986779  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>