48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_0928 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_0928  Phage protein D-like protein  100 
 
 		 362 aa  736    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1216  phage late control D family protein  31.23 
 
 		 339 aa  188  1e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4910  late control D family protein  29.83 
 
 		 329 aa  183  4.0000000000000006e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.642723 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4547  gp47  30.53 
 
 		 347 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.92987 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4462  gp21  29.69 
 
 		 347 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4546  gp47  29.69 
 
 		 347 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.494674 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1572  late control D family protein  28.98 
 
 		 386 aa  144  2e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.303406  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2890  late control D family protein  28.65 
 
 		 384 aa  143  4e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.198906  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2911  prophage MuMc02, late control gene D protein, putative  27.93 
 
 		 347 aa  120  3e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1854  phage late control D family protein  22 
 
 		 349 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.491572  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2487  phage late control gene D protein  26.05 
 
 		 366 aa  67.4  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0948  phage late control gene D protein  25.63 
 
 		 366 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.210048  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2751  late control D family protein  25.63 
 
 		 366 aa  66.2  0.0000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000516519 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1359  phage late control D family protein  26.97 
 
 		 366 aa  64.3  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3025  phage late control D family protein  25.84 
 
 		 366 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00666291 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2842  phage late control D family protein  24.72 
 
 		 366 aa  59.7  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0254  tail protein D, putative  27.47 
 
 		 325 aa  58.9  0.0000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1918  pyocin R2_PP, tail formation  23.73 
 
 		 350 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.319398  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1732  Rhs element Vgr protein  27.83 
 
 		 641 aa  56.2  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00520263 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3065  pyocin R2_PP, tail formation  21.65 
 
 		 347 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.561868  normal  0.32013 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1912  hypothetical protein  23.74 
 
 		 374 aa  55.1  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0970485  normal  0.714106 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2889  late control D family protein  23.46 
 
 		 375 aa  54.7  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0567  prophage P2W3, tail protein D, putative  22.57 
 
 		 314 aa  54.3  0.000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.502953  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4389  late control gene D protein  22.55 
 
 		 389 aa  53.9  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.725346  normal  0.0652944 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0998  phage late control gene D protein  26.9 
 
 		 387 aa  53.5  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.780637  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3024  phage late control gene D protein  26.9 
 
 		 387 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.051519 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1278  phage late control D  20.61 
 
 		 332 aa  52  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.487247 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1372  phage late control D  28.66 
 
 		 338 aa  51.6  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.475376  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4351  phage late control gene D protein  26.9 
 
 		 387 aa  52  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.395546 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4862  late control D family protein  27.27 
 
 		 383 aa  51.6  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0171627  normal  0.29405 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3476  phage late control D family protein  24.04 
 
 		 387 aa  50.4  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.216601  normal  0.122645 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0179  late control D family protein  26.67 
 
 		 383 aa  49.7  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.457524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1325  fels-2 prophage protein  24.72 
 
 		 366 aa  49.3  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.370429  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08150  putative phage late control gene D protein  21.86 
 
 		 329 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000948229  hitchhiker  0.000300765 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32130  Phage late control D protein  20.89 
 
 		 274 aa  48.9  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3198  late control D family protein  26.47 
 
 		 382 aa  48.5  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000789216  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0772  tail protein D  21.55 
 
 		 331 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.325808  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0753  phage late control gene D protein GPD  21.74 
 
 		 480 aa  46.6  0.0007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.514992  normal  0.317434 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1809  late control D family protein  26.53 
 
 		 391 aa  46.6  0.0008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000332404  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3822  phage protein D-like  23.27 
 
 		 427 aa  45.4  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37340  Phage late control gene D protein-like protein  22.48 
 
 		 402 aa  45.8  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0662  putative phage late control gene D protein  20.4 
 
 		 417 aa  45.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0857  late control D family protein  24.39 
 
 		 363 aa  45.1  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000149579  hitchhiker  0.00128029 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1218  late control D family protein  23.87 
 
 		 347 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.868183  hitchhiker  0.000188343 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02002  hypothetical protein  28.85 
 
 		 337 aa  43.9  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2506  phage late control D family protein  28.8 
 
 		 338 aa  43.9  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5384  Rhs element Vgr protein  20.49 
 
 		 602 aa  43.9  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2665  late control D family protein  23.43 
 
 		 377 aa  43.5  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.132861  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>