78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A4547 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011149  SeAg_B4462  gp21  97.12 
 
 		 347 aa  678    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4546  gp47  98.27 
 
 		 347 aa  704    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.494674 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4547  gp47  100 
 
 		 347 aa  715    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.92987 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2890  late control D family protein  58.91 
 
 		 384 aa  438  9.999999999999999e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.198906  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1572  late control D family protein  59.65 
 
 		 386 aa  431  1e-120  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.303406  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2911  prophage MuMc02, late control gene D protein, putative  36.5 
 
 		 347 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0928  Phage protein D-like protein  33.15 
 
 		 362 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4910  late control D family protein  29.18 
 
 		 329 aa  147  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.642723 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1216  phage late control D family protein  29.04 
 
 		 339 aa  139  8.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1218  late control D family protein  27.25 
 
 		 347 aa  106  7e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.868183  hitchhiker  0.000188343 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3315  phage late control D family protein  26.84 
 
 		 344 aa  100  4e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.154413  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3390  tail protein D  26.89 
 
 		 347 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.231627  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2889  late control D family protein  26.72 
 
 		 375 aa  99  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3065  pyocin R2_PP, tail formation  26.52 
 
 		 347 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.561868  normal  0.32013 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2620  late control D family protein  29.55 
 
 		 333 aa  95.1  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000538396  hitchhiker  0.00000000174337 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2586  late control D family protein  29.55 
 
 		 333 aa  95.1  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000462859  hitchhiker  0.00000849595 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3198  late control D family protein  25.27 
 
 		 382 aa  94  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000789216  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4389  late control gene D protein  26.39 
 
 		 389 aa  94  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.725346  normal  0.0652944 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32130  Phage late control D protein  28.95 
 
 		 274 aa  92.4  9e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3476  phage late control D family protein  28.51 
 
 		 387 aa  90.1  5e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.216601  normal  0.122645 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1854  phage late control D family protein  26.11 
 
 		 349 aa  89  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.491572  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0772  tail protein D  26.76 
 
 		 331 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.325808  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0753  phage late control gene D protein GPD  27.65 
 
 		 480 aa  84.3  0.000000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.514992  normal  0.317434 
 
 
-
 
NC_002978  WD0567  prophage P2W3, tail protein D, putative  26.94 
 
 		 314 aa  84  0.000000000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.502953  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1325  fels-2 prophage protein  27.84 
 
 		 366 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.370429  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0700  Phage protein D-like  25 
 
 		 328 aa  83.6  0.000000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08150  putative phage late control gene D protein  25.22 
 
 		 329 aa  82.8  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000948229  hitchhiker  0.000300765 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1359  phage late control D family protein  23.12 
 
 		 366 aa  82.8  0.000000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0857  late control D family protein  23.77 
 
 		 363 aa  82.8  0.000000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000149579  hitchhiker  0.00128029 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1278  phage late control D  24.63 
 
 		 332 aa  81.6  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.487247 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4034  late control D family protein  26.01 
 
 		 344 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.356651  unclonable  0.0000000000000337876 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3025  phage late control D family protein  26.55 
 
 		 366 aa  80.9  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00666291 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0948  phage late control gene D protein  25.73 
 
 		 366 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.210048  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1912  hypothetical protein  30.11 
 
 		 374 aa  80.1  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0970485  normal  0.714106 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2305  late control D family protein  27.78 
 
 		 364 aa  79.3  0.00000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2487  phage late control gene D protein  25.24 
 
 		 366 aa  79.3  0.00000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2751  late control D family protein  25.24 
 
 		 366 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000516519 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0998  phage late control gene D protein  28.89 
 
 		 387 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.780637  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2193  late control gene D protein  27.78 
 
 		 364 aa  78.2  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01338  bacteriophage P2 gpD protein  22.15 
 
 		 328 aa  78.6  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.405212  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2842  phage late control D family protein  25.99 
 
 		 366 aa  78.2  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3024  phage late control gene D protein  28.33 
 
 		 387 aa  77.4  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.051519 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1809  late control D family protein  25.93 
 
 		 391 aa  76.6  0.0000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000332404  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37340  Phage late control gene D protein-like protein  26.79 
 
 		 402 aa  76.3  0.0000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2352  late control D family protein  26.67 
 
 		 364 aa  76.3  0.0000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.065296  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4351  phage late control gene D protein  28.33 
 
 		 387 aa  76.3  0.0000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.395546 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1918  pyocin R2_PP, tail formation  29.61 
 
 		 350 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.319398  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2665  late control D family protein  25 
 
 		 377 aa  73.6  0.000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.132861  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3318  phage late control D  27.51 
 
 		 361 aa  72.8  0.000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1372  phage late control D  24.8 
 
 		 338 aa  68.2  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.475376  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2105  late control D family protein  26.8 
 
 		 401 aa  68.2  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0758552  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2371  phage late control D  27.81 
 
 		 356 aa  67.8  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0881  late control D family protein  24.28 
 
 		 357 aa  67  0.0000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0986779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1152  late control D family protein  25.73 
 
 		 360 aa  66.6  0.0000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0254  tail protein D, putative  27.12 
 
 		 325 aa  66.2  0.0000000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1130  phage-related tail protein  25.73 
 
 		 360 aa  65.5  0.000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0391  phage-related tail protein  25.73 
 
 		 360 aa  65.5  0.000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3003  phage late control D family protein  25.99 
 
 		 324 aa  65.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2289  phage late control D family protein  28.33 
 
 		 384 aa  65.1  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.775888  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3359  Phage tail protein D  24.86 
 
 		 324 aa  63.5  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4862  late control D family protein  21.08 
 
 		 383 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0171627  normal  0.29405 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2045  late control D family protein  22.74 
 
 		 373 aa  57.8  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1623  phage-related tail protein  20 
 
 		 325 aa  56.6  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0179  late control D family protein  21.65 
 
 		 383 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.457524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0698  late control D family protein  21.6 
 
 		 358 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2817  Rhs element Vgr protein  22.01 
 
 		 593 aa  53.1  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3664  hypothetical protein  25.69 
 
 		 360 aa  52.4  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000879822 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1663  Rhs element Vgr protein  24.54 
 
 		 589 aa  50.4  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.485896  normal  0.191701 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1151  Phage protein D-like  23.32 
 
 		 342 aa  49.7  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0185813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3822  phage protein D-like  23.75 
 
 		 427 aa  49.3  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0852  putative phage late control gene D protein  23.01 
 
 		 417 aa  48.9  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0938  Phage protein D-like  25.87 
 
 		 427 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0367858  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0662  putative phage late control gene D protein  23.01 
 
 		 417 aa  48.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2945  Rhs element Vgr protein  24.6 
 
 		 589 aa  47  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.703955  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1883  Phage protein D-like  25.87 
 
 		 427 aa  45.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.109131  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2347  hypothetical protein  21.6 
 
 		 337 aa  43.5  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0628868  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0982  hypothetical protein  26.09 
 
 		 362 aa  43.1  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2506  phage late control D family protein  25.17 
 
 		 338 aa  42.7  0.01  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>