74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1372 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_1372  phage late control D  100 
 
 		 338 aa  679    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.475376  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01338  bacteriophage P2 gpD protein  52.32 
 
 		 328 aa  334  1e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.405212  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2889  late control D family protein  46.65 
 
 		 375 aa  329  4e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3315  phage late control D family protein  50.16 
 
 		 344 aa  328  8e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.154413  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37340  Phage late control gene D protein-like protein  48.77 
 
 		 402 aa  314  9.999999999999999e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4389  late control gene D protein  44.75 
 
 		 389 aa  312  3.9999999999999997e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.725346  normal  0.0652944 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4862  late control D family protein  47.03 
 
 		 383 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0171627  normal  0.29405 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0179  late control D family protein  46.18 
 
 		 383 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.457524  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3198  late control D family protein  44.94 
 
 		 382 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000789216  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3476  phage late control D family protein  43.16 
 
 		 387 aa  303  2.0000000000000002e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.216601  normal  0.122645 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0998  phage late control gene D protein  44.04 
 
 		 387 aa  298  1e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.780637  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3024  phage late control gene D protein  44.88 
 
 		 387 aa  297  2e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.051519 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2193  late control gene D protein  43.71 
 
 		 364 aa  295  6e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4351  phage late control gene D protein  44.32 
 
 		 387 aa  295  7e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.395546 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2305  late control D family protein  44 
 
 		 364 aa  294  1e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3025  phage late control D family protein  43.52 
 
 		 366 aa  294  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00666291 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2751  late control D family protein  42.62 
 
 		 366 aa  293  3e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000516519 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2487  phage late control gene D protein  42.9 
 
 		 366 aa  292  5e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2352  late control D family protein  43.14 
 
 		 364 aa  292  5e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.065296  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2842  phage late control D family protein  43.23 
 
 		 366 aa  292  7e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0948  phage late control gene D protein  42.62 
 
 		 366 aa  290  2e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.210048  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1325  fels-2 prophage protein  46.04 
 
 		 366 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.370429  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1359  phage late control D family protein  42.65 
 
 		 366 aa  285  1.0000000000000001e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2620  late control D family protein  44.04 
 
 		 333 aa  283  2.0000000000000002e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000538396  hitchhiker  0.00000000174337 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2586  late control D family protein  44.04 
 
 		 333 aa  283  2.0000000000000002e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000462859  hitchhiker  0.00000849595 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1912  hypothetical protein  43.43 
 
 		 374 aa  282  7.000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0970485  normal  0.714106 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2665  late control D family protein  40.8 
 
 		 377 aa  268  8e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.132861  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0857  late control D family protein  39.17 
 
 		 363 aa  257  2e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000149579  hitchhiker  0.00128029 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1809  late control D family protein  33.99 
 
 		 391 aa  207  2e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000332404  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2105  late control D family protein  31.88 
 
 		 401 aa  196  6e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0758552  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1218  late control D family protein  36.62 
 
 		 347 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.868183  hitchhiker  0.000188343 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3065  pyocin R2_PP, tail formation  36.36 
 
 		 347 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.561868  normal  0.32013 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3390  tail protein D  35.17 
 
 		 347 aa  186  5e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.231627  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1152  late control D family protein  33.84 
 
 		 360 aa  173  5e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1130  phage-related tail protein  33.23 
 
 		 360 aa  170  3e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0391  phage-related tail protein  33.23 
 
 		 360 aa  170  3e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1278  phage late control D  33.64 
 
 		 332 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.487247 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0881  late control D family protein  33.74 
 
 		 357 aa  162  7e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0986779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08150  putative phage late control gene D protein  32.54 
 
 		 329 aa  155  9e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000948229  hitchhiker  0.000300765 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3003  phage late control D family protein  34.29 
 
 		 324 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3359  Phage tail protein D  33.65 
 
 		 324 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0567  prophage P2W3, tail protein D, putative  26.77 
 
 		 314 aa  145  9e-34  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.502953  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2045  late control D family protein  33.53 
 
 		 373 aa  139  6e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1854  phage late control D family protein  30.84 
 
 		 349 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.491572  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0772  tail protein D  32 
 
 		 331 aa  135  8e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.325808  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0753  phage late control gene D protein GPD  31.45 
 
 		 480 aa  135  9.999999999999999e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.514992  normal  0.317434 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1918  pyocin R2_PP, tail formation  31.33 
 
 		 350 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.319398  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32130  Phage late control D protein  37.79 
 
 		 274 aa  132  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3318  phage late control D  25.38 
 
 		 361 aa  123  6e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2289  phage late control D family protein  25.3 
 
 		 384 aa  119  6e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.775888  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4034  late control D family protein  29.97 
 
 		 344 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.356651  unclonable  0.0000000000000337876 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1623  phage-related tail protein  28.57 
 
 		 325 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2371  phage late control D  24.77 
 
 		 356 aa  113  5e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1151  Phage protein D-like  30.63 
 
 		 342 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0185813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0355  late control D family protein  33 
 
 		 229 aa  107  2e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0700  Phage protein D-like  25.55 
 
 		 328 aa  107  3e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2506  phage late control D family protein  25.58 
 
 		 338 aa  91.3  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02002  hypothetical protein  28.14 
 
 		 337 aa  85.9  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0254  tail protein D, putative  22.02 
 
 		 325 aa  84.7  0.000000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00856  hypothetical protein  43 
 
 		 122 aa  83.2  0.000000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00850  putative regulator of late gene expression  43 
 
 		 122 aa  83.2  0.000000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1572  late control D family protein  27.06 
 
 		 386 aa  82.4  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.303406  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0698  late control D family protein  24.84 
 
 		 358 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2890  late control D family protein  26.82 
 
 		 384 aa  77.8  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.198906  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2911  prophage MuMc02, late control gene D protein, putative  28.33 
 
 		 347 aa  73.2  0.000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4546  gp47  24.02 
 
 		 347 aa  69.3  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.494674 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4547  gp47  24.8 
 
 		 347 aa  68.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.92987 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4462  gp21  23.92 
 
 		 347 aa  67.8  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1485  phage late control D family protein  23.6 
 
 		 371 aa  66.6  0.0000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4124  late control D family protein  25.32 
 
 		 358 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.442041 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2678  putative tail protein  52.83 
 
 		 107 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.705828  normal  0.016098 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4910  late control D family protein  24.26 
 
 		 329 aa  53.1  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.642723 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0928  Phage protein D-like protein  28.66 
 
 		 362 aa  51.2  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1216  phage late control D family protein  23.53 
 
 		 339 aa  46.2  0.0009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>