67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2506 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2506  phage late control D family protein  100 
 
 
338 aa  698    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02002  hypothetical protein  46.01 
 
 
337 aa  309  5e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1151  Phage protein D-like  43.9 
 
 
342 aa  295  6e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0185813  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2498  hypothetical protein  92.16 
 
 
135 aa  196  5.000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00376301  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1278  phage late control D  29.41 
 
 
332 aa  127  3e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.487247 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1152  late control D family protein  28.88 
 
 
360 aa  124  3e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0391  phage-related tail protein  29.19 
 
 
360 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1130  phage-related tail protein  29.19 
 
 
360 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01338  bacteriophage P2 gpD protein  29.8 
 
 
328 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.405212  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3003  phage late control D family protein  28.62 
 
 
324 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08150  putative phage late control gene D protein  30.63 
 
 
329 aa  107  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000948229  hitchhiker  0.000300765 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3359  Phage tail protein D  28.62 
 
 
324 aa  106  5e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2045  late control D family protein  25.15 
 
 
373 aa  106  6e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2305  late control D family protein  30.36 
 
 
364 aa  103  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2751  late control D family protein  26.8 
 
 
366 aa  102  9e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000516519 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2193  late control gene D protein  30.36 
 
 
364 aa  102  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0948  phage late control gene D protein  29.96 
 
 
366 aa  102  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.210048  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2352  late control D family protein  30.8 
 
 
364 aa  102  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.065296  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0567  prophage P2W3, tail protein D, putative  23.81 
 
 
314 aa  101  2e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.502953  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0179  late control D family protein  25.65 
 
 
383 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.457524  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0753  phage late control gene D protein GPD  27.95 
 
 
480 aa  99.4  7e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.514992  normal  0.317434 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2487  phage late control gene D protein  29.11 
 
 
366 aa  99.4  8e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3025  phage late control D family protein  25.15 
 
 
366 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00666291 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2842  phage late control D family protein  28.84 
 
 
366 aa  96.3  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37340  Phage late control gene D protein-like protein  25.87 
 
 
402 aa  95.9  8e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0772  tail protein D  29.84 
 
 
331 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.325808  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0355  late control D family protein  31.53 
 
 
229 aa  94.7  2e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3198  late control D family protein  31.34 
 
 
382 aa  94.7  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000789216  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2665  late control D family protein  29.83 
 
 
377 aa  93.6  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.132861  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1359  phage late control D family protein  24.85 
 
 
366 aa  93.6  4e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3315  phage late control D family protein  23.71 
 
 
344 aa  92.4  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.154413  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1372  phage late control D  25.58 
 
 
338 aa  91.3  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.475376  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4862  late control D family protein  24.78 
 
 
383 aa  91.7  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0171627  normal  0.29405 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4389  late control gene D protein  28.57 
 
 
389 aa  90.1  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.725346  normal  0.0652944 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0881  late control D family protein  26.07 
 
 
357 aa  89.7  6e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0986779  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1912  hypothetical protein  32.24 
 
 
374 aa  89  9e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0970485  normal  0.714106 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3024  phage late control gene D protein  31.51 
 
 
387 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.051519 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3065  pyocin R2_PP, tail formation  27.78 
 
 
347 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.561868  normal  0.32013 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0998  phage late control gene D protein  31.51 
 
 
387 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.780637  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2889  late control D family protein  23.6 
 
 
375 aa  87.8  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0857  late control D family protein  26.64 
 
 
363 aa  86.7  5e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000149579  hitchhiker  0.00128029 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2620  late control D family protein  24.48 
 
 
333 aa  84.3  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000538396  hitchhiker  0.00000000174337 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2586  late control D family protein  24.48 
 
 
333 aa  84.3  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000462859  hitchhiker  0.00000849595 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4351  phage late control gene D protein  30.14 
 
 
387 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.395546 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3476  phage late control D family protein  27.31 
 
 
387 aa  82  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.216601  normal  0.122645 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1218  late control D family protein  27.56 
 
 
347 aa  79.3  0.00000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.868183  hitchhiker  0.000188343 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4034  late control D family protein  27.3 
 
 
344 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.356651  unclonable  0.0000000000000337876 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1623  phage-related tail protein  27.83 
 
 
325 aa  77.8  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1809  late control D family protein  24.41 
 
 
391 aa  75.1  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000332404  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1325  fels-2 prophage protein  24.32 
 
 
366 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.370429  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1854  phage late control D family protein  23.86 
 
 
349 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.491572  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3390  tail protein D  25.81 
 
 
347 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.231627  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2289  phage late control D family protein  22.42 
 
 
384 aa  69.3  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.775888  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3318  phage late control D  23.81 
 
 
361 aa  68.9  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2105  late control D family protein  22.64 
 
 
401 aa  66.2  0.0000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0758552  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2371  phage late control D  24.04 
 
 
356 aa  65.1  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32130  Phage late control D protein  27.96 
 
 
274 aa  62.4  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1918  pyocin R2_PP, tail formation  23.2 
 
 
350 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.319398  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2911  prophage MuMc02, late control gene D protein, putative  24.11 
 
 
347 aa  56.6  0.0000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0700  Phage protein D-like  23.74 
 
 
328 aa  55.8  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0254  tail protein D, putative  21.9 
 
 
325 aa  53.9  0.000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2890  late control D family protein  26.54 
 
 
384 aa  52.4  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.198906  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1572  late control D family protein  25.93 
 
 
386 aa  51.6  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.303406  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4546  gp47  26.53 
 
 
347 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.494674 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4462  gp21  25.85 
 
 
347 aa  46.2  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0928  Phage protein D-like protein  28.8 
 
 
362 aa  44.3  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0698  late control D family protein  24.42 
 
 
358 aa  43.1  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>