73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_32130 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_32130  Phage late control D protein  100 
 
 
274 aa  553  1e-157  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1854  phage late control D family protein  53.82 
 
 
349 aa  286  2e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.491572  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1918  pyocin R2_PP, tail formation  51.81 
 
 
350 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.319398  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3390  tail protein D  50.2 
 
 
347 aa  244  8e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.231627  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3065  pyocin R2_PP, tail formation  47.44 
 
 
347 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.561868  normal  0.32013 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1218  late control D family protein  48.29 
 
 
347 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.868183  hitchhiker  0.000188343 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4034  late control D family protein  44.98 
 
 
344 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.356651  unclonable  0.0000000000000337876 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08150  putative phage late control gene D protein  42.97 
 
 
329 aa  216  5e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000948229  hitchhiker  0.000300765 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0772  tail protein D  44.62 
 
 
331 aa  205  7e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.325808  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0998  phage late control gene D protein  41.74 
 
 
387 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.780637  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3024  phage late control gene D protein  42.17 
 
 
387 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.051519 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4351  phage late control gene D protein  41.3 
 
 
387 aa  171  1e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.395546 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2352  late control D family protein  41.18 
 
 
364 aa  171  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.065296  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2487  phage late control gene D protein  41.23 
 
 
366 aa  171  1e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0948  phage late control gene D protein  40.76 
 
 
366 aa  169  3e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.210048  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3476  phage late control D family protein  41.96 
 
 
387 aa  169  4e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.216601  normal  0.122645 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2193  late control gene D protein  39.01 
 
 
364 aa  169  4e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2751  late control D family protein  40.28 
 
 
366 aa  169  5e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000516519 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3198  late control D family protein  44.61 
 
 
382 aa  168  8e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000789216  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4389  late control gene D protein  42.15 
 
 
389 aa  168  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.725346  normal  0.0652944 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2842  phage late control D family protein  39.34 
 
 
366 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3025  phage late control D family protein  39.34 
 
 
366 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00666291 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2305  late control D family protein  39.82 
 
 
364 aa  167  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1359  phage late control D family protein  38.86 
 
 
366 aa  164  1.0000000000000001e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2889  late control D family protein  36.48 
 
 
375 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3315  phage late control D family protein  40.27 
 
 
344 aa  162  6e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.154413  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37340  Phage late control gene D protein-like protein  38.64 
 
 
402 aa  152  5e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0857  late control D family protein  36.82 
 
 
363 aa  151  8.999999999999999e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000149579  hitchhiker  0.00128029 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01338  bacteriophage P2 gpD protein  37.33 
 
 
328 aa  150  2e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.405212  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2586  late control D family protein  36.07 
 
 
333 aa  147  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000462859  hitchhiker  0.00000849595 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1912  hypothetical protein  35.39 
 
 
374 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0970485  normal  0.714106 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2620  late control D family protein  36.07 
 
 
333 aa  147  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000538396  hitchhiker  0.00000000174337 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3359  Phage tail protein D  40.27 
 
 
324 aa  143  3e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3003  phage late control D family protein  39.82 
 
 
324 aa  142  5e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1372  phage late control D  37.79 
 
 
338 aa  142  5e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.475376  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2665  late control D family protein  37.02 
 
 
377 aa  142  7e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.132861  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2289  phage late control D family protein  31.93 
 
 
384 aa  138  7.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.775888  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2105  late control D family protein  32.31 
 
 
401 aa  138  7.999999999999999e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0758552  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4862  late control D family protein  33.91 
 
 
383 aa  136  4e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0171627  normal  0.29405 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0179  late control D family protein  33.91 
 
 
383 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.457524  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1325  fels-2 prophage protein  34.53 
 
 
366 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.370429  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1809  late control D family protein  29.87 
 
 
391 aa  130  3e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000332404  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0391  phage-related tail protein  33.33 
 
 
360 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1130  phage-related tail protein  33.33 
 
 
360 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1278  phage late control D  35.71 
 
 
332 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.487247 
 
 
-
 
NC_002978  WD0567  prophage P2W3, tail protein D, putative  28.07 
 
 
314 aa  119  4.9999999999999996e-26  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.502953  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1152  late control D family protein  34.56 
 
 
360 aa  119  6e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0881  late control D family protein  34.11 
 
 
357 aa  118  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0986779  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2045  late control D family protein  34.8 
 
 
373 aa  115  6e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0753  phage late control gene D protein GPD  34.4 
 
 
480 aa  107  3e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.514992  normal  0.317434 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2371  phage late control D  29.6 
 
 
356 aa  105  8e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3318  phage late control D  29.6 
 
 
361 aa  105  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2890  late control D family protein  30.04 
 
 
384 aa  103  4e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.198906  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2911  prophage MuMc02, late control gene D protein, putative  34.09 
 
 
347 aa  101  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4462  gp21  29.82 
 
 
347 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1623  phage-related tail protein  28.26 
 
 
325 aa  97.4  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1572  late control D family protein  32.57 
 
 
386 aa  97.1  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.303406  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4546  gp47  29.39 
 
 
347 aa  95.5  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.494674 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4547  gp47  28.95 
 
 
347 aa  94  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.92987 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0700  Phage protein D-like  30.1 
 
 
328 aa  92.4  7e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1485  phage late control D family protein  30.46 
 
 
371 aa  83.6  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0254  tail protein D, putative  25 
 
 
325 aa  74.7  0.000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2678  putative tail protein  45.07 
 
 
107 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.705828  normal  0.016098 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0698  late control D family protein  28.02 
 
 
358 aa  70.1  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1216  phage late control D family protein  28.26 
 
 
339 aa  67.8  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1151  Phage protein D-like  26.37 
 
 
342 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0185813  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2506  phage late control D family protein  27.35 
 
 
338 aa  66.6  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4910  late control D family protein  29.31 
 
 
329 aa  65.9  0.0000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.642723 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02002  hypothetical protein  27 
 
 
337 aa  62.4  0.000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2347  hypothetical protein  24.12 
 
 
337 aa  52.8  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0628868  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4124  late control D family protein  25.86 
 
 
358 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.442041 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0928  Phage protein D-like protein  20.89 
 
 
362 aa  51.6  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0355  late control D family protein  33.33 
 
 
229 aa  50.1  0.00004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>