67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1151 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1151  Phage protein D-like  100 
 
 		 342 aa  703    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0185813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2506  phage late control D family protein  43.9 
 
 		 338 aa  295  6e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02002  hypothetical protein  39.3 
 
 		 337 aa  253  4.0000000000000004e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1152  late control D family protein  29.71 
 
 		 360 aa  121  9.999999999999999e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0391  phage-related tail protein  29.41 
 
 		 360 aa  119  7e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1130  phage-related tail protein  29.41 
 
 		 360 aa  119  7e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3315  phage late control D family protein  27.75 
 
 		 344 aa  114  3e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.154413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1372  phage late control D  30.63 
 
 		 338 aa  112  9e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.475376  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1912  hypothetical protein  31.89 
 
 		 374 aa  110  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0970485  normal  0.714106 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2305  late control D family protein  33.15 
 
 		 364 aa  103  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2352  late control D family protein  32.47 
 
 		 364 aa  102  9e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.065296  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2193  late control gene D protein  33.15 
 
 		 364 aa  101  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01338  bacteriophage P2 gpD protein  29.62 
 
 		 328 aa  102  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.405212  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2586  late control D family protein  28.05 
 
 		 333 aa  97.4  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000462859  hitchhiker  0.00000849595 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2620  late control D family protein  28.05 
 
 		 333 aa  97.4  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000538396  hitchhiker  0.00000000174337 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2487  phage late control gene D protein  33.84 
 
 		 366 aa  97.4  3e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0881  late control D family protein  29.36 
 
 		 357 aa  96.7  5e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0986779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0948  phage late control gene D protein  33.33 
 
 		 366 aa  96.7  5e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.210048  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1325  fels-2 prophage protein  31.09 
 
 		 366 aa  95.9  9e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.370429  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2498  hypothetical protein  42.98 
 
 		 135 aa  95.5  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00376301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2842  phage late control D family protein  32.24 
 
 		 366 aa  95.5  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2751  late control D family protein  32.83 
 
 		 366 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000516519 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1809  late control D family protein  36.08 
 
 		 391 aa  94.7  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000332404  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3198  late control D family protein  32.82 
 
 		 382 aa  94.7  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000789216  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3025  phage late control D family protein  32.24 
 
 		 366 aa  94.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00666291 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37340  Phage late control gene D protein-like protein  26.26 
 
 		 402 aa  94.4  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2665  late control D family protein  31.58 
 
 		 377 aa  93.6  5e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.132861  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0998  phage late control gene D protein  34.34 
 
 		 387 aa  93.2  5e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.780637  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3024  phage late control gene D protein  34.01 
 
 		 387 aa  92.8  7e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.051519 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1359  phage late control D family protein  31.82 
 
 		 366 aa  92.4  9e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0857  late control D family protein  32.47 
 
 		 363 aa  88.6  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000149579  hitchhiker  0.00128029 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4351  phage late control gene D protein  33.84 
 
 		 387 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.395546 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08150  putative phage late control gene D protein  30.26 
 
 		 329 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000948229  hitchhiker  0.000300765 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4389  late control gene D protein  31.78 
 
 		 389 aa  87.8  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.725346  normal  0.0652944 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1278  phage late control D  26.07 
 
 		 332 aa  86.7  5e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.487247 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2889  late control D family protein  25.44 
 
 		 375 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0179  late control D family protein  30.98 
 
 		 383 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.457524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2045  late control D family protein  23.57 
 
 		 373 aa  84.3  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0753  phage late control gene D protein GPD  26.84 
 
 		 480 aa  84.7  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.514992  normal  0.317434 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0355  late control D family protein  29.33 
 
 		 229 aa  83.2  0.000000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3476  phage late control D family protein  31 
 
 		 387 aa  80.5  0.00000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.216601  normal  0.122645 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0772  tail protein D  29.09 
 
 		 331 aa  79.7  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.325808  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4862  late control D family protein  26.78 
 
 		 383 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0171627  normal  0.29405 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0700  Phage protein D-like  28 
 
 		 328 aa  76.6  0.0000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2105  late control D family protein  24.62 
 
 		 401 aa  75.9  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0758552  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0567  prophage P2W3, tail protein D, putative  22.22 
 
 		 314 aa  75.1  0.000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.502953  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4034  late control D family protein  28.28 
 
 		 344 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.356651  unclonable  0.0000000000000337876 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3065  pyocin R2_PP, tail formation  27.24 
 
 		 347 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.561868  normal  0.32013 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0698  late control D family protein  25.3 
 
 		 358 aa  70.1  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1218  late control D family protein  30.88 
 
 		 347 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.868183  hitchhiker  0.000188343 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3390  tail protein D  28.33 
 
 		 347 aa  69.7  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.231627  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2289  phage late control D family protein  26.4 
 
 		 384 aa  68.9  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.775888  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1623  phage-related tail protein  24.93 
 
 		 325 aa  68.6  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3318  phage late control D  21.5 
 
 		 361 aa  67  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1854  phage late control D family protein  24.22 
 
 		 349 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.491572  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2371  phage late control D  21.88 
 
 		 356 aa  60.5  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32130  Phage late control D protein  26.4 
 
 		 274 aa  60.5  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1572  late control D family protein  26.26 
 
 		 386 aa  60.1  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.303406  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0254  tail protein D, putative  22.35 
 
 		 325 aa  52.8  0.000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1918  pyocin R2_PP, tail formation  21.98 
 
 		 350 aa  51.6  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.319398  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2890  late control D family protein  24.24 
 
 		 384 aa  51.2  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.198906  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4462  gp21  25.84 
 
 		 347 aa  50.4  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3003  phage late control D family protein  25.97 
 
 		 324 aa  50.1  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4546  gp47  25.84 
 
 		 347 aa  49.7  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.494674 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4547  gp47  25.84 
 
 		 347 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.92987 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3359  Phage tail protein D  24.86 
 
 		 324 aa  47.4  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2911  prophage MuMc02, late control gene D protein, putative  25.21 
 
 		 347 aa  47  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>