70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0700 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0700  Phage protein D-like  100 
 
 		 328 aa  676    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37340  Phage late control gene D protein-like protein  28.26 
 
 		 402 aa  133  3.9999999999999996e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3315  phage late control D family protein  27.58 
 
 		 344 aa  120  3e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.154413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2289  phage late control D family protein  28.79 
 
 		 384 aa  113  5e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.775888  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2889  late control D family protein  23.46 
 
 		 375 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01338  bacteriophage P2 gpD protein  26.71 
 
 		 328 aa  107  3e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.405212  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1372  phage late control D  25.55 
 
 		 338 aa  107  3e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.475376  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3024  phage late control gene D protein  31.56 
 
 		 387 aa  105  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.051519 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0998  phage late control gene D protein  25.61 
 
 		 387 aa  105  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.780637  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1912  hypothetical protein  23.3 
 
 		 374 aa  105  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0970485  normal  0.714106 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2620  late control D family protein  32 
 
 		 333 aa  104  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000538396  hitchhiker  0.00000000174337 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2586  late control D family protein  32 
 
 		 333 aa  104  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000462859  hitchhiker  0.00000849595 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4351  phage late control gene D protein  25.34 
 
 		 387 aa  103  5e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.395546 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3476  phage late control D family protein  33.73 
 
 		 387 aa  103  5e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.216601  normal  0.122645 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0857  late control D family protein  24.57 
 
 		 363 aa  102  7e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000149579  hitchhiker  0.00128029 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3025  phage late control D family protein  23.51 
 
 		 366 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00666291 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2487  phage late control gene D protein  24.43 
 
 		 366 aa  100  4e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2352  late control D family protein  24.86 
 
 		 364 aa  100  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.065296  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2842  phage late control D family protein  23.21 
 
 		 366 aa  99.8  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0698  late control D family protein  26.33 
 
 		 358 aa  99.8  6e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2305  late control D family protein  25.8 
 
 		 364 aa  99  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2751  late control D family protein  24.43 
 
 		 366 aa  99  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000516519 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1359  phage late control D family protein  23.12 
 
 		 366 aa  97.8  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0567  prophage P2W3, tail protein D, putative  24.46 
 
 		 314 aa  97.8  2e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.502953  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2193  late control gene D protein  24.93 
 
 		 364 aa  97.1  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0948  phage late control gene D protein  23.85 
 
 		 366 aa  97.1  4e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.210048  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3318  phage late control D  26.32 
 
 		 361 aa  96.3  6e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4389  late control gene D protein  24.09 
 
 		 389 aa  96.7  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.725346  normal  0.0652944 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08150  putative phage late control gene D protein  24.77 
 
 		 329 aa  95.9  9e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000948229  hitchhiker  0.000300765 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2045  late control D family protein  33.51 
 
 		 373 aa  95.5  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0753  phage late control gene D protein GPD  25.16 
 
 		 480 aa  93.6  4e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.514992  normal  0.317434 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1218  late control D family protein  28.75 
 
 		 347 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.868183  hitchhiker  0.000188343 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2371  phage late control D  24.93 
 
 		 356 aa  91.3  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1809  late control D family protein  25.14 
 
 		 391 aa  90.1  5e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000332404  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1854  phage late control D family protein  24.32 
 
 		 349 aa  89.4  8e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.491572  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3359  Phage tail protein D  29.24 
 
 		 324 aa  88.6  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3003  phage late control D family protein  28.65 
 
 		 324 aa  88.2  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2105  late control D family protein  26.71 
 
 		 401 aa  87.4  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0758552  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1325  fels-2 prophage protein  29.14 
 
 		 366 aa  87  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.370429  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2665  late control D family protein  25.22 
 
 		 377 aa  86.3  7e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.132861  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3198  late control D family protein  23.55 
 
 		 382 aa  85.9  8e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000789216  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0772  tail protein D  32.37 
 
 		 331 aa  85.9  9e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.325808  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3065  pyocin R2_PP, tail formation  26.73 
 
 		 347 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.561868  normal  0.32013 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4862  late control D family protein  25.15 
 
 		 383 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0171627  normal  0.29405 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0881  late control D family protein  23.72 
 
 		 357 aa  84.7  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0986779  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32130  Phage late control D protein  30.1 
 
 		 274 aa  83.2  0.000000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1152  late control D family protein  29.52 
 
 		 360 aa  83.6  0.000000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1130  phage-related tail protein  29.52 
 
 		 360 aa  82  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1278  phage late control D  25 
 
 		 332 aa  82  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.487247 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0391  phage-related tail protein  29.52 
 
 		 360 aa  82  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0179  late control D family protein  29.82 
 
 		 383 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.457524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4547  gp47  24.38 
 
 		 347 aa  79.7  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.92987 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3390  tail protein D  26.76 
 
 		 347 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.231627  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1918  pyocin R2_PP, tail formation  25.12 
 
 		 350 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.319398  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4462  gp21  24.07 
 
 		 347 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4546  gp47  23.77 
 
 		 347 aa  77  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.494674 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1151  Phage protein D-like  28 
 
 		 342 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0185813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4034  late control D family protein  25.43 
 
 		 344 aa  76.6  0.0000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.356651  unclonable  0.0000000000000337876 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1572  late control D family protein  23.85 
 
 		 386 aa  74.3  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.303406  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2890  late control D family protein  21.71 
 
 		 384 aa  70.5  0.00000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.198906  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2347  hypothetical protein  26.64 
 
 		 337 aa  68.9  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0628868  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2911  prophage MuMc02, late control gene D protein, putative  20.68 
 
 		 347 aa  66.2  0.0000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0254  tail protein D, putative  24.78 
 
 		 325 aa  61.2  0.00000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1623  phage-related tail protein  20.18 
 
 		 325 aa  60.8  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02002  hypothetical protein  22.53 
 
 		 337 aa  60.8  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2506  phage late control D family protein  23.74 
 
 		 338 aa  55.8  0.0000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4910  late control D family protein  24.52 
 
 		 329 aa  53.5  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.642723 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1485  phage late control D family protein  23.48 
 
 		 371 aa  48.1  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0570  late control D family protein  25.88 
 
 		 342 aa  45.8  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3042  hypothetical protein  29.63 
 
 		 361 aa  43.5  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000069589 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>