53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0570 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0570  late control D family protein  100 
 
 		 342 aa  692    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4124  late control D family protein  77.58 
 
 		 358 aa  502  1e-141  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.442041 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1485  phage late control D family protein  41 
 
 		 371 aa  248  7e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2347  hypothetical protein  32.15 
 
 		 337 aa  143  4e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0628868  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0698  late control D family protein  27.63 
 
 		 358 aa  96.3  7e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3318  phage late control D  26.77 
 
 		 361 aa  90.1  5e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2371  phage late control D  27.08 
 
 		 356 aa  86.3  8e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1854  phage late control D family protein  23.56 
 
 		 349 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.491572  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01338  bacteriophage P2 gpD protein  26.06 
 
 		 328 aa  77  0.0000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.405212  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3198  late control D family protein  26.27 
 
 		 382 aa  72.8  0.000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000789216  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3025  phage late control D family protein  26 
 
 		 366 aa  70.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00666291 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3003  phage late control D family protein  25.3 
 
 		 324 aa  70.5  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2842  phage late control D family protein  26.29 
 
 		 366 aa  70.1  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2289  phage late control D family protein  26.63 
 
 		 384 aa  69.7  0.00000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.775888  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1918  pyocin R2_PP, tail formation  24.56 
 
 		 350 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.319398  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3359  Phage tail protein D  25 
 
 		 324 aa  69.7  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3390  tail protein D  24.23 
 
 		 347 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.231627  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1359  phage late control D family protein  26.4 
 
 		 366 aa  67.4  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4389  late control gene D protein  25.85 
 
 		 389 aa  66.6  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.725346  normal  0.0652944 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08150  putative phage late control gene D protein  25.44 
 
 		 329 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000948229  hitchhiker  0.000300765 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0998  phage late control gene D protein  26.87 
 
 		 387 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.780637  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3024  phage late control gene D protein  27.36 
 
 		 387 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.051519 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4351  phage late control gene D protein  26.37 
 
 		 387 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.395546 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2352  late control D family protein  24.58 
 
 		 364 aa  63.9  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.065296  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2193  late control gene D protein  25.56 
 
 		 364 aa  63.2  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0753  phage late control gene D protein GPD  24.27 
 
 		 480 aa  63.2  0.000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.514992  normal  0.317434 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2105  late control D family protein  23.8 
 
 		 401 aa  62  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0758552  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2305  late control D family protein  26.53 
 
 		 364 aa  62.4  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3476  phage late control D family protein  23.97 
 
 		 387 aa  62.4  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.216601  normal  0.122645 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37340  Phage late control gene D protein-like protein  26.52 
 
 		 402 aa  61.2  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2751  late control D family protein  26.48 
 
 		 366 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000516519 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2665  late control D family protein  23.14 
 
 		 377 aa  59.3  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.132861  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0857  late control D family protein  24.86 
 
 		 363 aa  58.2  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000149579  hitchhiker  0.00128029 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3315  phage late control D family protein  23.6 
 
 		 344 aa  58.5  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.154413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0948  phage late control gene D protein  26.69 
 
 		 366 aa  57.8  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.210048  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2487  phage late control gene D protein  26.12 
 
 		 366 aa  57  0.0000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2889  late control D family protein  23.34 
 
 		 375 aa  55.8  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1372  phage late control D  22.98 
 
 		 338 aa  55.1  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.475376  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1152  late control D family protein  21.9 
 
 		 360 aa  54.3  0.000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1130  phage-related tail protein  22.03 
 
 		 360 aa  53.9  0.000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0391  phage-related tail protein  22.03 
 
 		 360 aa  53.9  0.000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1218  late control D family protein  23.94 
 
 		 347 aa  52.8  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.868183  hitchhiker  0.000188343 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2620  late control D family protein  22.16 
 
 		 333 aa  51.6  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000538396  hitchhiker  0.00000000174337 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2586  late control D family protein  22.16 
 
 		 333 aa  51.6  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000462859  hitchhiker  0.00000849595 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0881  late control D family protein  23.3 
 
 		 357 aa  50.8  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0986779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2045  late control D family protein  24.31 
 
 		 373 aa  51.2  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0700  Phage protein D-like  23.83 
 
 		 328 aa  50.4  0.00005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4862  late control D family protein  23.12 
 
 		 383 aa  48.9  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0171627  normal  0.29405 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0179  late control D family protein  22.61 
 
 		 383 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.457524  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32130  Phage late control D protein  22.31 
 
 		 274 aa  48.5  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1809  late control D family protein  24.69 
 
 		 391 aa  48.1  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000332404  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3065  pyocin R2_PP, tail formation  22.16 
 
 		 347 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.561868  normal  0.32013 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1278  phage late control D  22.97 
 
 		 332 aa  45.1  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.487247 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>