60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4124 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_4124  late control D family protein  100 
 
 
358 aa  724    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.442041 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0570  late control D family protein  77.19 
 
 
342 aa  524  1e-148  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1485  phage late control D family protein  40.35 
 
 
371 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2347  hypothetical protein  33.82 
 
 
337 aa  157  3e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0628868  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3318  phage late control D  29.66 
 
 
361 aa  116  5e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2371  phage late control D  29.05 
 
 
356 aa  112  7.000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1854  phage late control D family protein  27.6 
 
 
349 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.491572  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0698  late control D family protein  26.73 
 
 
358 aa  94  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1918  pyocin R2_PP, tail formation  25.52 
 
 
350 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.319398  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2289  phage late control D family protein  25.3 
 
 
384 aa  83.2  0.000000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.775888  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3476  phage late control D family protein  28.98 
 
 
387 aa  82.8  0.000000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.216601  normal  0.122645 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3198  late control D family protein  26.61 
 
 
382 aa  80.5  0.00000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000789216  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01338  bacteriophage P2 gpD protein  25.45 
 
 
328 aa  79.3  0.00000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.405212  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4389  late control gene D protein  25.2 
 
 
389 aa  79.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.725346  normal  0.0652944 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3025  phage late control D family protein  29.65 
 
 
366 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00666291 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1359  phage late control D family protein  29.65 
 
 
366 aa  74.7  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37340  Phage late control gene D protein-like protein  29.23 
 
 
402 aa  74.3  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0753  phage late control gene D protein GPD  25.62 
 
 
480 aa  73.6  0.000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.514992  normal  0.317434 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2842  phage late control D family protein  26.42 
 
 
366 aa  72.8  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3390  tail protein D  25.99 
 
 
347 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.231627  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0881  late control D family protein  26.27 
 
 
357 aa  71.2  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0986779  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1372  phage late control D  25.32 
 
 
338 aa  71.2  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.475376  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08150  putative phage late control gene D protein  25.22 
 
 
329 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000948229  hitchhiker  0.000300765 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3024  phage late control gene D protein  25.61 
 
 
387 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.051519 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3003  phage late control D family protein  25 
 
 
324 aa  68.6  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3359  Phage tail protein D  25 
 
 
324 aa  68.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1623  phage-related tail protein  23.26 
 
 
325 aa  67.4  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4351  phage late control gene D protein  25.07 
 
 
387 aa  67.4  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.395546 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0857  late control D family protein  25.79 
 
 
363 aa  67  0.0000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000149579  hitchhiker  0.00128029 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0998  phage late control gene D protein  25.34 
 
 
387 aa  66.6  0.0000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.780637  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1218  late control D family protein  25.98 
 
 
347 aa  66.6  0.0000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.868183  hitchhiker  0.000188343 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3315  phage late control D family protein  25 
 
 
344 aa  66.2  0.0000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.154413  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1278  phage late control D  25.37 
 
 
332 aa  64.7  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.487247 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0948  phage late control gene D protein  27.36 
 
 
366 aa  63.5  0.000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.210048  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2487  phage late control gene D protein  26.87 
 
 
366 aa  63.2  0.000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2751  late control D family protein  26.87 
 
 
366 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000516519 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32130  Phage late control D protein  25.86 
 
 
274 aa  61.2  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2193  late control gene D protein  25.49 
 
 
364 aa  60.5  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2305  late control D family protein  26.5 
 
 
364 aa  60.1  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2352  late control D family protein  23.51 
 
 
364 aa  59.3  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.065296  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1152  late control D family protein  22.19 
 
 
360 aa  59.3  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0391  phage-related tail protein  21.9 
 
 
360 aa  58.5  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1130  phage-related tail protein  21.9 
 
 
360 aa  58.5  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4862  late control D family protein  24.75 
 
 
383 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0171627  normal  0.29405 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3065  pyocin R2_PP, tail formation  23.85 
 
 
347 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.561868  normal  0.32013 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2889  late control D family protein  23.47 
 
 
375 aa  54.7  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2105  late control D family protein  21.73 
 
 
401 aa  55.1  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0758552  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0179  late control D family protein  23.62 
 
 
383 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.457524  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2045  late control D family protein  24.73 
 
 
373 aa  54.3  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2665  late control D family protein  24.19 
 
 
377 aa  54.7  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.132861  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2620  late control D family protein  21.33 
 
 
333 aa  53.5  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000538396  hitchhiker  0.00000000174337 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2586  late control D family protein  21.33 
 
 
333 aa  53.5  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000462859  hitchhiker  0.00000849595 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0700  Phage protein D-like  22.92 
 
 
328 aa  53.5  0.000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1325  fels-2 prophage protein  21.01 
 
 
366 aa  52.4  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.370429  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0772  tail protein D  22.94 
 
 
331 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.325808  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1572  late control D family protein  25.54 
 
 
386 aa  48.9  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.303406  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4034  late control D family protein  22.84 
 
 
344 aa  47  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.356651  unclonable  0.0000000000000337876 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1912  hypothetical protein  24.5 
 
 
374 aa  46.6  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0970485  normal  0.714106 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2890  late control D family protein  23.91 
 
 
384 aa  45.4  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.198906  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1809  late control D family protein  23.08 
 
 
391 aa  43.5  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000332404  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>