45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0938 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3822  phage protein D-like  98.59 
 
 		 427 aa  864    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1883  Phage protein D-like  96.49 
 
 		 427 aa  851    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.109131  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0938  Phage protein D-like  100 
 
 		 427 aa  874    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0367858  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0662  putative phage late control gene D protein  26.92 
 
 		 417 aa  133  6.999999999999999e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0852  putative phage late control gene D protein  27.15 
 
 		 417 aa  128  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0982  hypothetical protein  26.63 
 
 		 362 aa  93.2  8e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2817  Rhs element Vgr protein  24.8 
 
 		 593 aa  82.8  0.000000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1663  Rhs element Vgr protein  23.51 
 
 		 589 aa  75.9  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.485896  normal  0.191701 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1869  hypothetical protein  23.36 
 
 		 406 aa  73.2  0.000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1508  phage protein D  27.24 
 
 		 348 aa  65.5  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2556  hypothetical protein  25.63 
 
 		 379 aa  62  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000358753 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1954  Phage protein D-like protein  22.62 
 
 		 407 aa  61.6  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1682  Rhs element Vgr protein  24.71 
 
 		 589 aa  59.3  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2550  Rhs element Vgr protein  24.57 
 
 		 589 aa  57.8  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1137  hypothetical protein  22.65 
 
 		 381 aa  56.6  0.0000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1749  hypothetical protein  22.82 
 
 		 384 aa  55.1  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.698415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1626  Rhs element Vgr protein  24.66 
 
 		 592 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0131276 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0676  Rhs element Vgr protein  22.22 
 
 		 596 aa  53.5  0.000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4347  hypothetical protein  32.88 
 
 		 393 aa  53.1  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.21518  normal  0.0759441 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0770  Phage protein D-like protein  22.51 
 
 		 341 aa  53.1  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.737587  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2842  phage late control D family protein  25.7 
 
 		 366 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1732  Rhs element Vgr protein  23.92 
 
 		 641 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00520263 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1359  phage late control D family protein  30.68 
 
 		 366 aa  52  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2911  prophage MuMc02, late control gene D protein, putative  27.31 
 
 		 347 aa  51.6  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0369  Rhs element Vgr protein  22.86 
 
 		 596 aa  51.2  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1572  late control D family protein  21.82 
 
 		 386 aa  50.8  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.303406  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3025  phage late control D family protein  26.24 
 
 		 366 aa  50.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00666291 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5250  Rhs element Vgr protein  21.16 
 
 		 596 aa  50.1  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012293 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2890  late control D family protein  22.61 
 
 		 384 aa  49.3  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.198906  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4389  late control gene D protein  27.78 
 
 		 389 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.725346  normal  0.0652944 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4547  gp47  27.55 
 
 		 347 aa  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.92987 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4546  gp47  26.67 
 
 		 347 aa  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.494674 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4462  gp21  26.15 
 
 		 347 aa  47.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4351  phage late control gene D protein  25.43 
 
 		 387 aa  47.4  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.395546 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0669  Rhs element Vgr protein  20.92 
 
 		 576 aa  47  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3664  hypothetical protein  23.38 
 
 		 360 aa  47  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000879822 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3024  phage late control gene D protein  26.01 
 
 		 387 aa  47  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.051519 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2487  phage late control gene D protein  28.07 
 
 		 366 aa  46.2  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4390  Rhs element Vgr protein  25.32 
 
 		 652 aa  46.6  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.86257  normal  0.698434 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0926  Rhs element Vgr protein  25.59 
 
 		 587 aa  46.6  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.91076  normal  0.482817 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2751  late control D family protein  27.81 
 
 		 366 aa  45.1  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000516519 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0948  phage late control gene D protein  27.81 
 
 		 366 aa  45.4  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.210048  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2267  Rhs element Vgr protein  20.37 
 
 		 610 aa  44.7  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.267374  hitchhiker  0.000675551 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0998  phage late control gene D protein  24.86 
 
 		 387 aa  44.3  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.780637  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3003  Rhs element Vgr protein  20.61 
 
 		 598 aa  44.3  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>