51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0982 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0982  hypothetical protein  100 
 
 		 362 aa  731    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3664  hypothetical protein  33.88 
 
 		 360 aa  150  4e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000879822 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2817  Rhs element Vgr protein  31.55 
 
 		 593 aa  149  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1663  Rhs element Vgr protein  30.36 
 
 		 589 aa  143  4e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.485896  normal  0.191701 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1626  Rhs element Vgr protein  27.02 
 
 		 592 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0131276 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1508  phage protein D  28.93 
 
 		 348 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4347  hypothetical protein  30.98 
 
 		 393 aa  123  6e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.21518  normal  0.0759441 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0770  Phage protein D-like protein  27.92 
 
 		 341 aa  121  1.9999999999999998e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.737587  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1906  Rhs element Vgr protein  30.14 
 
 		 606 aa  120  3e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0194585  hitchhiker  0.0014616 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1954  Phage protein D-like protein  27.66 
 
 		 407 aa  116  5e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0926  Rhs element Vgr protein  28.53 
 
 		 587 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.91076  normal  0.482817 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1732  Rhs element Vgr protein  24.73 
 
 		 641 aa  112  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00520263 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1869  hypothetical protein  27.18 
 
 		 406 aa  109  9.000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5384  Rhs element Vgr protein  27.47 
 
 		 602 aa  97.1  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3822  Rhs element Vgr protein  27.27 
 
 		 578 aa  94  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.112104  normal  0.0443202 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3822  phage protein D-like  26.5 
 
 		 427 aa  94.4  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1883  Phage protein D-like  26.63 
 
 		 427 aa  93.6  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.109131  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0938  Phage protein D-like  26.63 
 
 		 427 aa  93.2  6e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0367858  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4390  Rhs element Vgr protein  28.12 
 
 		 652 aa  89.7  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.86257  normal  0.698434 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2267  Rhs element Vgr protein  27.62 
 
 		 610 aa  88.6  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.267374  hitchhiker  0.000675551 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0662  putative phage late control gene D protein  26.5 
 
 		 417 aa  78.6  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2945  Rhs element Vgr protein  27.46 
 
 		 589 aa  77.4  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.703955  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3042  hypothetical protein  27.39 
 
 		 361 aa  77.4  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000069589 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0852  putative phage late control gene D protein  25.87 
 
 		 417 aa  74.7  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3609  Rhs element Vgr protein  24.56 
 
 		 574 aa  73.9  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000128418 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2462  hypothetical protein  25.93 
 
 		 595 aa  73.2  0.000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0369  Rhs element Vgr protein  24.16 
 
 		 596 aa  68.2  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2550  Rhs element Vgr protein  23.15 
 
 		 589 aa  66.6  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1042  phosphoserine phosphatase SerB  23.03 
 
 		 565 aa  64.7  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1682  Rhs element Vgr protein  23.44 
 
 		 589 aa  65.5  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0669  Rhs element Vgr protein  22.85 
 
 		 576 aa  63.9  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5250  Rhs element Vgr protein  22.59 
 
 		 596 aa  63.5  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012293 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1080  hypothetical protein  23.96 
 
 		 599 aa  63.2  0.000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.752206 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0676  Rhs element Vgr protein  23.35 
 
 		 596 aa  63.2  0.000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2892  hypothetical protein  27.05 
 
 		 499 aa  62  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1564  hypothetical protein  26.96 
 
 		 504 aa  61.2  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.21515 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1818  hypothetical protein  25.82 
 
 		 352 aa  60.8  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3155  Rhs element Vgr protein  21.38 
 
 		 581 aa  60.1  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1749  hypothetical protein  24.84 
 
 		 384 aa  55.8  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.698415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26590  hypothetical protein  29.45 
 
 		 599 aa  54.3  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0848935  normal  0.672502 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3927  Rhs element Vgr protein  22.58 
 
 		 604 aa  53.1  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00332693  hitchhiker  0.00450013 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2556  hypothetical protein  24.24 
 
 		 379 aa  52.8  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000358753 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1051  Rhs element Vgr protein  27.13 
 
 		 594 aa  51.6  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1137  hypothetical protein  24.36 
 
 		 381 aa  50.8  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3003  Rhs element Vgr protein  21.6 
 
 		 598 aa  50.4  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2911  prophage MuMc02, late control gene D protein, putative  28.02 
 
 		 347 aa  49.3  0.00009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0753  phage late control gene D protein GPD  25.21 
 
 		 480 aa  47.8  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.514992  normal  0.317434 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1876  hypothetical protein  25.21 
 
 		 349 aa  46.2  0.0008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.16394  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4910  late control D family protein  28.43 
 
 		 329 aa  45.1  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.642723 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1218  late control D family protein  28.17 
 
 		 347 aa  43.5  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.868183  hitchhiker  0.000188343 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4864  Rhs element Vgr protein  23.35 
 
 		 599 aa  42.7  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0846936  normal  0.155196 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>