25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1749 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_1749  hypothetical protein  100 
 
 
384 aa  775    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.698415  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1137  hypothetical protein  48.66 
 
 
381 aa  325  1e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2556  hypothetical protein  44.91 
 
 
379 aa  291  1e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000358753 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1815  hypothetical protein  26.23 
 
 
384 aa  79.3  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.553808 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1494  hypothetical protein  25.99 
 
 
375 aa  74.7  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1818  hypothetical protein  26.92 
 
 
352 aa  71.6  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3927  Rhs element Vgr protein  21.74 
 
 
604 aa  57.4  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00332693  hitchhiker  0.00450013 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1883  Phage protein D-like  22.82 
 
 
427 aa  55.8  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.109131  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0982  hypothetical protein  24.84 
 
 
362 aa  55.8  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0938  Phage protein D-like  22.82 
 
 
427 aa  55.1  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0367858  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3822  phage protein D-like  22.22 
 
 
427 aa  54.7  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2550  Rhs element Vgr protein  23.49 
 
 
589 aa  53.9  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0822  hypothetical protein  23.92 
 
 
371 aa  51.6  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1682  Rhs element Vgr protein  23.81 
 
 
589 aa  52  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2817  Rhs element Vgr protein  24.03 
 
 
593 aa  50.4  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3155  Rhs element Vgr protein  21.57 
 
 
581 aa  45.1  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3003  Rhs element Vgr protein  23.6 
 
 
598 aa  45.4  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2462  hypothetical protein  22.48 
 
 
595 aa  44.3  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0770  Phage protein D-like protein  21.45 
 
 
341 aa  44.3  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.737587  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1663  Rhs element Vgr protein  24.59 
 
 
589 aa  43.9  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.485896  normal  0.191701 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1732  Rhs element Vgr protein  23.59 
 
 
641 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00520263 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1508  phage protein D  32.08 
 
 
348 aa  43.5  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0854  hypothetical protein  38.81 
 
 
380 aa  43.5  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5250  Rhs element Vgr protein  24.05 
 
 
596 aa  43.5  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00012293 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1954  Phage protein D-like protein  42.86 
 
 
407 aa  42.7  0.01  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>