48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3664 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3664  hypothetical protein  100 
 
 		 360 aa  744    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000879822 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2817  Rhs element Vgr protein  35.82 
 
 		 593 aa  179  5.999999999999999e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1663  Rhs element Vgr protein  33.83 
 
 		 589 aa  159  5e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.485896  normal  0.191701 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1626  Rhs element Vgr protein  29.41 
 
 		 592 aa  150  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0131276 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0982  hypothetical protein  33.88 
 
 		 362 aa  150  4e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1508  phage protein D  30.81 
 
 		 348 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0926  Rhs element Vgr protein  29.62 
 
 		 587 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.91076  normal  0.482817 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1906  Rhs element Vgr protein  29.77 
 
 		 606 aa  106  6e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0194585  hitchhiker  0.0014616 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1732  Rhs element Vgr protein  23.97 
 
 		 641 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00520263 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2945  Rhs element Vgr protein  29.79 
 
 		 589 aa  101  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.703955  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2267  Rhs element Vgr protein  29.69 
 
 		 610 aa  91.7  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.267374  hitchhiker  0.000675551 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4390  Rhs element Vgr protein  28.13 
 
 		 652 aa  89.7  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.86257  normal  0.698434 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3822  Rhs element Vgr protein  25.22 
 
 		 578 aa  85.9  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.112104  normal  0.0443202 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0770  Phage protein D-like protein  27.39 
 
 		 341 aa  83.2  0.000000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.737587  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5384  Rhs element Vgr protein  28.48 
 
 		 602 aa  82.8  0.000000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3609  Rhs element Vgr protein  28.72 
 
 		 574 aa  81.6  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000128418 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1954  Phage protein D-like protein  25.77 
 
 		 407 aa  79  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1876  hypothetical protein  25.87 
 
 		 349 aa  74.7  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.16394  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2550  Rhs element Vgr protein  26.16 
 
 		 589 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2462  hypothetical protein  26.77 
 
 		 595 aa  74.3  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3155  Rhs element Vgr protein  25.09 
 
 		 581 aa  72.8  0.000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1682  Rhs element Vgr protein  26.16 
 
 		 589 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4347  hypothetical protein  27.41 
 
 		 393 aa  69.3  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.21518  normal  0.0759441 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1051  Rhs element Vgr protein  30.1 
 
 		 594 aa  69.3  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2892  hypothetical protein  26.97 
 
 		 499 aa  68.2  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1869  hypothetical protein  24.13 
 
 		 406 aa  67.8  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0369  Rhs element Vgr protein  21.67 
 
 		 596 aa  66.2  0.0000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26590  hypothetical protein  27.01 
 
 		 599 aa  65.5  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0848935  normal  0.672502 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3042  hypothetical protein  25.41 
 
 		 361 aa  65.5  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000069589 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5250  Rhs element Vgr protein  25.33 
 
 		 596 aa  63.5  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012293 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0676  Rhs element Vgr protein  24.22 
 
 		 596 aa  62  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1564  hypothetical protein  22.09 
 
 		 504 aa  58.2  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.21515 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1042  phosphoserine phosphatase SerB  22.59 
 
 		 565 aa  55.8  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0669  Rhs element Vgr protein  22.92 
 
 		 576 aa  53.1  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3927  Rhs element Vgr protein  22.98 
 
 		 604 aa  52.4  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00332693  hitchhiker  0.00450013 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1325  fels-2 prophage protein  31.45 
 
 		 366 aa  49.3  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.370429  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0938  Phage protein D-like  23.38 
 
 		 427 aa  47  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0367858  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4546  gp47  25.69 
 
 		 347 aa  46.6  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.494674 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3822  phage protein D-like  22.22 
 
 		 427 aa  46.6  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4547  gp47  25.69 
 
 		 347 aa  46.6  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.92987 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1883  Phage protein D-like  23.38 
 
 		 427 aa  46.2  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.109131  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3003  Rhs element Vgr protein  22.51 
 
 		 598 aa  46.2  0.0009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4462  gp21  25.39 
 
 		 347 aa  46.2  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0662  putative phage late control gene D protein  24.32 
 
 		 417 aa  45.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0852  putative phage late control gene D protein  25.09 
 
 		 417 aa  45.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7557  vgrG protein  22.37 
 
 		 653 aa  43.9  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3025  phage late control D family protein  29.03 
 
 		 366 aa  43.1  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00666291 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1216  phage late control D family protein  24.3 
 
 		 339 aa  42.7  0.009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>