More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0650 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_0650  Rhs element Vgr protein  100 
 
 
727 aa  1452    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0732792  normal  0.0253872 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0838  Rhs element Vgr protein  88.6 
 
 
697 aa  1210    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1145  Rhs element Vgr protein  87.78 
 
 
706 aa  1221    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3719  Rhs element Vgr protein  44.86 
 
 
723 aa  565  1.0000000000000001e-159  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.331309  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2151  Rhs element Vgr protein  45.62 
 
 
706 aa  557  1e-157  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2572  Rhs element Vgr protein  45.11 
 
 
687 aa  527  1e-148  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0544876  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2579  Rhs element Vgr protein  45.11 
 
 
687 aa  527  1e-148  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0472026  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2565  Rhs element Vgr protein  45.11 
 
 
687 aa  527  1e-148  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.125293  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3454  type VI secretion system Vgr family protein  42.29 
 
 
655 aa  500  1e-140  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2825  type VI secretion system Vgr family protein  41.76 
 
 
678 aa  501  1e-140  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2188  type VI secretion system Vgr family protein  42.29 
 
 
656 aa  500  1e-140  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.33539  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3238  type VI secretion system Vgr family protein  40.96 
 
 
678 aa  494  9.999999999999999e-139  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1026  vgrG protein  41.55 
 
 
1095 aa  492  9.999999999999999e-139  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0115  vgrG protein  42.57 
 
 
694 aa  490  1e-137  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1183  Rhs element Vgr protein  42.04 
 
 
694 aa  492  1e-137  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1212  Rhs element Vgr protein  42.04 
 
 
699 aa  489  1e-137  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0014  vgrG protein  42.47 
 
 
1017 aa  482  1e-135  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1194  Rhs element Vgr protein  40.82 
 
 
655 aa  481  1e-134  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1502  type VI secretion system Vgr family protein  42.16 
 
 
617 aa  478  1e-133  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0345  type VI secretion system Vgr family protein  42.02 
 
 
619 aa  474  1e-132  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0418  type VI secretion system Vgr family protein  42 
 
 
617 aa  474  1e-132  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1162  type VI secretion system Vgr family protein  40.81 
 
 
617 aa  473  1e-132  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.754803  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0043  Rhs element Vgr protein  88.93 
 
 
320 aa  474  1e-132  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1607  type VI secretion system Vgr family protein  41.24 
 
 
616 aa  475  1e-132  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4257  type VI secretion system Vgr family protein  41.85 
 
 
610 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2559  type VI secretion system Vgr family protein  40.97 
 
 
618 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0648  type VI secretion system Vgr family protein  40.51 
 
 
609 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2696  type VI secretion system Vgr family protein  40.56 
 
 
615 aa  467  9.999999999999999e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.187576  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2513  type VI secretion system Vgr family protein  37.22 
 
 
682 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0053  type VI secretion system Vgr family protein  41.27 
 
 
617 aa  457  1e-127  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0339  putative VgrG protein  38.69 
 
 
732 aa  427  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0764  type VI secretion system Vgr family protein  35.29 
 
 
741 aa  428  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0401  type VI secretion system Vgr family protein  37.61 
 
 
740 aa  426  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0328  Rhs element Vgr protein  38.27 
 
 
740 aa  426  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0696  putative VgrG protein  35.29 
 
 
741 aa  427  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0107  Rhs element Vgr protein  38.81 
 
 
693 aa  414  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0820  Rhs element Vgr protein  38.54 
 
 
694 aa  414  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.476122  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5436  Rhs element Vgr protein  38.01 
 
 
680 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3533  type VI secretion system Vgr family protein  38.89 
 
 
725 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67230  hypothetical protein  41.21 
 
 
790 aa  402  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2631  Rhs element Vgr protein  36.43 
 
 
684 aa  399  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5415  Rhs element Vgr protein  38.69 
 
 
678 aa  389  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43080  hypothetical protein  38.85 
 
 
680 aa  390  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000000176027  normal  0.282542 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4385  Rhs element Vgr protein  36.84 
 
 
763 aa  387  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3234  type VI secretion system Vgr family protein  32.9 
 
 
722 aa  388  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69550  hypothetical protein  40.3 
 
 
680 aa  387  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.256731  normal  0.401785 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2044  Rhs element Vgr protein  37.11 
 
 
680 aa  385  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.909849  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3035  type VI secretion system Vgr family protein  34.45 
 
 
683 aa  382  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4488  Rhs element Vgr protein  37.94 
 
 
702 aa  380  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2117  Rhs element Vgr protein  33.78 
 
 
722 aa  379  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2614  vgrG protein  33.07 
 
 
722 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0110775 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18985  hypothetical protein  40.09 
 
 
808 aa  375  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000261066  normal  0.267032 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1216  type VI secretion system Vgr family protein  34.3 
 
 
683 aa  372  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21450  hypothetical protein  39.68 
 
 
688 aa  371  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3386  vgrG protein  37.12 
 
 
725 aa  368  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.160309  normal  0.824381 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2557  type VI secretion system Vgr family protein  34.48 
 
 
726 aa  369  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.482945  normal  0.0643046 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5574  Rhs element Vgr protein  37.66 
 
 
741 aa  368  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.151496 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05870  hypothetical protein  34.84 
 
 
692 aa  369  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2858  type VI secretion system Vgr family protein  35.17 
 
 
692 aa  366  1e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.374803  normal  0.207801 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000448  VgrG protein  35.28 
 
 
692 aa  365  2e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000107078  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2371  Rhs element Vgr protein  36.34 
 
 
725 aa  362  1e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_36  VgrG protein, VgrG-2  33.14 
 
 
754 aa  361  3e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2538  Rhs element Vgr protein  37.48 
 
 
680 aa  360  5e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1114  type VI secretion system Vgr family protein  37.46 
 
 
713 aa  360  7e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1155  type VI secretion system Vgr family protein  40.59 
 
 
706 aa  360  7e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0542625  normal  0.843476 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4049  vgrG protein  35.56 
 
 
771 aa  357  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.253476  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1234  Vgr family type VI secretion system  34.66 
 
 
704 aa  353  5.9999999999999994e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.270466 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01965  hypothetical protein  32.39 
 
 
771 aa  350  4e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1358  VgrG preotein, VgrG-2  35.01 
 
 
754 aa  349  8e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0649  type VI secretion system Vgr family protein  37.07 
 
 
633 aa  343  5.999999999999999e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.823903  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0616  type VI secretion system Vgr family protein  36.76 
 
 
633 aa  341  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0499415  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3077  type VI secretion system Vgr family protein  36.76 
 
 
633 aa  341  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0454  Rhs element Vgr protein  37.09 
 
 
671 aa  340  4e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0587  type VI secretion system Vgr family protein  36.45 
 
 
633 aa  337  5e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1638  type VI secretion system Vgr family protein  38.3 
 
 
702 aa  335  2e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.674786  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0243  type VI secretion system Vgr family protein  35.55 
 
 
713 aa  335  2e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2202  type VI secretion system Vgr family protein  37.93 
 
 
702 aa  334  4e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0264417  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0245  type VI secretion system Vgr family protein  35.55 
 
 
713 aa  333  5e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0251  type VI secretion system Vgr family protein  35.79 
 
 
713 aa  333  6e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.830075 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2064  type VI secretion system Vgr family protein  37.5 
 
 
702 aa  333  8e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.201838  normal  0.0713545 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03220  hypothetical protein  39.92 
 
 
1019 aa  323  9.000000000000001e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000195826 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44900  hypothetical protein  40.53 
 
 
842 aa  323  9.000000000000001e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0151345  normal  0.422437 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3482  Rhs element Vgr protein  33.38 
 
 
675 aa  321  3e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0192027  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0153  Rhs element Vgr protein  35.24 
 
 
689 aa  318  2e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1248  hypothetical protein  40.69 
 
 
1019 aa  317  4e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.60494  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3849  Rhs element Vgr protein  34.33 
 
 
675 aa  316  8e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2888  hypothetical protein  34.24 
 
 
668 aa  316  9.999999999999999e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.882104  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3949  Rhs element Vgr protein  35.64 
 
 
691 aa  313  6.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.809054  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3415  Rhs element Vgr protein  33.77 
 
 
669 aa  313  9e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.960838  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33960  hypothetical protein  34.15 
 
 
668 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000148732  normal  0.101757 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0286  Rhs element Vgr protein:Gp5-like  31.76 
 
 
709 aa  304  3.0000000000000004e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.856224 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50870  Rhs element Vgr protein  34.07 
 
 
668 aa  297  6e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5597  Rhs element Vgr protein  34.55 
 
 
1118 aa  287  5e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0169  hypothetical protein  31.6 
 
 
741 aa  286  7e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0250  type VI secretion system Vgr family protein  32.63 
 
 
794 aa  283  9e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01160  hypothetical protein  31.57 
 
 
741 aa  282  1e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73633  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3868  type VI secretion system Vgr family protein  31.29 
 
 
730 aa  278  4e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0373872  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3783  Rhs element Vgr protein  31.27 
 
 
785 aa  277  6e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.757692  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3019  type VI secretion system Vgr family protein  31.45 
 
 
1048 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.103132  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0163  hypothetical protein  32.48 
 
 
646 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.766784  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>