262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4109 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4109  Rhs element Vgr protein  100 
 
 		 576 aa  1191    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0273732 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0660  hypothetical protein  29.93 
 
 		 605 aa  247  4e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.279373 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6416  Rhs element Vgr protein  28.38 
 
 		 617 aa  194  4e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4864  Rhs element Vgr protein  26.32 
 
 		 599 aa  187  3e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0846936  normal  0.155196 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3260  Rhs element Vgr protein  29.9 
 
 		 602 aa  169  2e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.386521  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5894  Rhs element Vgr protein  24.83 
 
 		 615 aa  157  4e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3589  Rhs element Vgr protein  25.24 
 
 		 612 aa  145  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.512863 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1796  Rhs element Vgr protein  25.61 
 
 		 619 aa  139  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3931  Rhs element Vgr protein  26.09 
 
 		 616 aa  132  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.410968  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3220  Rhs element Vgr protein  26.11 
 
 		 618 aa  129  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4015  Rhs element Vgr protein  25.93 
 
 		 602 aa  125  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.211679  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1663  Rhs element Vgr protein  23.75 
 
 		 589 aa  103  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.485896  normal  0.191701 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3609  Rhs element Vgr protein  24.29 
 
 		 574 aa  102  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000128418 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2888  hypothetical protein  23.99 
 
 		 668 aa  100  5e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.882104  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2267  Rhs element Vgr protein  22.81 
 
 		 610 aa  100  9e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.267374  hitchhiker  0.000675551 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1906  Rhs element Vgr protein  28.81 
 
 		 606 aa  97.4  6e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0194585  hitchhiker  0.0014616 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0983  hypothetical protein  27.43 
 
 		 218 aa  94.7  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208742  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33960  hypothetical protein  25.43 
 
 		 668 aa  94.7  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000148732  normal  0.101757 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0769  Rhs element Vgr protein  30 
 
 		 248 aa  91.3  4e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2817  Rhs element Vgr protein  22.59 
 
 		 593 aa  90.5  7e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2550  Rhs element Vgr protein  25.47 
 
 		 589 aa  89.7  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3415  Rhs element Vgr protein  24.18 
 
 		 669 aa  88.6  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.960838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1626  Rhs element Vgr protein  21.58 
 
 		 592 aa  88.2  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0131276 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1682  Rhs element Vgr protein  25.8 
 
 		 589 aa  88.2  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5250  Rhs element Vgr protein  22.75 
 
 		 596 aa  87.8  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012293 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26590  hypothetical protein  23.23 
 
 		 599 aa  87.4  6e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0848935  normal  0.672502 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50870  Rhs element Vgr protein  24.43 
 
 		 668 aa  87.4  7e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5384  Rhs element Vgr protein  24.37 
 
 		 602 aa  85.5  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0926  Rhs element Vgr protein  28.63 
 
 		 587 aa  84.7  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.91076  normal  0.482817 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2462  hypothetical protein  24.91 
 
 		 595 aa  84.3  0.000000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1051  Rhs element Vgr protein  28.66 
 
 		 594 aa  83.6  0.000000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1042  phosphoserine phosphatase SerB  24.41 
 
 		 565 aa  83.2  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1732  Rhs element Vgr protein  23.01 
 
 		 641 aa  80.9  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00520263 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00256  Rhs-family protein  25.27 
 
 		 645 aa  80.5  0.00000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3003  Rhs element Vgr protein  24.3 
 
 		 598 aa  80.5  0.00000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2044  Rhs element Vgr protein  21.67 
 
 		 680 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.909849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2357  type VI secretion system Vgr family protein  23.74 
 
 		 619 aa  79  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.116837 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6682  type VI secretion system Vgr family protein  22.06 
 
 		 1057 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3684  Rhs element Vgr protein  29.6 
 
 		 247 aa  77.8  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.149401  hitchhiker  0.000521794 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3019  type VI secretion system Vgr family protein  22.47 
 
 		 1048 aa  77  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.103132  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0676  Rhs element Vgr protein  27.38 
 
 		 596 aa  75.9  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0669  Rhs element Vgr protein  23.06 
 
 		 576 aa  75.1  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0369  Rhs element Vgr protein  26.05 
 
 		 596 aa  75.1  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1726  Rhs element Vgr protein  23.47 
 
 		 642 aa  73.9  0.000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4080  type VI secretion system Vgr family protein  26.1 
 
 		 771 aa  73.9  0.000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000279673 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0166  Rhs element Vgr protein  21.85 
 
 		 930 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.275346  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1613  Rhs element Vgr protein  21.85 
 
 		 858 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3155  Rhs element Vgr protein  22 
 
 		 581 aa  72.4  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0143  Rhs element Vgr protein  21.85 
 
 		 896 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420233  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2568  Rhs element Vgr protein  22.56 
 
 		 661 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3177  Rhs family protein  24.56 
 
 		 697 aa  70.9  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3849  Rhs element Vgr protein  23.51 
 
 		 675 aa  70.9  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1269  Rhs element Vgr protein  22.35 
 
 		 661 aa  70.9  0.00000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0412192  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0240  Rhs element Vgr protein  22.35 
 
 		 661 aa  70.9  0.00000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1057  Rhs element Vgr protein  22.35 
 
 		 661 aa  70.9  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.517121  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0511  Rhs element Vgr protein  22.35 
 
 		 661 aa  70.9  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0129  Rhs element Vgr protein  21.67 
 
 		 872 aa  70.9  0.00000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176404  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1401  Rhs element Vgr protein  22.35 
 
 		 661 aa  70.9  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764688  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4390  Rhs element Vgr protein  23.94 
 
 		 652 aa  70.5  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.86257  normal  0.698434 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1320  Rhs element Vgr protein  22.91 
 
 		 661 aa  70.1  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.249702  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5436  Rhs element Vgr protein  21.3 
 
 		 680 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4385  Rhs element Vgr protein  24.6 
 
 		 763 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2360  Rhs element Vgr protein  21.91 
 
 		 618 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2631  Rhs element Vgr protein  23.99 
 
 		 684 aa  68.2  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1436  Rhs element Vgr protein  22.07 
 
 		 661 aa  68.2  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.064161  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1509  Rhs element Vgr protein  28.31 
 
 		 239 aa  67.4  0.0000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1538  two component LuxR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 621 aa  66.6  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0014  vgrG protein  21.19 
 
 		 1017 aa  66.6  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2758  vgrG protein  34.44 
 
 		 774 aa  65.9  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67230  hypothetical protein  21.9 
 
 		 790 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0023  Rhs element Vgr protein  21.64 
 
 		 1041 aa  65.9  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000448  VgrG protein  23.84 
 
 		 692 aa  65.9  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000107078  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3822  Rhs element Vgr protein  24.24 
 
 		 578 aa  65.5  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.112104  normal  0.0443202 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7056  vgrG protein  33.56 
 
 		 741 aa  64.7  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0833871  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0013  Rhs element Vgr protein  25.97 
 
 		 771 aa  64.7  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4488  Rhs element Vgr protein  21.42 
 
 		 702 aa  65.1  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3020  Rhs element Vgr protein  24 
 
 		 738 aa  64.7  0.000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.988422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0163  hypothetical protein  20.38 
 
 		 646 aa  64.7  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.766784  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2513  type VI secretion system Vgr family protein  23.81 
 
 		 682 aa  64.3  0.000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2202  type VI secretion system Vgr family protein  22.07 
 
 		 702 aa  63.9  0.000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0264417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4257  type VI secretion system Vgr family protein  22.48 
 
 		 610 aa  63.9  0.000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0107  Rhs element Vgr protein  20.99 
 
 		 693 aa  63.5  0.000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3254  vgrG protein  26.23 
 
 		 710 aa  63.2  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3035  type VI secretion system Vgr family protein  22.24 
 
 		 683 aa  63.2  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0454  Rhs element Vgr protein  22.64 
 
 		 671 aa  63.5  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69550  hypothetical protein  22.02 
 
 		 680 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.256731  normal  0.401785 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1646  vgrG protein  32.19 
 
 		 800 aa  62.8  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4187  Rhs element Vgr protein  23.85 
 
 		 769 aa  62.8  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43080  hypothetical protein  22.02 
 
 		 680 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000000176027  normal  0.282542 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0250  type VI secretion system Vgr family protein  20.87 
 
 		 794 aa  62.8  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2821  Rhs element protein VgrE  22.6 
 
 		 690 aa  61.6  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7557  vgrG protein  28.79 
 
 		 653 aa  62  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3077  type VI secretion system Vgr family protein  23.21 
 
 		 633 aa  61.6  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0616  type VI secretion system Vgr family protein  23.21 
 
 		 633 aa  62  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0499415  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2696  type VI secretion system Vgr family protein  21.25 
 
 		 615 aa  61.6  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.187576  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2094  Rhs element Vgr protein  23.17 
 
 		 646 aa  61.2  0.00000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.730907  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1183  Rhs element Vgr protein  21.26 
 
 		 694 aa  60.5  0.00000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2332  Rhs element Vgr protein  23.03 
 
 		 741 aa  60.5  0.00000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00996193  normal  0.0126654 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3558  type VI secretion system Vgr family protein  21.68 
 
 		 782 aa  60.5  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.125148  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3719  Rhs element Vgr protein  23.95 
 
 		 723 aa  60.5  0.00000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.331309  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>