More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A0616 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010468  EcolC_2202  type VI secretion system Vgr family protein  94.8 
 
 
702 aa  1049    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0264417  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0616  type VI secretion system Vgr family protein  100 
 
 
633 aa  1320    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0499415  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0245  type VI secretion system Vgr family protein  92.25 
 
 
713 aa  1011    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0649  type VI secretion system Vgr family protein  98.1 
 
 
633 aa  1299    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.823903  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1114  type VI secretion system Vgr family protein  81.23 
 
 
713 aa  946    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0587  type VI secretion system Vgr family protein  99.05 
 
 
633 aa  1307    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0251  type VI secretion system Vgr family protein  91.45 
 
 
713 aa  1013    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.830075 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1638  type VI secretion system Vgr family protein  95.17 
 
 
702 aa  1051    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.674786  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3077  type VI secretion system Vgr family protein  99.84 
 
 
633 aa  1318    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1234  Vgr family type VI secretion system  81.23 
 
 
704 aa  942    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.270466 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2064  type VI secretion system Vgr family protein  91.45 
 
 
702 aa  1013    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.201838  normal  0.0713545 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0243  type VI secretion system Vgr family protein  92.25 
 
 
713 aa  1011    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0339  putative VgrG protein  47.79 
 
 
732 aa  602  1.0000000000000001e-171  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0401  type VI secretion system Vgr family protein  46.64 
 
 
740 aa  566  1e-160  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0328  Rhs element Vgr protein  46.48 
 
 
740 aa  563  1.0000000000000001e-159  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0764  type VI secretion system Vgr family protein  47.86 
 
 
741 aa  560  1e-158  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0696  putative VgrG protein  47.86 
 
 
741 aa  560  1e-158  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3533  type VI secretion system Vgr family protein  43.65 
 
 
725 aa  505  1e-141  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1162  type VI secretion system Vgr family protein  42.08 
 
 
617 aa  489  1e-137  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.754803  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1502  type VI secretion system Vgr family protein  42.08 
 
 
617 aa  487  1e-136  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0418  type VI secretion system Vgr family protein  42.08 
 
 
617 aa  486  1e-136  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0648  type VI secretion system Vgr family protein  40.84 
 
 
609 aa  481  1e-134  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1607  type VI secretion system Vgr family protein  40.66 
 
 
616 aa  479  1e-134  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2559  type VI secretion system Vgr family protein  43.55 
 
 
618 aa  479  1e-134  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0345  type VI secretion system Vgr family protein  42.49 
 
 
619 aa  478  1e-133  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2696  type VI secretion system Vgr family protein  43.58 
 
 
615 aa  478  1e-133  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.187576  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0053  type VI secretion system Vgr family protein  44.34 
 
 
617 aa  474  1e-132  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4257  type VI secretion system Vgr family protein  44.1 
 
 
610 aa  473  1e-132  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2188  type VI secretion system Vgr family protein  43.24 
 
 
656 aa  465  9.999999999999999e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.33539  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2825  type VI secretion system Vgr family protein  43.73 
 
 
678 aa  458  1e-127  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3238  type VI secretion system Vgr family protein  43.35 
 
 
678 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3454  type VI secretion system Vgr family protein  43.24 
 
 
655 aa  455  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0115  vgrG protein  38.84 
 
 
694 aa  439  9.999999999999999e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2151  Rhs element Vgr protein  40.6 
 
 
706 aa  440  9.999999999999999e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2579  Rhs element Vgr protein  39.81 
 
 
687 aa  438  1e-121  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0472026  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2565  Rhs element Vgr protein  39.81 
 
 
687 aa  438  1e-121  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.125293  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3719  Rhs element Vgr protein  40.19 
 
 
723 aa  438  1e-121  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.331309  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2572  Rhs element Vgr protein  39.81 
 
 
687 aa  438  1e-121  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0544876  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1026  vgrG protein  39.9 
 
 
1095 aa  428  1e-118  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2513  type VI secretion system Vgr family protein  37 
 
 
682 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1183  Rhs element Vgr protein  39.26 
 
 
694 aa  416  9.999999999999999e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1194  Rhs element Vgr protein  38.96 
 
 
655 aa  417  9.999999999999999e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1155  type VI secretion system Vgr family protein  41.97 
 
 
706 aa  415  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0542625  normal  0.843476 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1212  Rhs element Vgr protein  38.34 
 
 
699 aa  415  1e-114  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0014  vgrG protein  37.29 
 
 
1017 aa  412  1e-113  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2557  type VI secretion system Vgr family protein  39.44 
 
 
726 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.482945  normal  0.0643046 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3234  type VI secretion system Vgr family protein  41.11 
 
 
722 aa  402  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2371  Rhs element Vgr protein  35.79 
 
 
725 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2117  Rhs element Vgr protein  40.58 
 
 
722 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2614  vgrG protein  38.6 
 
 
722 aa  393  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0110775 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3386  vgrG protein  36.18 
 
 
725 aa  395  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.160309  normal  0.824381 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2858  type VI secretion system Vgr family protein  38.22 
 
 
692 aa  393  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.374803  normal  0.207801 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4049  vgrG protein  38.17 
 
 
771 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.253476  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0838  Rhs element Vgr protein  36.13 
 
 
697 aa  357  2.9999999999999997e-97  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1145  Rhs element Vgr protein  36.71 
 
 
706 aa  351  2e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0650  Rhs element Vgr protein  36.35 
 
 
727 aa  350  3e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0732792  normal  0.0253872 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1248  hypothetical protein  40.28 
 
 
1019 aa  350  4e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.60494  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44900  hypothetical protein  39.16 
 
 
842 aa  347  5e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0151345  normal  0.422437 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03220  hypothetical protein  38.76 
 
 
1019 aa  343  5e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000195826 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0286  Rhs element Vgr protein:Gp5-like  35.36 
 
 
709 aa  329  7e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.856224 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3960  hypothetical protein  35.49 
 
 
689 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0169  hypothetical protein  34.38 
 
 
741 aa  326  9e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3035  type VI secretion system Vgr family protein  34.12 
 
 
683 aa  323  5e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01160  hypothetical protein  34.91 
 
 
741 aa  321  3e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73633  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29390  hypothetical protein  33.14 
 
 
689 aa  319  1e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0241  Rhs element Vgr protein  35.33 
 
 
907 aa  318  2e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3486  Rhs element Vgr protein  35.69 
 
 
774 aa  318  2e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.740933  normal  0.610265 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69550  hypothetical protein  32.61 
 
 
680 aa  317  5e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.256731  normal  0.401785 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1216  type VI secretion system Vgr family protein  33.49 
 
 
683 aa  316  8e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2127  Rhs element Vgr protein  35.33 
 
 
748 aa  316  9e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.519632 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67230  hypothetical protein  33.02 
 
 
790 aa  313  5.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2044  Rhs element Vgr protein  33.02 
 
 
680 aa  312  1e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.909849  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43080  hypothetical protein  32.45 
 
 
680 aa  312  1e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000000176027  normal  0.282542 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01110  hypothetical protein  32.27 
 
 
643 aa  311  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.124023  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3752  Rhs element Vgr protein  34.63 
 
 
755 aa  311  2.9999999999999997e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.617325 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3868  type VI secretion system Vgr family protein  34.01 
 
 
730 aa  310  4e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0373872  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2735  Rhs element Vgr protein  34.61 
 
 
788 aa  310  4e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0298298  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1358  VgrG preotein, VgrG-2  34.2 
 
 
754 aa  310  5.9999999999999995e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0163  hypothetical protein  31.96 
 
 
646 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.766784  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5436  Rhs element Vgr protein  32.71 
 
 
680 aa  308  3e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05870  hypothetical protein  30.48 
 
 
692 aa  305  1.0000000000000001e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_36  VgrG protein, VgrG-2  34.08 
 
 
754 aa  305  1.0000000000000001e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2631  Rhs element Vgr protein  32.92 
 
 
684 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4488  Rhs element Vgr protein  31.27 
 
 
702 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0820  Rhs element Vgr protein  31.68 
 
 
694 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.476122  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2332  Rhs element Vgr protein  33.15 
 
 
741 aa  303  8.000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00996193  normal  0.0126654 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000448  VgrG protein  33.28 
 
 
692 aa  302  1e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000107078  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0107  Rhs element Vgr protein  32.23 
 
 
693 aa  301  2e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2047  Rhs element Vgr protein  33.88 
 
 
572 aa  301  2e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4009  Rhs element Vgr protein  33.88 
 
 
756 aa  301  3e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0849352  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3783  Rhs element Vgr protein  35.01 
 
 
785 aa  300  5e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.757692  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4080  type VI secretion system Vgr family protein  32.85 
 
 
771 aa  295  1e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000279673 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4483  type VI secretion system Vgr family protein  33.64 
 
 
778 aa  295  2e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0250  type VI secretion system Vgr family protein  32.99 
 
 
794 aa  294  3e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0698  type VI secretion system Vgr family protein  33.75 
 
 
792 aa  294  4e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0265  Rhs element Vgr protein  33.27 
 
 
731 aa  294  4e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2888  hypothetical protein  32.99 
 
 
668 aa  293  7e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.882104  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1193  Rhs element Vgr protein  33.09 
 
 
731 aa  291  3e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.598361  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2953  Rhs element Vgr protein  33.09 
 
 
734 aa  291  3e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.527761  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2828  Rhs element Vgr protein  33.09 
 
 
734 aa  290  4e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>