213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3220 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1796  Rhs element Vgr protein  82.88 
 
 		 619 aa  1051    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3220  Rhs element Vgr protein  100 
 
 		 618 aa  1276    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6416  Rhs element Vgr protein  29.34 
 
 		 617 aa  220  7e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5894  Rhs element Vgr protein  28.57 
 
 		 615 aa  215  1.9999999999999998e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0660  hypothetical protein  27.35 
 
 		 605 aa  188  2e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.279373 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3260  Rhs element Vgr protein  26.39 
 
 		 602 aa  180  7e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.386521  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3589  Rhs element Vgr protein  28.96 
 
 		 612 aa  167  5.9999999999999996e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.512863 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4864  Rhs element Vgr protein  26.49 
 
 		 599 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0846936  normal  0.155196 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3931  Rhs element Vgr protein  24.41 
 
 		 616 aa  134  5e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.410968  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4015  Rhs element Vgr protein  25.37 
 
 		 602 aa  131  3e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.211679  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4109  Rhs element Vgr protein  26.11 
 
 		 576 aa  129  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0273732 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3177  Rhs family protein  25.33 
 
 		 697 aa  96.7  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33960  hypothetical protein  20.18 
 
 		 668 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000148732  normal  0.101757 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2888  hypothetical protein  21.21 
 
 		 668 aa  88.2  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.882104  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50870  Rhs element Vgr protein  21.42 
 
 		 668 aa  87  9e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2817  Rhs element Vgr protein  23.16 
 
 		 593 aa  79.3  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01110  hypothetical protein  21.78 
 
 		 643 aa  78.6  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.124023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1663  Rhs element Vgr protein  24.14 
 
 		 589 aa  77.8  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.485896  normal  0.191701 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3415  Rhs element Vgr protein  21.27 
 
 		 669 aa  76.3  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.960838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0838  Rhs element Vgr protein  21.33 
 
 		 697 aa  76.3  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0286  Rhs element Vgr protein:Gp5-like  23.08 
 
 		 709 aa  75.1  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.856224 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2513  type VI secretion system Vgr family protein  21.46 
 
 		 682 aa  75.5  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0163  hypothetical protein  21.35 
 
 		 646 aa  75.1  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.766784  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3778  type VI secretion system Vgr family protein  23.39 
 
 		 796 aa  72  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.938556  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2151  Rhs element Vgr protein  24.08 
 
 		 706 aa  71.6  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3609  Rhs element Vgr protein  21.85 
 
 		 574 aa  71.2  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000128418 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2550  Rhs element Vgr protein  21.95 
 
 		 589 aa  68.2  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3719  Rhs element Vgr protein  23.54 
 
 		 723 aa  68.2  0.0000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.331309  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4080  type VI secretion system Vgr family protein  21.54 
 
 		 771 aa  67.8  0.0000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000279673 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29390  hypothetical protein  20.37 
 
 		 689 aa  67.4  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0345  type VI secretion system Vgr family protein  20.92 
 
 		 619 aa  67  0.0000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1682  Rhs element Vgr protein  22.52 
 
 		 589 aa  66.2  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3868  type VI secretion system Vgr family protein  22.64 
 
 		 730 aa  65.9  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0373872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0648  type VI secretion system Vgr family protein  22.14 
 
 		 609 aa  65.9  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1234  Vgr family type VI secretion system  22.03 
 
 		 704 aa  66.2  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.270466 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1626  Rhs element Vgr protein  24.48 
 
 		 592 aa  65.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0131276 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2094  Rhs element Vgr protein  24.02 
 
 		 646 aa  66.2  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.730907  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0169  hypothetical protein  21.56 
 
 		 741 aa  65.5  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1538  two component LuxR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 621 aa  65.1  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0587  type VI secretion system Vgr family protein  21.49 
 
 		 633 aa  64.7  0.000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1607  type VI secretion system Vgr family protein  21.2 
 
 		 616 aa  64.7  0.000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3482  Rhs element Vgr protein  26.32 
 
 		 675 aa  63.9  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0192027  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5250  Rhs element Vgr protein  22.37 
 
 		 596 aa  63.9  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012293 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0616  type VI secretion system Vgr family protein  21.04 
 
 		 633 aa  63.9  0.000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0499415  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1042  phosphoserine phosphatase SerB  21.47 
 
 		 565 aa  63.9  0.000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1114  type VI secretion system Vgr family protein  22.03 
 
 		 713 aa  63.9  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1638  type VI secretion system Vgr family protein  21.6 
 
 		 702 aa  63.9  0.000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.674786  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0983  hypothetical protein  29.41 
 
 		 218 aa  63.2  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208742  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0696  putative VgrG protein  21.31 
 
 		 741 aa  63.5  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0764  type VI secretion system Vgr family protein  21.31 
 
 		 741 aa  63.5  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01160  hypothetical protein  21.36 
 
 		 741 aa  63.5  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0649  type VI secretion system Vgr family protein  20.9 
 
 		 633 aa  63.5  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.823903  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3238  type VI secretion system Vgr family protein  20.22 
 
 		 678 aa  63.5  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2202  type VI secretion system Vgr family protein  21.6 
 
 		 702 aa  62.8  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0264417  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2825  type VI secretion system Vgr family protein  21.84 
 
 		 678 aa  62.4  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0698  type VI secretion system Vgr family protein  22.08 
 
 		 792 aa  62.8  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2565  Rhs element Vgr protein  22.59 
 
 		 687 aa  62.8  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.125293  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2572  Rhs element Vgr protein  22.59 
 
 		 687 aa  62.8  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0544876  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2579  Rhs element Vgr protein  22.59 
 
 		 687 aa  62.8  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0472026  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0241  Rhs element Vgr protein  21.91 
 
 		 907 aa  62.4  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2696  type VI secretion system Vgr family protein  20.41 
 
 		 615 aa  62.8  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.187576  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3077  type VI secretion system Vgr family protein  20.81 
 
 		 633 aa  62  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2455  Rhs element Vgr protein  24.75 
 
 		 783 aa  62.4  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0279877  normal  0.549341 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3822  Rhs element Vgr protein  22.6 
 
 		 578 aa  62  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.112104  normal  0.0443202 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2064  type VI secretion system Vgr family protein  21.7 
 
 		 702 aa  61.6  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.201838  normal  0.0713545 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4429  Rhs element Vgr protein  22.09 
 
 		 724 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3752  Rhs element Vgr protein  21.7 
 
 		 755 aa  61.6  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.617325 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0243  type VI secretion system Vgr family protein  21.37 
 
 		 713 aa  61.2  0.00000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5436  Rhs element Vgr protein  21.91 
 
 		 680 aa  61.2  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0669  Rhs element Vgr protein  22.88 
 
 		 576 aa  61.6  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3454  type VI secretion system Vgr family protein  21.22 
 
 		 655 aa  60.8  0.00000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0250  type VI secretion system Vgr family protein  20.99 
 
 		 794 aa  60.8  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3783  Rhs element Vgr protein  22.9 
 
 		 785 aa  60.5  0.00000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.757692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6124  type VI secretion system Vgr family protein  20.81 
 
 		 714 aa  60.5  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.029227  normal  0.478766 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3960  hypothetical protein  19.92 
 
 		 689 aa  60.8  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2517  type VI secretion system Vgr family protein  23.69 
 
 		 616 aa  60.5  0.00000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0245  type VI secretion system Vgr family protein  21.15 
 
 		 713 aa  60.1  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1436  Rhs element Vgr protein  26.19 
 
 		 661 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.064161  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2047  Rhs element Vgr protein  21.07 
 
 		 572 aa  59.7  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2188  type VI secretion system Vgr family protein  20.27 
 
 		 656 aa  60.1  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.33539  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3486  Rhs element Vgr protein  21.56 
 
 		 774 aa  60.1  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.740933  normal  0.610265 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4009  Rhs element Vgr protein  21.28 
 
 		 756 aa  60.1  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0849352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0300  type VI secretion system Vgr family protein  20.43 
 
 		 794 aa  59.7  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2332  Rhs element Vgr protein  20.08 
 
 		 741 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00996193  normal  0.0126654 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4483  type VI secretion system Vgr family protein  20.24 
 
 		 778 aa  59.3  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1269  Rhs element Vgr protein  26.67 
 
 		 661 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0412192  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5574  Rhs element Vgr protein  22.35 
 
 		 741 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151496 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0240  Rhs element Vgr protein  26.67 
 
 		 661 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0511  Rhs element Vgr protein  26.67 
 
 		 661 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1401  Rhs element Vgr protein  26.67 
 
 		 661 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764688  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1320  Rhs element Vgr protein  26.67 
 
 		 661 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.249702  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0401  type VI secretion system Vgr family protein  21.51 
 
 		 740 aa  59.3  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1057  Rhs element Vgr protein  26.67 
 
 		 661 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.517121  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0107  Rhs element Vgr protein  23.37 
 
 		 693 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4488  Rhs element Vgr protein  26.34 
 
 		 702 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00256  Rhs-family protein  23.97 
 
 		 645 aa  59.7  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0328  Rhs element Vgr protein  21.51 
 
 		 740 aa  58.5  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2568  Rhs element Vgr protein  26.67 
 
 		 661 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18985  hypothetical protein  20.82 
 
 		 808 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000261066  normal  0.267032 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0251  type VI secretion system Vgr family protein  20.7 
 
 		 713 aa  58.2  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.830075 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>